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Klebsiella dans l'urine: norme, traitement
Dernière revue: 04.07.2025

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La présence de Klebsiella dans l'urine, détectée lors de tests de laboratoire, n'est pas de bon augure, car l'entérobactérie à Gram négatif Klebsiella spp., étant un micro-organisme opportuniste, peut provoquer de nombreuses maladies graves.
Bien que cette bactérie soit présente en faible quantité dans le microbiote humain, elle est l'une des infections nosocomiales les plus courantes. Elle peut se développer lors d'un traitement hospitalier, colonisant les poumons, la vésicule biliaire et urinaire, le foie, les reins et les intestins. Comme c'est le cas pour toutes les infections opportunistes, Klebsiella manifeste sa pathogénicité de manière plus active chez les personnes immunodéprimées et les patients sévères, ainsi que chez les personnes âgées et les nourrissons.
Selon les études cliniques, les principaux types de Klebsiella – Klebsiella pneumoniae et Klebsiella oxytoca – sont en grande partie responsables de cas d’inflammation sévère des voies urinaires, d’infection secondaire de plaies postopératoires, de pneumonie nosocomiale, de bactériémie, de septicémie et de sepsis.
Étant donné que Klebsiella spp. est très résistante à de nombreuses classes d'agents antimicrobiens, la prescription par les médecins d'un test urinaire pour Klebsiella est un signe clair que les antibiotiques utilisés ne sont pas efficaces.
Klebsiella normale dans l'urine
Les analyses d'urine réalisées lors d'un examen médical sont généralement nécessaires pour établir ou préciser un diagnostic en présence d'une pathologie. Les résultats obtenus doivent être comparés aux valeurs standard moyennes observées chez les personnes en bonne santé. Ainsi, la dose infectieuse exacte de Klebsiella spp. étant actuellement inconnue, la norme de Klebsiella dans les urines, très conditionnelle, respectée en diagnostic clinique, ne devrait pas dépasser 102-105 UFC par millilitre d'urine.
L'UFC est une unité formant colonie que les microbiologistes utilisent pour quantifier les résultats (numération bactérienne) d' un examen bactériologique des sédiments urinaires.
La définition d'une infection urinaire en cas de bactériurie significative repose sur la présence de Klebsiella dans les urines (principalement des espèces Klebsiella pneumoniae et Klebsiella oxytoca) – en quantités supérieures à 100 000 unités formant colonie par millilitre, soit plus de 10 5 (10 5) UFC/ml d'urine. Cette valeur a été choisie en raison de sa grande spécificité pour le diagnostic d'une véritable infection, même en l'absence de symptômes. Cependant, plusieurs études ont montré que plus de 50 % des femmes souffrant d'une inflammation de la vessie présentent un taux d'UFC inférieur.
Chez les hommes, le niveau minimum de Klebsiella dans l’urine indiquant une infection urinaire est de 103 UFC/ml, et dans le cas d’une utilisation à long terme d’un cathéter, il ne dépasse pas 102 UFC/ml.
Klebsiella pneumoniae dans l'urine
Dans les études en laboratoire, K. pneumoniae peut être isolé du sang, du liquide pleural, des exsudats de plaies et également à partir de tests nasopharyngés (écouvillons nasopharyngés).
Mais Klebsiella pneumoniae est plus souvent retrouvée dans les urines. Si l'organisme est affaibli par une maladie ou une immunité affaiblie et devient plus sensible aux agents pathogènes, le risque de développer:
- - cystite aiguë non compliquée;
- - cystite récurrente (chez les jeunes femmes avec un taux de K. pneumoniae de 100 UFC/ml);
- - infection urinaire compliquée (IU), Klebsiella dans l'urine à un niveau de 103 UFC/ml et plus;
- - cystite aiguë chez l’homme jeune (102-103 UFC/ml);
- - pyélonéphrite aiguë (105 UFC/ml ou plus).
Klebsiella oxytoca dans l'urine
Klebsiella oxytoca – Klebsiella oxytoca peut également être présente dans l’urine, mais elle n’est presque jamais isolée séparément.
Les colonies de cette espèce de Klebsiella spp. peuvent être trouvées presque partout, mais Klebsiella oxytoca préfère coloniser la surface de la peau, la muqueuse du nasopharynx et du côlon.
Bien que cette bactérie provoque moins de pathologies que Klebsiella pneumoniae, elle représente jusqu'à 8 % de toutes les infections bactériennes en Europe et en Amérique du Nord.
Klebsiella planticola dans l'urine
Klebsiella planticola n'est pas détecté dans l'urine ou d'autres matériaux cliniques à des fins de diagnostic.
Initialement, K. planticola, décrite en 1981, était exclusivement présente dans les milieux aquatiques, botaniques et terrestres. En 1983, la bactérie a été décrite sous le nom de Klebsiella trevisanii, puis en 2001 sous celui de Raoultella planticola. À ce jour, on ignore tout de l'expression de ses facteurs de virulence, ni de sa capacité à coloniser les tissus et organes humains.
Cependant, selon un article paru dans le Journal of Clinical Microbiology, une étude récente a identifié K. planticola dans des prélèvements pharyngés et rectaux de nouveau-nés. La microflore endogène étant considérée comme la principale source d'infections néonatales à Klebsiella, des études plus approfondies sur cette bactérie sont clairement justifiées.
Klebsiella dans l'urine chez l'adulte
En plus de la bactériémie, Klebsiella dans l'urine des adultes en quantités dépassant la valeur d'analyse de 100-105 UFC/ml provoque des lésions infectieuses du système urinaire et des voies urinaires.
Chez l’homme, des taux de Klebsiella dans l’urine qui s’élèvent à plus de 1 000 UFC/ml sont révélateurs d’une infection des voies urinaires, avec une sensibilité et une spécificité de 97 %.
Klebsiella est la deuxième cause d’infection des voies urinaires chez les personnes âgées, après Escherichia coli.
Les symptômes cliniques qui apparaissent lorsque la vessie est affectée sous la forme d'une cystite aiguë et d'une pyélonéphrite comprennent:
- dysurie avec augmentation de la fréquence des mictions;
- besoin impérieux d'uriner avec une petite quantité d'urine excrétée;
- une sensation de brûlure en urinant et des douleurs aiguës au niveau du périnée et du bas-ventre;
- douleur sourde et lancinante dans la région lombaire;
- miction avec du sang (hématurie);
- l'apparition d'impuretés purulentes dans les urines (pyurie).
Des symptômes systémiques tels que fièvre et frissons indiquent généralement une pyélonéphrite ou une prostatite concomitante.
La présence de Klebsiella dans les urines pendant la grossesse, avec un taux de colonisation supérieur à 105 UFC/ml, provoque les mêmes symptômes. À un taux supérieur à 103 UFC/ml, une bactériurie asymptomatique est observée.
Klebsiella dans l'urine d'un enfant
Selon les statistiques des microbiologistes cliniques étrangers, les causes les plus fréquentes d'infections urinaires chez les enfants sont Escherichia coli (plus de 62 %), suivies de Klebsiella (23 %). Viennent ensuite Proteus mirabilis (7 %), Citrobacter (5,4 %), Staphylococcus saprophyticus (1,3 %) et Candida albicans (0,4 %). De plus, E. coli est la cause la plus fréquente d'infections urinaires chez les enfants de tous âges, et en cas de pathologies urinaires chez les nouveau-nés, Klebsiella est détectée dans les urines de l'enfant dans 42,8 % des cas.
Il est également à noter que chez les enfants de moins de trois mois présentant une température supérieure à +38 °C – en l'absence de source d'infection évidente –, il est obligatoire de réaliser un test urinaire de dépistage de Klebsiella planticola. Il faut également tenir compte de l'indicateur de présence de cette bactérie de 50 000 UFC/ml, bien que les critères stricts de comptage des colonies soient opérationnels et non absolus.
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Traitement Klebsiella dans l'urine
Le traitement des infections urinaires causées par Klebsiella spp. repose sur des antibiotiques. Le choix du médicament, du mode d'administration et de la posologie, en tenant compte des contre-indications, est du ressort du médecin.
Les adultes et les enfants sont traités contre Klebsiella avec: Augmentin, Lévofloxacine, Amoxicilline + Acide clavulanique, Amikacine, Ciprofloxacine, Céfuroxime, Nitrofurantoïne monohydratée, Doxycycline monohydratée, Fosfomycine.
Les infections urinaires symptomatiques compliquent 1 à 2 % des grossesses, généralement chez les femmes présentant une bactériurie persistante. En cas de pyélonéphrite, la plupart des femmes enceintes doivent être traitées par antibiotiques. Les tétracyclines et les fluoroquinolones sont à éviter pendant la grossesse. Pour en savoir plus sur les antibiotiques utilisables, consultez la rubrique « Céphalosporines pendant la grossesse ».