Analyse microbiologique du liquide céphalo-rachidien

Recherche microbiologique

L'examen microscopique d'un frottis coloré de liquide céphalorachidien permet d'identifier la flore microbienne chez 10 à 20 % des patients atteints de méningite bactérienne. Dans la méningite bactérienne, on peut détecter des diplocoques méningés en forme de haricot, situés intracellulairement dans le cytoplasme des neutrophiles, ou des pneumocoques, également diplocoques mais de forme triangulaire, ainsi qu'une paire de cocci formant un losange (recouvert d'une capsule, situé extracellulairement). Dans certains cas, des spirochètes, des bactéries en forme de bâtonnets et des cellules fongiques de type levure sont visuellement détectés. Les données obtenues par microscopie sont approximatives et confirmées par d'autres méthodes. La méthode de flottation est utilisée pour détecter Mycobacteria tuberculosis. Pour isoler la culture de l'agent pathogène, le liquide céphalorachidien est ensemencé sur un milieu nutritif. Les résultats de l'étude dépendent du recueil et du transport corrects du liquide céphalorachidien, ainsi que de la qualité du milieu nutritif. La fréquence d'isolement de la culture du pathogène est deux fois plus élevée si le patient n'a pas reçu d'antibiotiques avant la ponction lombaire. En pratique, il est possible d'isoler la culture du pathogène à partir du liquide céphalorachidien chez 30 à 50 % des patients atteints de méningite purulente. La sensibilité de la culture isolée aux antibactériens utilisés pour traiter la méningite (benzylpénicilline, ampicilline, oxacilline, ceftriaxone, péfloxacine, ciprofloxacine, vancomycine, rifampicine, gentamicine) est obligatoire. Les cultures fongiques sont testées pour leur sensibilité aux antifongiques.

La règle principale sur laquelle se basent les études microbiologiques du liquide céphalorachidien est que le nombre de colonies cultivées dépend du nombre de micro-organismes ensemencés et de leur viabilité au moment de l'ensemencement. Cela signifie que le volume de liquide céphalorachidien envoyé pour examen microbiologique et la vitesse de son administration influencent directement les résultats de l'étude. Des volumes particulièrement importants de liquide doivent être envoyés pour l'ensemencement en cas d'infections fongiques, car la concentration de micro-organismes fongiques y est extrêmement faible. Ainsi, lors de l'examen d'un patient atteint de méningite chronique, le volume minimal de liquide céphalorachidien envoyé pour l'ensemencement doit être de 15 à 20 ml. Une autre règle de l'examen microbiologique est la coloration de Gram obligatoire en cas de méningite bactérienne aiguë. La coloration dure environ 5 minutes et présente une sensibilité et une spécificité élevées. Les résultats de cette coloration permettent de sélectionner immédiatement un traitement antibactérien adapté. L'administration d'antibiotiques avant la ponction lombaire peut endommager les membranes bactériennes et donc réduire considérablement la spécificité de la coloration de Gram, mais même dans ce cas, elle reste utile. Outre la culture, la coloration de Gram, la coloration à Mycobacterium tuberculosis et la coloration à l'encre de Chine pour les cryptocoques, plusieurs tests sérologiques sont utilisés pour détecter les antigènes viraux, bactériens et fongiques. Ainsi, en cas de suspicion de neurosyphilis, des analyses du LCR et du RIF doivent être effectuées.

Méthodes virologiques

L'isolement de la culture virale est généralement utilisé uniquement à des fins scientifiques.

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