Quels sont les types et les dangers des bactéries dans l'urine?

Aujourd'hui, la question de la dangerosité des bactéries dans l'urine est de plus en plus souvent posée. Faut-il les trouver? L'urine est considérée comme un liquide biologique stérile, donc normalement exempt de bactéries. Or, on en trouve souvent. Il s'agit d'un signe de pathologie, qui peut constituer un critère diagnostique important, permettant d'établir un diagnostic.

Pourquoi les bactéries présentes dans l’urine sont-elles dangereuses?

Les patients se posent souvent la question: « Quel est le danger des bactéries dans les urines? » Il est essentiel de savoir que normalement, les urines sont exemptes de bactéries. Leur présence indique donc une inflammation et le développement d'un processus infectieux. Ce phénomène est dangereux, car l'infection progresse et provoque de graves lésions des reins et de l'appareil génito-urinaire. L'inflammation chronique est dangereuse, tout comme les conséquences et complications possibles, telles que la formation de nouveaux foyers d'infection, la pénétration de l'infection dans l'appareil reproducteur, le développement de maladies gynécologiques et urologiques, souvent responsables d'infertilité, ou encore des problèmes pendant la grossesse et l'accouchement. [ 1 ]

Cylindres dans l'urine et bactéries

La présence de cylindres et de bactéries dans l'échantillon d'urine d'un patient peut indiquer le développement d'une pathologie du système urinaire et des reins. Il est donc essentiel de déterminer précisément le nombre et le genre de bactéries détectées. Il est également important de déterminer le type de cylindres, car différents types de cylindres indiquent différents types de pathologie. Normalement, les cylindres sont absents; en cas de pathologie, ils sont détectés lors d'un examen microscopique du sédiment urinaire. Le plus souvent, les cylindres sont des dérivés de structures cellulaires ou protéiques de l'organisme et apparaissent dans l'urine suite à la destruction de ces structures.

Par exemple, la détection de cylindres hyaluroniques peut indiquer une pathologie rénale, la décomposition de composants protéiques suite à une intoxication, une exposition à des températures élevées (fièvre prolongée, forte augmentation de la température corporelle). On les observe souvent en cas de grossesse, d'intoxication, de maladies infectieuses graves, de néphropathie et d'insuffisance rénale. [ 2 ]

Les cylindres cireux sont principalement constitués de globules rouges et apparaissent lorsque des éléments sanguins pénètrent dans les urines. Ils peuvent par exemple être le signe d'un rejet rénal, d'une anémie, d'une lésion des globules rouges, d'une amylose, dans de nombreuses pathologies rénales chroniques et troubles de la circulation rénale.

L'apparition de cylindres de globules rouges indique une hémorragie rénale ouverte. Les cylindres cireux et les cylindres de globules rouges sont similaires; il est important de les différencier avec précision.

Les cylindres épithéliaux et leucocytaires indiquent le développement d'un processus inflammatoire, une épithélialisation puissante et sont moins souvent un signe d'empoisonnement par des sels de métaux lourds.

Les cylindres granuleux sont un phénomène défavorable. Ils peuvent être le signe d'un syndrome néphrotique, d'une désintégration des structures cellulaires et tissulaires, ou indiquer des processus dégénératifs sévères, une insuffisance rénale. Ils indiquent souvent l'irréversibilité des processus. [ 3 ]

Bactéries et urates dans l'urine

La détection de bactéries et d'urates dans l'urine humaine peut indiquer une acidification de l'urine, c'est-à-dire un environnement acide. Cela signifie qu'elle contient une grande quantité de sels acides. Ce phénomène est souvent observé en cas de forte fièvre ou de fièvre prolongée, avec une chute de température d'un niveau critique à un niveau élevé, et en cas de diverses maladies infectieuses touchant les reins, et s'accompagne également d'hyperthermie. L'urate apparaît souvent en cas de goutte, d'hypovolémie, accompagnée de diarrhée et de vomissements. Il peut également être le signe d'une déshydratation sévère. De plus, l'urate est également fréquemment détecté en cas de brûlures thermiques étendues, lorsque la thermorégulation est significativement altérée et que les fonctions protectrices et excrétrices de la peau sont réduites. La présence d'urate dans les urines peut être diagnostiquée après une radiothérapie intensive ou un traitement cytostatique, utilisé dans le traitement de la leucémie et des tumeurs malignes. [ 4 ]

L'urate est un petit grain pigmenté qui prend généralement une teinte rouge brique et colore l'urine de la couleur correspondante. Dans ce cas, un environnement acide se forme. La microflore se modifie alors radicalement: les représentants de l'environnement normal meurent, le nombre de bactéries acidophiles, c'est-à-dire celles qui vivent en milieu acide et consomment des acides comme substrat nutritif, augmente fortement. Cela contribue au développement de processus inflammatoires, à l'irritation des muqueuses et à l'apparition de dysbactérioses.

Types de bactéries dans l'urine

Tout d'abord, il est important de comprendre qu'il n'existe généralement pas un seul type de bactérie présent dans l'urine. En pathologie, on peut en trouver une grande variété.

Il est important de distinguer la nature de la microbiocénose. Tous les types de bactéries présentes dans l'urine peuvent être divisés en trois sous-groupes: la microflore transitoire, la microflore résidente et la microflore obligatoire. La microflore transitoire est une bactérie qui a pénétré l'urine par hasard et n'est pas permanente dans les voies urinaires. Il peut s'agir d'une microflore introduite accidentellement à partir d'autres foyers d'infection, provenant d'autres biotopes. Ce dernier cas est particulièrement fréquent chez les femmes. Par exemple, la microflore vaginale pénètre dans l'urine en raison de la proximité anatomique des appareils génito-urinaire et reproducteur. Cela inclut également les infections des organes génitaux externes dues à une mauvaise hygiène des toilettes, ou encore la collecte d'urine dans des récipients non stériles. [ 5 ]

Habituellement, deux facteurs indiquent une microflore transitoire:

1. Des espèces bactériennes non typiques du système génito-urinaire ont été détectées dans l’urine.
2. le nombre de micro-organismes est insignifiant (il peut s'agir d'une ou de plusieurs colonies individuelles).

Si une microflore transitoire est détectée ou suspectée, il est recommandé de réaliser une nouvelle étude pour confirmer ou infirmer le diagnostic.

La microflore transitoire comprend le plus souvent divers types d'infections fongiques, notamment des champignons de type levure du genre Candida. Il s'agit notamment de Proteus vulgarus, Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp., de divers représentants de la microflore vaginale, cervicale et urétrale, d'agents pathogènes de maladies sexuellement transmissibles, et plus rarement d'agents pathogènes du tétanos, de micro-organismes du sol et de divers types d'infections anaérobies.

La microflore résidente est constituée des micro-organismes qui peuplent normalement le tractus urogénital. Il s'agit de divers représentants de la microflore humaine normale. Il convient de parler de micro-organismes opportunistes, car normalement (en quantité optimale, ne dépassant pas la norme), ces micro-organismes assurent une fonction protectrice, empêchant le développement de maladies du tractus urogénital. Ceci est rendu possible grâce à la résistance à la colonisation des muqueuses, résultant du fonctionnement de la microflore opportuniste. La présence d'une microflore normale empêche la pénétration de microflores pathogènes et protège ainsi contre diverses maladies.

Cependant, dans certaines conditions, la microflore opportuniste et normale peut elle-même provoquer une maladie, car sa population augmente fortement. Une telle situation peut survenir en cas d'immunité réduite, après une antibiothérapie récente, une chimiothérapie ou une radiothérapie, dans le contexte d'immunodéficiences de gravité variable, avec dysbiose et dysbactériose. La microflore résidente comprend divers types de staphylocoques, streptocoques, E. coli, entérocoques, Klebsiella, divers types de bacilles et vibrions. Le plus souvent, il s'agit d'une microflore aérobie à Gram positif. Lors de l'identification d'une microflore transitoire, la valeur diagnostique ne réside pas tant dans ses caractéristiques qualitatives que dans ses indicateurs quantitatifs. [ 6 ]

La microflore obligatoire est constituée de micro-organismes pathogènes normalement absents du corps humain, principalement du système génito-urinaire. Il s'agit de pathogènes responsables de maladies inflammatoires et infectieuses, de bactériémies et de sepsis. Elle comprend une grande variété de micro-organismes Gram-négatifs et Gram-positifs, aérobies et anaérobies. Les micro-organismes acidophiles, présents dans l'urine à acidité élevée, sont également fréquents. Il peut s'agir de divers types d'infections génito-urinaires et vénériennes, de représentants du groupe intestinal, de mycobactéries, d'urobactéries, de chlamydia, de rickettsies, de prions, de spitochètes et même de bactéries responsables de la tuberculose.

Bactéries E. coli dans l'urine

La bactérie E. coli n'est normalement pas présente dans l'urine. Escherichia coli n'est rien d'autre qu'un bâtonnet intestinal, représentant normalement la microflore intestinale normale. Sa présence peut être observée dans l'urine lors de certains processus inflammatoires et infectieux. La pénétration du bâtonnet intestinal dans des biotopes qui ne lui sont pas typiques, par exemple dans l'appareil génito-urinaire, provoque un processus inflammatoire. Il est donc important de déterminer des indicateurs quantitatifs. Plus le degré de contamination bactérienne est élevé, plus le processus inflammatoire est grave. Si la concentration détectée est supérieure à 10 ⁴ UFC/ml, une antibiothérapie est nécessaire. [ 7 ]

La bactérie E. coli peut également se retrouver accidentellement dans l'urine, par exemple lors de l'utilisation de toilettes inadaptées et de la contamination des selles, ou lors du recueil d'urine dans un récipient sale (microflore transitoire). Dans ce cas, seuls des micro-organismes sont détectés. Un grand nombre de ces bactéries indique souvent un processus pathologique et nécessite un traitement. Si des colonies isolées de micro-organismes sont détectées, l'analyse doit être répétée. [ 8 ], [ 9 ]

Bactéries Klebsiella dans l'urine

Selon le type exact de Klebsiella détecté dans l'urine, la source exacte de pénétration de cette bactérie dans l'organisme peut être déterminée. Klebsiella est souvent représentative de la microflore normale du tractus urogénital, des intestins ou du système respiratoire. Une détection supérieure à 10 ⁴ UFC/ml indique le développement d'un processus inflammatoire et infectieux intense. Le risque de bactériémie et de septicémie augmente fortement. Dans la plupart des cas, une antibiothérapie est nécessaire.

Les bactéries du genre Klebsiella peuvent être trouvées dans l'urine principalement dans les pathologies des reins, de la vessie, de la cystite, de la pyélonéphrite et d'autres processus inflammatoires, ainsi que dans les cas d'immunité réduite, après une antibiothérapie, un traitement par uroseptiques, après des opérations sur le système génito-urinaire, après de nombreuses maladies infectieuses et même des rhumes.

Bactéries Proteus dans l'urine

La présence de Proteus dans les urines peut indiquer des processus inflammatoires. Proteus est un représentant normal de la microflore urogénitale. Normalement, on n'en trouve pas plus de 10 ³ UFC/ml dans le système génito-urinaire (sur les muqueuses). Un dépassement de ces paramètres indique le développement d'une inflammation, ainsi qu'une diminution des mécanismes de protection et de compensation des muqueuses. Une situation similaire est souvent observée en cas de dysbactériose, ainsi que chez les femmes atteintes de maladies gynécologiques. Le manque d'hygiène personnelle, en particulier pendant les règles, peut entraîner une augmentation du nombre de ces micro-organismes. Un dépassement de la norme nécessite une antibiothérapie. [ 10 ], [ 11 ]

P. mirabilis est capable de provoquer des infections urinaires symptomatiques, notamment des cystites et des pyélonéphrites, et est présent dans les cas de bactériurie asymptomatique, en particulier chez les personnes âgées et les patients atteints de diabète de type 2.[ 12 ],[ 13 ] Ces infections peuvent également entraîner une bactériémie et évoluer vers une urosepsis potentiellement mortelle. De plus, les infections à P. mirabilis peuvent provoquer la formation de calculs urinaires (lithiase urinaire).

Français P. mirabilis est fréquemment isolé du tractus gastro-intestinal, bien que le fait qu'il s'agisse d'un organisme commensal, pathogène ou transitoire soit quelque peu controversé. On pense que la plupart des infections des voies urinaires (IVU) à P. mirabilis résultent de l'excrétion de la bactérie à partir du tractus gastro-intestinal, tandis que d'autres résultent d'une transmission interhumaine, en particulier dans les établissements de soins de santé.[ 14 ] Ceci est étayé par des preuves selon lesquelles certains patients atteints d'IVU à P. mirabilis ont la même souche de P. mirabilis dans leurs selles, tandis que d'autres n'ont pas P. mirabilis dans leurs selles.[ 15 ] En plus de l'infection des voies urinaires, cette espèce peut également provoquer une infection des voies respiratoires, des yeux, des oreilles, du nez, de la peau, de la gorge, des brûlures et des plaies, et a été associée à la méningo-encéphalite néonatale, à l'empyème et à l'ostéomyélite. [ 16 ] Plusieurs études ont établi un lien entre P. mirabilis et la polyarthrite rhumatoïde, bien que d'autres n'aient pas réussi à établir de lien (voir les revues dans [ 17 ] et [ 18 ]). On pense que les anticorps dirigés contre les enzymes hémolysine et uréase sont ensuite capables de reconnaître les autoantigènes ciblés chez les patients atteints de polyarthrite rhumatoïde.

Bactéries cocci dans l'urine

La présence de cocci dans les urines peut être considérée comme un signe de pathologie, car l'urine devrait normalement être stérile. Les cocci sont des bactéries de forme ronde (staphylocoques, streptocoques, entérocoques, pneumocoques, etc.). La présence de cocci, comme celle de toute autre bactérie dans les urines, ne signifie qu'une chose: le développement d'un processus pathologique dans l'organisme. Il s'agit tout d'abord d'un processus inflammatoire, qui s'accompagne du développement d'une infection bactérienne. [ 19 ]

Lorsque des cocci sont détectés, il est important de les identifier (déterminer le nom exact de l'espèce de micro-organisme) et de déterminer des indicateurs quantitatifs. Connaître le nombre de cocci retrouvés dans les urines permet d'évaluer la gravité du processus infectieux, de tirer des conclusions et des pronostics, et de choisir le traitement approprié. [ 20 ]

Il est impossible de répondre définitivement à la question de la cause de l'apparition de cocci dans les urines (du moins sans diagnostic précis et complet). Cela s'explique par la grande diversité des causes. [ 21 ]

Bactéries Enterococcus dans l'urine

Les bactéries Enterococcus peuvent être détectées dans les urines. Plus précisément, il convient de préciser que des représentants du genre Enterococcus ont été détectés, car ce nom générique regroupe un grand nombre de bactéries apparentées. Normalement, ces bactéries sont représentatives de la microflore intestinale normale et, lorsqu'elles pénètrent dans l'appareil génito-urinaire, elles favorisent le développement d'un processus infectieux. Les entérocoques peuvent pénétrer dans l'urine de plusieurs manières. Le plus souvent, il s'agit d'une auto-infection ou d'une infection d'origine externe. L'auto-infection doit être comprise comme une source d'infection localisée dans l'organisme. À partir de là, un processus inflammatoire et infectieux se développe. Il peut s'agir d'une infection chronique des voies urinaires, des reins, de l'appareil reproducteur, d'infections génito-urinaires latentes, actives ou chroniques, ou de maladies vénériennes. [ 22 ]

En cas d'infection d'origine externe, l'infection pénètre dans l'organisme à partir de l'environnement. Elle peut pénétrer accidentellement dans l'urine, par exemple avec les selles, ou en cas de toilette insuffisante avant de recueillir l'urine pour analyse. Chez la femme, l'infection est souvent due à la pénétration de l'infection par les organes génitaux (des organes génitaux externes, l'infection remonte jusqu'au système génito-urinaire, constituant la principale source d'infection). Dans certains cas, la détection de représentants de la microflore intestinale dans l'urine peut indiquer des maladies proctologiques et être le signe d'une fistule rectovaginale chez la femme, où le contenu de l'intestin pénètre dans le vagin et le système génito-urinaire. Une fistule se caractérise par une ouverture (à travers la fistule) dans la cloison rectovaginale, séparant l'intestin (rectum) du vagin et du système urinaire. [ 23 ]

Dans l'urine, bactéries +, ++, +++

Dans les résultats d'analyse, il est nécessaire de déterminer non seulement la présence de bactéries dans l'urine, mais aussi leur quantité approximative. La quantité exacte (valeur numérique spécifique exprimée en UFC/ml) ne peut être déterminée que lors d'une étude bactériologique spécifique, au cours de laquelle l'urine est ensemencée sur des milieux nutritifs spéciaux, puis le pathogène est isolé et identifié. Lors d'une analyse clinique classique, seul le degré conditionnel de bactériémie est indiqué. Ainsi, les bactéries présentes dans l'urine sont désignées par les signes +, ++ et +++. Le signe + indique une quantité insignifiante de bactéries dans l'urine. Il peut s'agir de bactéries isolées. Le signe ++ indique une quantité modérée, supérieure aux valeurs normales, et peut être le signe d'une infection. Le signe +++ peut indiquer un processus inflammatoire et infectieux intense de l'appareil génito-urinaire, et nécessite des diagnostics complémentaires et un traitement obligatoire. De plus, dans certaines classifications, le signe ++++ est distingué, indiquant un processus infectieux grave, une bactériémie ou une septicémie. [ 24 ]

Bactéries dans l'urine en quantités modérées

Bien que les résultats des tests puissent indiquer le signe ++, indiquant la présence de bactéries dans les urines en quantité modérée, une telle formulation est erronée et peu informative. Cela ne peut qu'indiquer la nécessité d'un diagnostic approfondi. Il est nécessaire de réaliser une étude bactériologique et de vérifier la stérilité des urines. Ces analyses de laboratoire permettront de déterminer la quantité exacte de micro-organismes présents dans les urines. Il est également important d'identifier les micro-organismes et de déterminer l'espèce exacte de l'agent pathogène. Cela permettra de choisir le traitement approprié.

Quantité importante de bactéries dans l'urine

Si un nombre significatif de bactéries est détecté dans les urines (notation +++ ou ++++ dans les résultats de l'OAM), des diagnostics complémentaires doivent être effectués. Lors de ces diagnostics, il est nécessaire de déterminer le type de micro-organisme et sa quantité exacte, exprimée en UFC/ml. Ceci permet d'établir un diagnostic précis et de prescrire un traitement adapté. Il est également important de prendre en compte l'état actuel du patient, le tableau clinique de la pathologie et les symptômes. Si un nombre significatif de bactéries est détecté dans les urines, une évolution latente de la pathologie est presque totalement exclue. La personne présentera des symptômes prononcés d'un processus inflammatoire et infectieux. Plus précisément, les symptômes dépendent des bactéries détectées dans les urines (différentes bactéries provoquent des tableaux pathologiques différents).

Des symptômes tels que des troubles urinaires, des envies fréquentes ou fausses d'uriner, des douleurs, des picotements, des brûlures et une gêne sont souvent présents. La douleur s'intensifie la nuit et peut s'intensifier brutalement lors des mouvements.

Complications et conséquences

Les conséquences et les complications peuvent être très graves. La présence de bactéries dans les urines indique toujours le développement d'une inflammation, un processus infectieux. L'infection nécessite un traitement; elle ne disparaît jamais spontanément. Sans traitement, le risque de septicémie et de bactériémie, ainsi que d'insuffisance rénale, de cirrhose et de nécrose, est élevé. Des conséquences moins graves sont le développement d'une infection chronique, accompagnée d'exacerbations et de rechutes périodiques, et pouvant également provoquer diverses inflammations de l'appareil génito-urinaire, allant de la cystite à la néphrite, en passant par la pyélonéphrite, la glomérulonéphrite et la néphropathie. [ 25 ]

Tout aussi dangereuse est l'infection latente, foyer d'infection pouvant migrer vers d'autres biotopes, comme les métastases des tumeurs cancéreuses. Une infection urinaire non complètement guérie peut entraîner des troubles de la reproduction, notamment l'infertilité et l'incapacité à concevoir et à porter un enfant. Chez la femme, une infection urinaire peut provoquer des avortements et des fausses couches, des naissances prématurées et même une infection intra-utérine du fœtus. Un traitement est donc indispensable, allant souvent jusqu'à une hospitalisation dans un service spécialisé. Plus le traitement est précoce, plus le résultat sera efficace et rapide. Il est important de commencer le traitement à temps.