La pyélonéphrite aiguë est un syndrome clinique bien prononcé. Se composant d'un début aigu avec la fièvre, la douleur dans le côté et la tension de muscle dans la nervure et le coin vertébral, associé à la leucocytose, à la leucocyturia et à la bactériurie. Ces symptômes peuvent être accompagnés d'une cystite avec des mictions fréquentes et douloureuses.
