Analyse des selles pour la recherche de protozoaires

La détection et la différenciation des protozoaires dans l'analyse des selles (distinguer les formes pathogènes des formes non pathogènes) est une tâche assez complexe. La plupart des organismes unicellulaires présents dans les selles se présentent sous deux formes: végétative (stade trophozoïte) – active, mobile, vitale, facilement sensible aux effets nocifs (notamment le refroidissement) et mourant donc rapidement après leur excrétion intestinale; et sous forme de kystes (oocystes) résistants aux influences extérieures. Dans les selles formées, les protozoaires ne sont généralement présents qu'à l'état enkysté; pour détecter les formes végétatives, il est nécessaire d'examiner les selles encore chaudes. En effet, dans les selles refroidies, les formes végétatives des protozoaires meurent rapidement et, une fois mortes, sont rapidement soumises à l'action des enzymes protéolytiques, ce qui leur fait perdre leurs caractéristiques structurelles. De plus, lors du refroidissement, la mobilité des protozoaires diminue puis disparaît, ce qui constitue un facteur auxiliaire important dans leur différenciation.

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Types de parasites dans les selles

Les principaux types de parasites et les meilleures méthodes pour les détecter

Type de parasite	Organes fréquemment touchés	Méthode de diagnostic
Leishmania donovani	Rate, foie, ganglions lymphatiques	Détection de parasites dans les ponctions de la rate, du foie, de la moelle osseuse, de la peau affectée, détection d'anticorps spécifiques dans le sang
Trypanosoma rhodesiense et T. gambiense	Ganglions lymphatiques et cerveau	Détection de parasites dans la peau affectée, les ganglions lymphatiques et le liquide céphalo-rachidien
Echinococcus granulosus ou Echinococcus multilocularis	Foie, poumons, cerveau	Détection d'anticorps spécifiques dans le sang
Schistosoma haematobium, S. mansoni, S. japonicum, etc.	Voies urinaires, foie, veine porte	Détection d'œufs de parasites dans l'urine, les selles, la biopsie rectale, le tissu hépatique ou des anticorps spécifiques dans le sang
Fasciola hépatique	Foie	Détection d'œufs de parasites dans les selles ou d'anticorps spécifiques dans le sang
Clonorchis sinensis, Opisthorchis felineus, Opisthorchis viverrini	Système biliaire	Détection d'œufs de parasites dans les selles ou la bile
Trichostrongylus capricola, T. vitrinus	Intestin grêle	Détection d'œufs de parasites dans les selles
Echinostoma ilocanum	Intestin grêle	Détection d'œufs de parasites dans les selles
Angiostrongylus costaricensis	Intestin grêle et gros intestin	Détection des œufs Dans la biopsie intestinale
Dipylidum caninum	Intestin grêle et gros intestin	Détection d'œufs de parasites ou de selles ingérées

Il existe 20 espèces de protozoaires (8 pathogènes et opportunistes et 12 commensaux) détectables dans les selles. Les protozoaires intestinaux vivent dans l'intestin grêle ou le côlon au stade trophozoïte et/ou kystique. Ils appartiennent à l'un des quatre groupes suivants: amibes, flagellés, ciliés et coccidies.

Amibe dysentérique dans les selles

Entamoeba histolytica (amibe dysentérique) est responsable de l'amibiase chez l'homme. Elle est localisée dans le gros intestin et excrétée sous forme de trophozoïtes (avec les selles liquides) et/ou de kystes (dans les selles formées). La plupart des amibes (intestinales, Hartmann, Bütschli) n'étant pas pathogènes pour l'homme, une grande prudence est de mise lors de l'analyse des selles. Seule la détection de trophozoïtes hématophages (forme tissulaire d'E. histolytica forma magna) peut constituer un signe fiable de dysenterie amibienne et/ou de rectocolite hémorragique amibienne chez un patient. La présence d'érythrocytes dans le protoplasme des amibes est un signe diagnostique très important, car les formes non pathogènes d'amibes n'en contiennent jamais. Dans tous les autres cas, la détection de formes de trophozoïtes de type E. histolytica, dépourvues d'érythrocytes, ne permet pas de diagnostiquer l'amibiase. Les résultats de la détection des seuls kystes d'E. histolytica (forme luminale), détectables chez les personnes en convalescence après une amibiase aiguë, chez celles atteintes de la forme chronique de l'amibiase et chez les porteurs, sont évalués de manière similaire.

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Giardia dans les selles

Lamblia intestinalis (Giardia) appartient à la classe des flagellés. Giardia parasite l'intestin grêle, principalement le duodénum, ainsi que la vésicule biliaire. La présence de trophozoïtes (forme végétative de Giardia) nécessite un milieu liquide. Par conséquent, lors de sa pénétration dans le côlon, Giardia s'enkyste et seuls des kystes sont retrouvés dans les selles. Seules des diarrhées abondantes ou l'action de laxatifs permettent de détecter des formes végétatives dans les selles.

Balantidia dans les selles

Balantidium coli est le seul parasite cilié de l'intestin humain à provoquer des maladies de gravité variable, allant d'une colite bénigne à des lésions ulcéreuses sévères. L'agent pathogène est présent dans les selles sous forme de trophozoïtes ou de kystes. Il peut être porteur chez les personnes en bonne santé.

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Cryptosporidium dans les selles

Les représentants du genre Cryptosporidium sont actuellement considérés comme les principaux agents responsables de diarrhée. Cryptosporidium (du grec « spore cachée ») est un parasite obligatoire qui infecte les microvillosités des muqueuses du tube digestif et des voies respiratoires des humains et des animaux. Des infections gastro-intestinales causées par Cryptosporidium ont été signalées dans le monde entier. Une telle propagation de la cryptosporidiose est associée à un grand nombre de réservoirs naturels d'infection, à une faible dose infectieuse et à une forte résistance de l'agent pathogène aux désinfectants et aux antiparasitaires.

Parmi les cryptosporidies, les espèces potentiellement pathogènes pour l'homme sont Cryptosporidium parvum et Cryptosporidium felis (identifiées chez les personnes infectées par le VIH). Chez l'homme, l'infection se localise le plus souvent dans les parties distales de l'intestin grêle. Chez les patients présentant un déficit immunitaire sévère, l'infection peut toucher l'ensemble du tractus gastro-intestinal, de l'oropharynx à la muqueuse rectale.

Le diagnostic de cryptosporidiose repose dans la plupart des cas sur la détection d'oocystes de Cryptosporidies dans les selles et/ou (beaucoup moins fréquemment) sur une biopsie de la muqueuse de l'intestin grêle en cas de syndrome de diarrhée aqueuse. L'examen microscopique des préparations préparées et colorées par Gram est utilisé. Dans la plupart des cas, cette méthode de coloration ne permet pas la détection des oocystes en raison de leur faible capacité à retenir le colorant et de leur incapacité à les distinguer des champignons de type levure. C'est pourquoi on utilise une coloration acido-résistante. Grâce à cette méthode, les oocystes de Cryptosporidies sont colorés en rouge ou en rose et sont clairement visibles sur le fond bleu-violet où sont colorés les autres micro-organismes et le contenu intestinal.

Dans la cryptosporidiose aiguë, le nombre d'oocystes dans les selles est élevé, ce qui facilite leur détection par microscopie de préparations colorées. Cependant, dans la cryptosporidiose chronique d'évolution bénigne, lorsque le nombre d'oocystes dans les selles est faible, des méthodes d'enrichissement doivent être utilisées pour augmenter la probabilité de leur détection. Ces dernières années, les méthodes sérologiques sont devenues courantes pour le diagnostic de la cryptosporidiose.

La cryptosporidiose biliaire peut se manifester par une cholécystite, beaucoup plus rarement par une hépatite (avec augmentation de la concentration sanguine de bilirubine, d'ASAT, d'ALAT et de l'activité des phosphatases alcalines) et une cholangite sclérosante. Le diagnostic de cryptosporidiose biliaire repose sur des biopsies hépatiques et des analyses de bile, permettant de détecter des cryptosporidies à différents stades de développement.

Pour surveiller l'efficacité du traitement des lésions intestinales dues à des protozoaires, les selles sont analysées en fonction de la maladie identifiée: en cas d'amibiase ou de balantidiase, immédiatement après le traitement; en cas de giardiase, une semaine plus tard. Après le traitement des invasions des voies biliaires, l'efficacité peut être surveillée par l'analyse des selles et de la bile.

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Grattage des plis périanaux pour l'entérobiase

Le grattage des plis périanaux pour l'entérobiase est un test ciblé permettant de détecter les œufs d'oxyures (Enterobius vermicularis). Comme les oxyures femelles matures rampent pour pondre dans les plis périanaux, les œufs d'oxyures sont rarement retrouvés dans les selles; ils sont plus faciles à détecter dans les grattages des plis périanaux ou dans le mucus rectal.