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L'antibiogramme: préparation, décryptage, modalités d'exécution
Dernière revue: 05.07.2025

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Aujourd'hui, les tests de sensibilité aux antibiotiques gagnent en popularité. La microflore humaine est très diversifiée et représente un grand nombre de micro-organismes répartis dans divers biotopes.
Les entreprises pharmaceutiques ont développé un grand nombre d'agents antibactériens, les antibiotiques, qui contribuent à maintenir un ratio et un nombre normaux de populations microbiennes. Avec l'avènement des antibiotiques, de nombreuses maladies autrefois considérées comme mortelles ont été guéries. Mais les micro-organismes luttent également pour survivre, s'adaptant progressivement à l'action des médicaments antibactériens. Au fil du temps, nombre d'entre eux ont acquis une résistance à de nombreux médicaments, l'ont fixée dans leur génotype et ont commencé à la transmettre de génération en génération. Ainsi, les nouveaux micro-organismes sont initialement insensibles à certains médicaments, et leur utilisation peut s'avérer inefficace. Les pharmaciens développent de plus en plus de nouveaux produits, y ajoutent de nouveaux principes actifs et modifient leur formule de base. Mais progressivement, une résistance à ces médicaments se développe également.
La résistance accrue de la microflore à de nombreux médicaments, et même à leurs analogues, est souvent due à une utilisation incorrecte et incontrôlée des antibiotiques. Les médecins prescrivent des antibiotiques et leurs associations pour diverses maladies bactériennes. De plus, leur efficacité n'est pas évaluée au préalable, et le dosage optimal, pourtant essentiel pour le traitement et la prévention du développement de nouvelles résistances, n'est pas sélectionné. De nombreuses personnes prescrivent à tort une antibiothérapie, même pour des maladies virales, ce qui s'avère inefficace, car l'antibiotique n'agit pas contre les virus.
Le traitement est souvent prescrit sans test de sensibilité préalable; la sélection du principe actif et la posologie adaptée à chaque maladie et à chaque biotope ne sont pas effectuées. Les antibiotiques étant prescrits « à l'aveugle », il arrive souvent qu'ils ne présentent aucune activité contre les micro-organismes responsables de la maladie et qu'il faille en réduire le nombre. Au contraire, ils affectent d'autres représentants de la microflore, provoquant une dysbactériose, une pathologie également dangereuse et pouvant entraîner de graves conséquences. Les cas particulièrement dangereux sont ceux où un antibiotique détruit la microflore naturelle, censée protéger l'organisme et maintenir son fonctionnement normal. Il arrive également que la dose prescrite soit trop élevée ou trop faible.
Les patients sont également irresponsables quant au traitement. Souvent, celui-ci est interrompu une fois les symptômes de la maladie disparus. De plus, nombreux sont ceux qui préfèrent ne pas terminer le traitement jusqu'au bout. C'est l'un des facteurs contribuant au développement de résistances bactériennes. Le traitement complet est conçu pour détruire complètement la microflore pathogène. Si le traitement n'est pas terminé, celle-ci n'est pas complètement détruite. Les micro-organismes qui survivent subissent des mutations, développent des mécanismes qui leur confèrent une protection contre ce médicament et le transmettent aux générations suivantes. Le risque est que des résistances se développent non seulement contre ce médicament spécifique, mais aussi contre l'ensemble du groupe de médicaments.
Par conséquent, aujourd’hui, l’un des moyens les plus efficaces de thérapie rationnelle et de prévention de la résistance est la détermination préalable de la sensibilité au médicament prescrit et la sélection de son dosage optimal.
Indications pour la procédure tests de sensibilité aux antibiotiques
Normalement, une telle analyse doit être réalisée dans tous les cas où un traitement antibactérien est nécessaire. Selon les principes fondamentaux de l'antibiothérapie, tout antibiotique ne peut être prescrit qu'après une évaluation préliminaire de la sensibilité de la microflore à cet agent et la détermination de la concentration optimale du principe actif en laboratoire. En pratique, pour diverses raisons et circonstances, une telle étude n'est pas réalisée avant le début du traitement, et le médecin est contraint de sélectionner un médicament « au hasard ».
Aujourd'hui, les tests de sensibilité ne sont effectués que lorsque le médecin a de sérieux doutes quant à l'efficacité du médicament prescrit, en cas d'absence d'effet prolongée, ou encore en cas d'utilisation répétée du même médicament sur une période limitée. La sensibilité est souvent déterminée dans le traitement des maladies sexuellement transmissibles. De nombreux spécialistes ont recours à ces analyses en cas d'effets secondaires, de réactions allergiques et lorsqu'il est nécessaire de remplacer un médicament par un autre.
Cette analyse est également souvent utilisée pour sélectionner les médicaments à utiliser pour un traitement antibactérien pendant la période de convalescence après une opération, une laparoscopie ou une ablation d'organe. Dans les services de chirurgie et de chirurgie purulente, une telle étude est indispensable, car la résistance s'y développe assez rapidement. De plus, des bactéries ultra-résistantes contractées à l'hôpital se développent. De nombreuses cliniques privées prescrivent des médicaments en toute responsabilité, uniquement après vérification de la sensibilité. Dans de nombreux cas, le budget des institutions publiques ne permet tout simplement pas de réaliser de telles études pour chaque patient nécessitant un traitement antibactérien.
Préparation
La préparation à l'étude ne nécessite aucune mesure particulière. Elle est identique à celle de tout autre test. Quelques jours avant l'étude, il est conseillé de s'abstenir de boire de l'alcool. Le matin du prélèvement, dans la plupart des cas, il est interdit de manger ou de boire. Cependant, tout dépend du type d'analyse. Le matériel utilisé peut varier selon la maladie.
En cas d'affections de la gorge et des voies respiratoires, un prélèvement nasal et pharyngé est effectué. En vénéréologie, gynécologie et urologie, des prélèvements génitaux et sanguins sont effectués. En cas de maladies rénales, l'urine est souvent requise. En cas de maladies gastro-intestinales et de certaines maladies infectieuses, les selles et les vomissures sont analysés. Parfois, le lait maternel, les sécrétions nasales, les sécrétions oculaires, la salive et les expectorations peuvent être examinés. En cas de pathologies graves et de suspicion d'infection, le liquide céphalorachidien est même examiné. Le spectre est très large.
Les modalités de prélèvement du matériel sont déterminées par son appartenance biologique. Ainsi, l'urine et les selles sont collectées le matin dans un récipient propre ou dans un récipient spécial pour matériel biologique. Le lait maternel est recueilli avant la tétée. La partie médiane est prélevée pour analyse. Le frottis est prélevé à l'aide d'un écouvillon spécial, passé le long des muqueuses, puis placé dans un tube à essai contenant un milieu préparé. Le sang est prélevé dans un tube à essai, au doigt ou dans une veine. En cas de prélèvement urétral ou vaginal, il est recommandé d'éviter tout rapport sexuel pendant plusieurs jours.
Lors du prélèvement de matériel biologique à des fins de recherche, il est essentiel de garantir la qualité et la stérilité du matériel. Cependant, dans la plupart des cas, cette préoccupation est du ressort du personnel médical; le patient n'a pas à s'en préoccuper. Ce type d'examen est généralement réalisé par des gynécologues et des urologues, suivis par des ORL pour le traitement des affections du nasopharynx, du pharynx et des voies respiratoires supérieures.
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Technique tests de sensibilité aux antibiotiques
Le matériel biologique collecté est livré au laboratoire dans des conditions stériles, où des recherches plus approfondies sont menées. Tout d'abord, un ensemencement primaire est effectué sur des milieux nutritifs universels. Une partie du matériel est également prélevée pour examen microscopique. Un frottis est préparé pour la microscopie, puis une étude est réalisée, permettant d'obtenir une image approximative et de présumer la présence de micro-organismes dans l'échantillon. Cela permet de sélectionner les environnements les plus optimaux pour des recherches plus poussées et l'identification des micro-organismes. Des signes évoquant une inflammation ou un processus oncologique peuvent également être observés au microscope.
Pendant plusieurs jours, des colonies de micro-organismes se développent dans une boîte de Pétri. Plusieurs colonies sont ensuite prélevées et transférées dans des milieux nutritifs sélectifs, ce qui permet d'identifier un groupe approximatif de micro-organismes. Elles sont incubées plusieurs jours dans un thermostat, puis l'identification (détermination du type de micro-organisme) commence. L'identification est réalisée à l'aide de tests biochimiques et génétiques spécifiques, appelés identifiants. Des études immunologiques peuvent également être réalisées.
Une fois le pathogène principal isolé, sa sensibilité aux antibiotiques est évaluée. Plusieurs méthodes existent pour cela. La plus couramment utilisée est la dilution en série, ou la méthode de diffusion sur disque. Ces méthodes sont décrites en détail dans les ouvrages de référence microbiologiques, les directives et les normes de laboratoire.
L'essence de la méthode de diffusion sur disque est que les micro-organismes identifiés sont ensemencés sur un milieu nutritif, sur lequel sont placés des disques spéciaux imbibés d'antibiotiques. L'ensemencement est incubé dans un thermostat pendant plusieurs jours, puis les résultats sont mesurés. Le degré d'inhibition de la croissance bactérienne par chaque antibiotique est évalué. Si la bactérie est sensible à l'antibiotique, une « zone de lyse » se forme autour du disque, dans laquelle les bactéries ne se reproduisent pas. Leur croissance est lente, voire inexistante. Le diamètre de cette zone d'inhibition permet de déterminer le degré de sensibilité des micro-organismes à l'antibiotique et de formuler des recommandations.
La méthode de dilution en série est la plus précise. Pour cela, les micro-organismes sont ensemencés sur un milieu nutritif liquide, puis un antibiotique dilué selon le système de dilution décimal est ajouté. Les tubes à essai sont ensuite placés dans un thermostat pour une incubation de plusieurs jours. La sensibilité aux antibiotiques est déterminée par le degré de croissance bactérienne dans un bouillon nutritif additionné d'antibiotiques. La concentration minimale à laquelle les micro-organismes continuent de se développer est enregistrée. Il s'agit de la dose minimale du médicament (un recalcul des unités microbiologiques à la substance active est nécessaire).
Il s'agit de méthodes microbiologiques standard qui constituent la base de toute recherche. Elles impliquent l'exécution manuelle de toutes les manipulations. Aujourd'hui, de nombreux laboratoires sont équipés d'équipements spéciaux qui automatisent toutes ces procédures. Un spécialiste travaillant avec de tels équipements doit simplement savoir les utiliser et respecter les règles de sécurité et de stérilité.
Il est important de noter que les indices de sensibilité en laboratoire et sur les organismes vivants diffèrent fortement. Par conséquent, une dose plus élevée que celle déterminée lors de l'étude est prescrite. Cela est dû au fait que l'organisme ne dispose pas de conditions optimales pour la croissance bactérienne. En laboratoire, des conditions idéales sont créées. Une partie du médicament peut être neutralisée par l'action de la salive et du suc gastrique. Une autre partie est neutralisée dans le sang par les anticorps et les antitoxines produits par le système immunitaire.
Test de sensibilité aux antibiotiques dans l'urine
Tout d'abord, le matériel biologique est prélevé. Pour ce faire, il faut prélever la moitié de l'urine du matin et la transmettre au laboratoire. Il est important de maintenir la stérilité et de ne pas prendre d'antibiotiques plusieurs jours avant l'analyse, sous peine d'obtenir un résultat faussement négatif. Ensuite, un ensemencement standard est effectué, dont l'objectif est d'isoler une culture pure du pathogène et de sélectionner l'antibiotique qui aura une action bactéricide optimale. La concentration requise de l'antibiotique est déterminée.
L'analyse d'urine est le plus souvent prescrite en cas de suspicion de processus infectieux et inflammatoire du système génito-urinaire, en cas de déficit immunitaire et de troubles métaboliques. Normalement, l'urine est un liquide stérile. La durée d'une telle analyse est de 1 à 10 jours et dépend de la vitesse de croissance du micro-organisme.
Culture et tests de sensibilité aux antibiotiques
L'étude consiste à isoler le micro-organisme pathogène dans une culture pure. Il peut parfois y avoir plusieurs micro-organismes de ce type (infection mixte). Certains micro-organismes sont capables de former des biofilms, qui sont une sorte de « communauté microbienne ». Le taux de survie des biofilms est bien supérieur à celui des micro-organismes isolés ou des associations. De plus, tous les antibiotiques ne sont pas capables d'influencer le biofilm et de le pénétrer.
Pour identifier l'agent pathogène et l'isoler en culture pure, un ensemencement est réalisé. Au cours de l'étude, plusieurs ensemencements sont effectués dans différents milieux nutritifs. Une culture pure est ensuite isolée, son affiliation biologique est déterminée et sa sensibilité aux antibactériens est déterminée. La concentration optimale est sélectionnée.
Tout matériel biologique peut être utilisé pour l'étude, selon la maladie et la localisation du processus infectieux. La durée est déterminée par le taux de croissance des micro-organismes.
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Test de sensibilité des selles
Les selles sont examinées lors de diverses maladies gastriques et intestinales, en cas de suspicion d'infection, d'intoxication bactérienne ou d'intoxication alimentaire. L'objectif de cette étude est d'isoler l'agent pathogène et de sélectionner les médicaments antibactériens les plus efficaces, à forte activité. L'importance de ce type d'étude réside dans la possibilité de sélectionner un médicament qui agira uniquement sur l'agent pathogène et n'affectera pas la microflore normale.
La première étape, très importante, consiste à recueillir les selles. Elles doivent être recueillies le matin dans un récipient stérile spécial. Elles ne doivent pas être conservées plus de 1 à 2 heures. Les femmes ayant des règles doivent reporter l'analyse à la fin, car la précision des résultats sera altérée. Le matériel est ensuite envoyé au laboratoire pour analyse. L'analyse est réalisée selon les techniques microbiologiques standard d'ensemencement et d'isolement d'une culture pure. Un antibiogramme est également réalisé. Sur la base des conclusions, des recommandations sont formulées et un programme d'étude complémentaire est défini.
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Analyse de dysbactériose avec sensibilité
Le matériel d'étude est constitué de selles prélevées immédiatement après la défécation. La microflore gastro-intestinale normale se compose de représentants de la flore normale et de plusieurs représentants de la flore pathogène. Leur composition, leur quantité et leur proportion sont strictement définies et maintenues dans les limites autorisées. Si ce rapport est perturbé, une dysbactériose se développe. Celle-ci peut se manifester de différentes manières. Des maladies infectieuses peuvent se développer en cas d'augmentation brutale de la quantité de microflore pathogène. Si la quantité d'un micro-organisme diminue fortement, l'espace libre est occupé par d'autres représentants atypiques du tractus gastro-intestinal, ou pathogènes. Souvent, l'espace libre est occupé par un champignon, ce qui entraîne le développement de diverses infections fongiques et candidoses.
Afin de déterminer la composition quantitative et qualitative de la microflore intestinale, une analyse des selles pour la recherche de dysbactériose est réalisée. Traditionnellement, tous les représentants vivant dans l'intestin sont divisés en trois groupes: pathogènes, opportunistes et non pathogènes. L'analyse comprend donc trois parties. Chaque groupe de micro-organismes a ses propres besoins en matière de nourriture et d'énergie. Chaque groupe nécessite des milieux nutritifs et des additifs sélectifs spécifiques.
Tout d'abord, une microscopie et un ensemencement primaire sont effectués. Ensuite, après l'ensemencement, les plus grandes colonies, présentant des caractéristiques morphologiques similaires à celles des représentants de chaque groupe, sont sélectionnées. Elles sont transférées sur des milieux sélectifs. Une fois les micro-organismes développés, ils sont identifiés et immédiatement testés pour leur sensibilité aux antibiotiques. Des méthodes microbiologiques standard sont utilisées.
L'étude d'un groupe de micro-organismes pathogènes, en plus des études standard, comprend la détermination des bactéries typhoïdes, paratyphoïdes et dysentérique. On détermine également si une personne est porteuse de ces micro-organismes. Une étude complète de la dysbactériose comprend également l'étude des représentants des groupes bifidobactéries et lactobacilles. L'étude dure environ une semaine et dépend du taux de croissance des micro-organismes.
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Test de sensibilité aux bactériophages
En cas d'infection intestinale, les bactériophages sont souvent utilisés en remplacement des antibiotiques. Les bactériophages sont des virus bactériens sensibles à ces bactéries. Ils trouvent une bactérie complémentaire, la pénètrent et détruisent progressivement la cellule bactérienne. Le processus infectieux est alors stoppé. Cependant, toutes les bactéries ne sont pas sensibles aux bactériophages. Afin de vérifier si un bactériophage est actif contre la microflore, une analyse est nécessaire.
Le matériel d'étude est constitué de matières fécales. L'analyse doit être livrée au laboratoire dans un délai d'une heure, faute de quoi elle sera impossible. Il est nécessaire de répéter l'analyse plusieurs fois. La méthode initiale est similaire à celle utilisée pour déterminer la sensibilité aux antibiotiques. L'échantillon est d'abord examiné au microscope, puis ensemencement primaire sur milieu nutritif universel. Une culture pure est ensuite isolée sur milieu nutritif sélectif.
Le travail principal est réalisé en culture pure. Celles-ci sont traitées avec différents types de bactériophages. Une dissolution (lyse) de la colonie indique une forte activité du bactériophage. Une lyse partielle indique une activité modérée du bactériophage. En l'absence de lyse, on parle de résistance au bactériophage.
L'avantage de la phagothérapie est que les bactériophages n'affectent pas le corps humain et ne provoquent pas d'effets secondaires. Ils se fixent sur certains types de bactéries et les lysent. Leur inconvénient est qu'ils sont très spécifiques et sélectifs, et ne peuvent pas toujours se fixer aux bactéries.
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Analyse des expectorations pour la sensibilité aux antibiotiques
L'analyse consiste à étudier les sécrétions des voies respiratoires inférieures. L'objectif est de déterminer le type de micro-organisme responsable de la maladie. Un antibiogramme est également réalisé. Il permet de déterminer la sensibilité de l'agent pathogène aux antibiotiques et de sélectionner la concentration optimale. Ce traitement est utilisé pour les maladies des voies respiratoires.
L'examen des expectorations et du contenu des poumons et des bronches est nécessaire pour choisir un traitement et établir différents diagnostics. Il permet de confirmer ou d'infirmer la présence de tuberculose.
Il est d'abord nécessaire de prélever du matériel biologique. Il peut être obtenu par la toux, par expectoration ou par prélèvement trachéal lors d'une bronchoscopie. Des aérosols spéciaux favorisent l'expectoration. Avant de prélever les expectorations, il est conseillé de se rincer la bouche à l'eau afin de réduire le degré de contamination bactérienne de la cavité buccale. Il est recommandé de prendre trois respirations profondes et de produire une toux productive. Les expectorations peuvent également être prélevées par aspiration trachéale. Dans ce cas, un cathéter spécial est inséré dans la trachée. Lors de la bronchoscopie, un bronchoscope est introduit dans la cavité bronchique. La muqueuse est alors lubrifiée avec un anesthésique.
Le matériel est ensuite envoyé au laboratoire pour analyse. Un ensemencement standard et une microscopie sont effectués. Une culture pure est ensuite isolée et soumise à d'autres manipulations. Un antibiogramme est réalisé, ce qui permet d'identifier le spectre de sensibilité bactérienne et de sélectionner le dosage optimal.
En cas de suspicion de tuberculose, les expectorations matinales sont examinées pendant trois jours. Le résultat du test de dépistage de la tuberculose est disponible en 3 à 4 semaines. Mycobacterium tuberculosis, l'agent responsable de la maladie, se développe très lentement.
Normalement, des représentants de la microflore normale des voies respiratoires doivent être détectés. Il faut également tenir compte du fait qu'en cas d'immunité réduite, les indicateurs de la microflore normale peuvent différer.
Analyse du sperme pour la sensibilité aux antibiotiques
Il s'agit d'une étude bactériologique de l'éjaculat des spermatozoïdes, suivie de la sélection d'antibiotiques sensibles et de leurs concentrations. Elle est le plus souvent réalisée dans le traitement de l'infertilité et d'autres maladies de l'appareil reproducteur masculin, notamment lorsque la maladie s'accompagne d'un processus infectieux. La principale cause d'infertilité masculine est dans la plupart des cas une infection. Un spermogramme est généralement réalisé initialement. Les résultats permettent d'établir la fécondité des spermatozoïdes. Si un grand nombre de leucocytes est détecté lors de cette analyse, on peut parler d'un processus inflammatoire. Dans ce cas, une analyse microbiologique est généralement prescrite immédiatement, car l'inflammation s'accompagne presque toujours d'une infection. En fonction des résultats obtenus, un traitement approprié est sélectionné. L'examen est généralement prescrit par un andrologue.
La prostatite et les maladies vénériennes peuvent également justifier un test. Ce test est également prescrit en cas de détection d'une maladie vénérienne chez le partenaire.
La base d'une analyse correcte repose avant tout sur le prélèvement correct du matériel biologique. Le matériel est recueilli dans des récipients spéciaux à col large. La température de conservation doit correspondre à celle du corps humain. Dans ce cas, le matériel ne peut être conservé plus d'une heure. Congelé, il ne peut être conservé plus d'une journée. Il est déconseillé de réaliser une culture pendant la prise d'antibiotiques, car cela modifie le tableau clinique. En général, la culture est réalisée avant le début du traitement antibiotique. Il est également conseillé d'arrêter le traitement 2 à 3 jours avant l'analyse.
La culture est ensuite semée sur un milieu nutritif. L'incubation est effectuée dans un thermostat pendant 1 à 2 jours. Une culture pure est ensuite isolée, puis identifiée, la sensibilité est déterminée, ainsi que le type et le taux de croissance de chaque colonie. La sensibilité aux antibiotiques est également déterminée si des micro-organismes pathogènes sont détectés. L'analyse dure en moyenne 5 à 7 jours.
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Test de sensibilité au gluten
Il existe de nombreux tests permettant de déterminer la sensibilité immunologique à diverses substances ou agents pathogènes. Auparavant, la principale méthode consistait à réaliser des tests basés sur la réaction d'agglutination d'anticorps et d'antigènes. Aujourd'hui, ces tests sont de moins en moins utilisés, car leur sensibilité est bien inférieure à celle de nombreuses méthodes modernes, comme les tests de gluten. Le plus souvent, en pratique, on a recours à un test salivaire pour l'analyse du gluten et des selles.
Le test de sensibilité au gluten est utilisé pour diagnostiquer divers troubles intestinaux. Il repose sur la réaction du système immunitaire. Si du gluten est ajouté aux selles, la réaction se produit ou est absente. On parle alors de faux positif ou de faux négatif. Un résultat positif indique une prédisposition à la colite et une forte probabilité de développement. Il confirme également la maladie cœliaque.
Il est également possible d'effectuer un test de dépistage du gluten en utilisant la salive comme matériel biologique. Il est possible de mesurer la quantité d'anticorps anti-gliadine. Un résultat positif indique une sensibilité au gluten, ce qui peut indiquer une forte probabilité de diabète. Si les deux tests sont positifs, le diabète ou la maladie cœliaque peuvent être confirmés.
Test de sensibilité de la chlamydia aux antibiotiques
L'analyse est réalisée dans le cadre du traitement des maladies infectieuses et inflammatoires de l'appareil urogénital, en cas de suspicion de chlamydia. Le matériel utilisé est un prélèvement de la muqueuse vaginale (chez la femme) et un frottis urétral (chez l'homme). Le prélèvement est effectué en salle d'examen avec du matériel jetable. Il est important de maintenir la stérilité. Avant le prélèvement, il est conseillé de s'abstenir de toute relation intime pendant 1 à 2 jours avant le début de l'étude. En cas de règles, le prélèvement est effectué 3 jours après la fin complète de celles-ci.
Le matériel est livré au laboratoire. Une analyse complète comprend une microscopie préliminaire du frottis. Cela permet d'identifier visuellement la microflore par ses caractéristiques morphologiques et de sélectionner correctement les milieux nutritifs. La présence de mucus, de pus et de particules épithéliales peut indiquer directement ou indirectement le développement d'un processus inflammatoire ou d'une dégénérescence maligne des cellules.
Ensuite, un premier ensemencement est effectué. La culture est incubée plusieurs jours dans un thermostat et l'identification est réalisée selon les caractéristiques de la culture. La culture est ensuite transférée dans un milieu nutritif sélectif destiné à la culture de chlamydia. Les colonies obtenues sont identifiées par des tests biochimiques. La sensibilité aux antibiotiques est ensuite déterminée par des méthodes standard. L'antibiotique le plus sensible et sa concentration sont sélectionnés. Des milieux spécialement développés pour ce type de micro-organisme, contenant toutes les substances et facteurs de croissance nécessaires, sont nécessaires à la culture de chlamydia.
Il est également possible de mener une étude par méthode biologique. Pour ce faire, des rats sont infectés par l'agent pathogène. Dans certains laboratoires, une culture tissulaire spécialement développée est utilisée à la place des rats. Cela est dû au fait que les chlamydia sont des parasites intracellulaires et que leur culture nécessite des conditions spécifiques. Les micro-organismes sont ensuite analysés par PCR. Pour déterminer la sensibilité, ils sont transplantés sur un milieu nutritif sélectif pour chlamydia, et après quelques jours, les résultats sont enregistrés. La résistance ou la sensibilité est évaluée par la suppression du processus infectieux dans les cellules.
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Combien de temps faut-il pour effectuer un test de sensibilité aux antibiotiques?
En moyenne, l'analyse est réalisée en 5 à 7 jours. Certaines analyses prennent plus de temps. Par exemple, pour le diagnostic de la tuberculose, il faut attendre de 3 semaines à un mois pour obtenir les résultats. Tout dépend de la vitesse de croissance des micro-organismes. Le personnel de laboratoire doit souvent gérer des cas où les patients demandent une analyse plus rapide. Ils proposent même un « supplément » en cas d'urgence. Cependant, il faut comprendre que, dans ce cas, rien ne dépend des actions du laborantin. Cela dépend uniquement de la vitesse de croissance du micro-organisme. Chaque type a sa propre vitesse de croissance, strictement définie.
Performance normale
Il n'existe pas de valeurs normatives universelles absolues applicables à toutes les analyses. Premièrement, ces valeurs peuvent différer selon le biotope. Deuxièmement, elles sont spécifiques à chaque micro-organisme. Autrement dit, les valeurs normatives pour un même micro-organisme, par exemple pour la gorge et les intestins, sont différentes. Ainsi, si le staphylocoque prédomine dans la gorge en tant que représentant de la microflore normale, alors E. coli, les bifidobactéries et les lactobactéries prédominent dans les intestins. Les valeurs pour un même micro-organisme dans différents biotopes peuvent également différer considérablement. Par exemple, Candida peut être normalement présent en quantité limitée dans la microflore urogénitale. Il est normalement absent de la cavité buccale. La présence de Candida dans la cavité buccale peut indiquer son introduction artificielle depuis son habitat naturel.
L'urine, le sang et le liquide céphalorachidien sont des milieux biologiques normalement stériles, c'est-à-dire exempts de microflore. La présence de microflore dans ces liquides indique un processus inflammatoire et infectieux important, ainsi qu'un risque de bactériémie et de septicémie.
En général, il existe une classification approximative. L'unité de mesure en microbiologie est l'UFC/ml, soit le nombre d'unités formant colonie dans 1 millilitre de liquide biologique. Le degré de contamination est déterminé par le nombre d'UFC et varie largement de 10 à 10. Ainsi, 10 représente le nombre minimal de micro-organismes, tandis que 10 représente un degré d'infection grave. Un nombre inférieur à 10 est considéré comme normal; tout indicateur supérieur à ce nombre indique une reproduction pathologique des bactéries.
En ce qui concerne la sensibilité aux antibiotiques, tous les micro-organismes sont classés en résistants, modérément sensibles et sensibles. Ce résultat est souvent exprimé sous forme de caractéristique qualitative indiquant la dose minimale inhibitrice de l'antibiotique, qui inhibe néanmoins la croissance du micro-organisme. Ces indicateurs sont strictement individuels pour chaque personne, comme pour chaque micro-organisme.
Le dispositif d'analyse
Lors d'études bactériologiques, notamment pour la détermination de la sensibilité aux antibiotiques, un seul appareil ne suffit pas. Un laboratoire de bactériologie doit disposer d'un équipement complet et complet. Il est nécessaire de planifier et de sélectionner soigneusement l'équipement adapté à chaque étape de la recherche. Lors de la collecte du matériel biologique, des instruments stériles, des boîtes, des conteneurs, des chambres de stockage et du matériel de transport pour l'acheminement du matériel au laboratoire sont nécessaires.
En laboratoire, vous aurez tout d'abord besoin d'un microscope de haute qualité pour la microscopie des frottis. Il existe aujourd'hui un grand nombre de microscopes aux propriétés variées, allant des microscopes optiques traditionnels aux microscopes à contraste de phase et à force atomique. Les équipements modernes permettent de numériser une image en trois dimensions et de l'examiner à fort grossissement avec une grande précision.
Au stade de l'ensemencement et de l'incubation des micro-organismes, des autoclaves, des étuves à chaleur sèche, des dessiccateurs, des bains de vapeur et une centrifugeuse peuvent être nécessaires. Un thermostat est également requis, car c'est dans ce thermostat que se déroule l'incubation principale du matériel biologique.
Au stade de l'identification des micro-organismes et de la réalisation d'un antibiogramme, des micromanipulateurs, des spectromètres de masse, des spectrophotomètres, des colorimètres peuvent être nécessaires pour divers calculs et évaluations des propriétés biochimiques des cultures.
De plus, les laboratoires modernes peuvent être équipés d'équipements de haute technologie réalisant toutes les principales étapes de recherche mentionnées ci-dessus, jusqu'au calcul automatique des résultats. Parmi ces équipements, on trouve, par exemple, un appareil complexe de laboratoire bactériologique basé sur un spectromètre de masse à temps de vol. Cette gamme d'appareils permet de diviser l'ensemble du laboratoire en trois zones. La première zone, sale, accueille la réception et l'enregistrement des analyses. La deuxième zone, de travail, est celle où se déroulent les principales recherches microbiologiques. La troisième zone, de stérilisation et d'autoclave, accueille la préparation et l'élimination du matériel de travail.
Ces modèles permettent une incubation dans une large gamme de températures et de conditions. Ils sont équipés d'un analyseur intégré de sang et d'autres échantillons biologiques, produisant des résultats d'une grande précision et fiabilité. Le kit comprend une balance électronique, des bidistillateurs, des centrifugeuses, des autoclaves et des armoires de stérilisation, un cuiseur automatique, un bain-marie avec agitateur intégré, des pH-mètres, des thermomètres et des microscopes.
Un analyseur microbiologique est également utilisé, dans lequel sont placés les échantillons à analyser, les milieux nutritifs et les kits de tests de sensibilité. L'appareil effectue les analyses nécessaires et fournit une conclusion prête à l'emploi.
Élever et abaisser les valeurs
Seul un médecin peut déchiffrer l'analyse. Cependant, les patients, à la réception des résultats, paniquent souvent face à la multitude de symboles et de chiffres incompréhensibles. Pour ne pas se perdre, il est conseillé d'avoir au moins une idée générale de la manière de déchiffrer l'analyse de sensibilité aux antibiotiques. Généralement, le premier élément du résultat indique le nom du micro-organisme responsable de la maladie. Ce nom est donné en latin. Il peut également désigner un représentant de la microflore normale de l'organisme; il n'y a donc pas lieu de paniquer. Le deuxième élément indique le degré d'ensemencement, c'est-à-dire le nombre de micro-organismes. Ce nombre est généralement compris entre 101 et 109. Le troisième élément indique la forme de pathogénicité et le quatrième le nom des médicaments antibactériens auxquels le micro-organisme est sensible. La concentration minimale inhibitrice, à laquelle la croissance du micro-organisme est inhibée, est indiquée à proximité.