Examen bactérioscopique du sédiment urinaire

La bactériurie est la détection de bactéries dans les urines. L'examen bactérioscopique des urines fournit peu d'informations cliniques pour le diagnostic des infections urinaires; des méthodes de culture sont donc utilisées. Ces dernières permettent non seulement d'identifier le type d'agent pathogène, mais aussi de déterminer la numération bactérienne (nombre d'agents pathogènes dans 1 ml d'urine). La bactériurie asymptomatique est la détection d'au moins 10 ⁵ corps microbiens du même micro-organisme dans 1 ml d'urine lors de deux analyses consécutives effectuées à plus de 24 heures d'intervalle. Selon les « Recommandations de l'Association européenne des urologues pour le traitement des infections urinaires et des infections de l'appareil reproducteur chez l'homme », une bactériurie cliniquement significative chez l'adulte est considérée comme:

• ≥10 ³ corps microbiens dans 1 ml d’urine en milieu de jet chez les femmes atteintes de cystite aiguë non compliquée;
• >10 ⁴ corps microbiens dans 1 ml d’urine en milieu de jet chez les femmes atteintes de pyélonéphrite aiguë non compliquée;
• >10 ⁵ corps microbiens dans 1 ml d’urine du milieu du jet chez la femme ou >10 ⁴ corps microbiens dans 1 ml d’urine du milieu du jet chez l’homme (ou dans l’urine obtenue à l’aide d’un cathéter chez la femme) en cas d’infection urinaire compliquée (cystite aiguë et pyélonéphrite);
• toute quantité de bactéries dans l'urine obtenue par ponction sus-pubienne de la vessie.

L'analyse d'urine avec détermination de la numération bactérienne n'est pas obligatoire chez les femmes atteintes de cystite non compliquée. Elle est indiquée, en association avec la détermination de la sensibilité des agents pathogènes isolés aux antibiotiques, si les symptômes de la cystite persistent ou réapparaissent pendant deux semaines. Une analyse d'urine doit être réalisée chez les patientes atteintes de pyélonéphrite aiguë.

Le diagnostic bactériologique des infections urinaires chez la femme enceinte présente des caractéristiques particulières. La plupart des femmes développent une bactériurie avant la grossesse. Une pyélonéphrite aiguë survient chez 20 à 40 % des femmes présentant une bactériurie asymptomatique pendant la grossesse. La fréquence des faux positifs après une seule culture urinaire de la partie moyenne peut atteindre 40 %. Par conséquent, toutes les femmes dont la culture urinaire est positive doivent subir une nouvelle culture urinaire après 1 à 2 semaines, en accordant une attention particulière à la toilette des organes génitaux externes avant la miction. Une fois le traitement terminé, une culture urinaire est réalisée après 1 à 4 semaines, puis à nouveau avant l'accouchement.

Chez l’enfant, le diagnostic d’infection urinaire repose sur les critères suivants.

• Lors du semis d'urine à partir d'un collecteur d'urine, seul un résultat négatif est considéré comme significatif.
• Détection d'un nombre quelconque de bactéries dans l'urine obtenue par ponction sus-pubienne de la vessie.
• Détection de staphylocoques à coagulase négative dans les urines en quantités > 300 UFC/ml.
• Détection de bactéries dans l'urine obtenue à l'aide d'un cathéter à raison de 10 ⁴ -10 ⁵ UFC/ml.
• Dans les analyses d'urine en milieu de jet: détection d'agents pathogènes en quantités de 10 ⁴ UFC/ml chez les patients présentant des symptômes d'infection urinaire ou de 10 ⁵ UFC/ml dans 2 échantillons d'urine prélevés à plus de 24 heures d'intervalle chez les enfants sans symptômes d'infection urinaire.
• Pyurie significative; la détection de 10 leucocytes/ml d'urine en combinaison avec des numérations bactériennes de 10 ⁵ -10 ⁴ UFC/ml dans l'urine sondée chez les enfants fébriles permet un diagnostic différentiel entre infection et contamination.
• La détection de la N-acétyl-bêta-glucosaminidase dans l'urine est un marqueur de lésion tubulaire rénale; sa teneur augmente également avec le reflux vésico-urétéral.

Pour détecter les mycobactéries de la tuberculose dans l'urine, une étude bactérioscopique est réalisée avec coloration des frottis à partir du sédiment selon Ziehl-Neelsen.

La détection de bacilles tuberculeux dans les urines est le signe le plus fiable de tuberculose rénale. Pour exclure une tuberculose prostatique chez l'homme, la détection de bacilles tuberculeux dans les urines doit être considérée comme une indication de la présence d'au moins de petits foyers « subcliniques » de tuberculose dans le rein. Si une tuberculose rénale est suspectée, mais que l'examen bactérioscopique est négatif, un examen bactériologique des urines est nécessaire, avec triple ensemencement pour Mycobacterium tuberculosis.

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