Dans certains cas, plus souvent chez les femmes, la pyélonéphrite aiguë débute par une cystite aiguë (miction fréquente et douloureuse, douleur dans la vessie, hématurie terminale). D'autres symptômes de myélonéphrite aiguë: faiblesse générale, faiblesse, muscle et maux de tête, manque d'appétit, nausée, vomissement.