Les symptômes de malabsorption de la vitamine B12 se développent dès les premiers mois de la vie de l'enfant. Ils notent la faiblesse, la pâleur, le retard dans le développement physique, la diarrhée. Après 6-30 mois après le début des premiers symptômes, des troubles neurologiques sont notés: retard mental, neuropathie, myélopathie.