Certains types d'hépatite auto-immune ont des raisons clairement établies associées à d'autres agents connus, tels que thiényle acide (diurétique), ou de maladies, comme l'hépatite C et D. En général, il y a un tableau clinique lumineux chez les patients atteints d'une hépatite auto-immune d'étiologie inconnue, pour lui caractérisé par un niveau d'activité élevé de transaminases sériques et de y-globuline; les changements histologiques de tissu hépatique indiquent une activité plus élevée que dans le cas d'étiologies connues, et la réponse au traitement avec des corticostéroïdes meilleurs.