La période aiguë de la schistosomiase urogénitale coïncide avec la pénétration des cercaires dans l'hôte et la migration des schistosomes à travers les vaisseaux sanguins. Dans cette période, au stade de l'introduction des cercaires, on note les vaisseaux de la peau, les rougeurs, la fièvre, les démangeaisons et le gonflement de la peau. Ces phénomènes se produisent après 3-4 jours.