Le grattage de la cornée est effectué avec une spatule de Kimura, une extrémité recourbée de l'aiguille (pour l'hypoderme) ou une lame. Après l'instillation d'un anesthésique local sans conservateur, les bords et le fond de la lésion (habituellement des ulcères) sont grattés doucement et soigneusement sous le contrôle de la lampe à fente.