L'agent causal de la peste est une petite tige fixe, polymorphe, immobilisée, Yersinia pestis de la famille des Enterobacteriaceae du genre Yersinia. A une capsule muqueuse, ne forme pas de spore. Anaérobie facultatif. Il est coloré par des colorants aniline bipolaires (plus intensément sur les bords). Isoler le rat, le ver de terre, le gopher, le vol et les variétés sableuses de bactéries de la peste.