Cliniquement, le diagnostic de shigellose ne peut être posé qu'en cas de variante colique typique de la maladie. Pour clarifier le diagnostic dans les cas non confirmés par des analyses de laboratoire, une rectoscopie est réalisée. Dans tous les cas de shigellose, elle révèle un tableau de colite (catarrhale, hémorragique ou érosive-ulcéreuse) avec atteinte de la muqueuse du côlon distal, souvent une sphinctérite.
