L'atrésie de l'œsophage (Q39.0, Q39.1) est la malformation la plus fréquente au cours de la période néonatale et est diagnostiquée immédiatement après la naissance. Les malformations énumérées ci-dessous se manifestent plus tard, souvent compliquées de pneumonie d'aspiration, d'hypotrophie, d'œsophagite.