Culture bactérienne des urines avec détermination de la sensibilité aux antibiotiques

Les urologues sont souvent confrontés dans leur pratique à des maladies infectieuses du système urogénital. Un diagnostic et un traitement adéquats de telles pathologies sont impossibles sans déterminer le type d'agent pathogène et sa résistance à l'antibiothérapie prescrite. Pour ce faire, chaque patient doit subir une culture bactérienne d'urine avec détermination de la sensibilité aux antibiotiques. Il s'agit d'une étude obligatoire dans de nombreux troubles urogénitaux.

Que signifie et que montre une culture d’urine ?

La culture bactérienne de l'urine avec détermination de la sensibilité aux antibiotiques est l'un des tests diagnostiques fréquemment prescrits et assez précis de la composition du liquide urinaire. En règle générale, de tels diagnostics sont appropriés pour clarifier le diagnostic, suivre la dynamique du traitement, évaluer l'état général du corps des enfants et des femmes enceintes.

La culture bactérienne est prescrite pour déterminer la présence de bactéries dans l'urine, leur identification et l'évaluation de leur résistance aux médicaments antibactériens, ainsi que pour confirmer ou infirmer le diagnostic de processus infectieux-inflammatoires.

Lors d'une culture d'urine, les laboratoires calculent la concentration d'agents infectieux présents et évaluent ainsi l'état du système urogénital et des organes associés.

La culture bactérienne de l'urine est considérée comme une analyse très précise et informative. Grâce à cela, il est possible de déterminer le nombre et le type d'agent pathogène pathologique. Et après avoir déterminé la sensibilité aux antibiotiques, le médecin a la possibilité de prescrire le traitement correct et efficace. [1]

Ainsi, l’ensemencement bactérien de l’urine permet :

• identifier l'agent causal du processus infectieux;
• connaître sa concentration dans les urines ;
• Déterminer quels antibiotiques seront efficaces pour contrôler l’agent pathogène et lesquels seront inutiles ou inefficaces ;
• pour suivre l'évolution du traitement.

Indications pour la procédure culture bactérienne de l'urine

La culture bactérienne de l'urine avec détermination de la sensibilité aux antibiotiques est un test important pour de nombreuses maladies et affections. Parfois, il est prescrit dans le cadre d'un dépistage visant à prévenir les pathologies infectieuses et inflammatoires de la sphère génito-urinaire chez les personnes à risque :

• femmes enceintes;
• les personnes âgées, les patients alités ;
• patients atteints de diabète sucré ou de pathologies oncologiques.

La principale indication de ce test est la suspicion de lésions infectieuses de l'appareil génito-urinaire. Bien que dans de nombreux cas, en présence de symptômes d'infection, les médecins prescrivent empiriquement un médicament antibactérien, ayant généralement un large spectre d'activité. Un tel système « fonctionne » dans environ 78 % des cas. Mais dans certains cas, une culture bactérienne d'urine avec détermination de la sensibilité aux antibiotiques est considérée comme obligatoire :

• Si un processus infectieux est suspecté chez une femme pendant la grossesse ;
• si une pyélonéphrite est suspectée ;
• si le processus infectieux est détecté chez les hommes ;
• en cas d'apparition d'une infection urologique à l'hôpital ;
• Si le patient a subi un cathétérisme prolongé, une cystoscopie, après quoi le patient a de la fièvre ;
• En cas de forte fièvre chez les enfants de moins de 3 ans sans cause apparente ;
• s'il y a une exacerbation régulière de la pathologie infectieuse génito-urinaire, ou si le traitement empirique prescrit est inefficace ;
• s'il s'agit d'un processus urinaire inflammatoire compliqué, en particulier chez les patients âgés ;
• si une pathologie urinaire se développe chez des patients présentant un statut immunitaire altéré, des pathologies rénales chroniques, des malformations congénitales des reins ou du système urinaire, ou chez des patients opérés pour une transplantation rénale.

Il existe un certain nombre de recommandations selon lesquelles une culture bactérienne d'urine avec détermination de la sensibilité aux antibiotiques est prescrite, même en l'absence de symptômes pathologiques :

• les femmes enceintes à partir de 14 semaines, pour prévenir le développement de la pyélonéphrite ;
• les patients avant une chirurgie urogénitale ;
• patients au cours des 8 à 10 premières semaines après la transplantation rénale ou en cas d'anomalies de l'organe transplanté.

Une culture d'urine pour la cystite

La cystite est un processus inflammatoire de la muqueuse de la vessie, un organe creux dans lequel le liquide urinaire s'accumule. L'urine s'écoule continuellement des reins vers la vessie, puis quitte le corps par l'urètre.

La cystite peut être aiguë et chronique, infectieuse, traumatique, chimique, primaire ou secondaire. Pour diagnostiquer la maladie, un examen général du liquide urinaire avec microscopie des sédiments, ainsi qu'une culture bactérienne de l'urine avec détermination de la sensibilité aux antibiotiques (souvent - pour un large spectre infectieux) sont effectués en standard.

Le test bactérien est effectué en utilisant un milieu dense en nutriments. L'identification bactérienne est réalisée à l'aide de la spectrométrie de masse et d'un analyseur spécial. La sensibilité aux antibiotiques est déterminée par la méthode de diffusion sur disque à l'aide d'un analyseur spécial.

Les antibiotiques sont des médicaments spécifiques dont l’efficacité antibactérienne est incontestable. Cependant, la plupart des micro-organismes sont capables de développer une résistance à ces médicaments. Un tel processus peut être observé particulièrement souvent lors de la prescription d'antibiotiques sans indication valable, avec plusieurs cures d'antibiothérapie consécutives, avec une automédication régulière et une utilisation prophylactique de ces médicaments. Par conséquent, avant de prescrire l'un ou l'autre médicament antibactérien contre la cystite, le médecin doit effectuer une culture bactérienne de l'urine et déterminer quel antibiotique sera le plus efficace et le plus approprié.

Chez les patients atteints de cystite, l'examen bactérien le plus fréquent révèle des entérobactéries, des pseudomonades, des staphylocoques et streptocoques, des entérocoques, des champignons de type levure.

Culture d'urine pour pyélonéphrite.

La pyélonéphrite est une pathologie rénale infectieuse et inflammatoire, qui touche le plus souvent les jeunes enfants, les femmes enceintes, les hommes âgés souffrant d'inflammation ou d'adénome de la prostate.

La pyélonéphrite peut être provoquée par une infection bactérienne existant dans le corps ou pénétrant dans les reins depuis l'environnement. L'immunité affaiblie, les processus inflammatoires chroniques, l'hypothermie, les maladies endocriniennes et hépatiques contribuent au développement de la maladie. En outre, le risque de pyélonéphrite augmente si l'écoulement urinaire du patient est perturbé - par exemple en cas de lithiase urinaire, d'adénome de la prostate, etc., ainsi que de diabète sucré, de dysfonctionnement urinaire neurogène.

Il est très important de diagnostiquer la pyélonéphrite le plus tôt possible. Pour ce faire, il est nécessaire d'effectuer une analyse sanguine générale et une analyse biochimique, une analyse d'urine générale, un ensemencement bactériologique des urines avec détermination de la sensibilité aux antibiotiques, ainsi qu'une échographie des organes pelviens. De telles études sont recommandées non seulement au début de la maladie, mais également en cours de traitement. Le contrôle bactériochimique des urines en l'absence de complications de la pyélonéphrite est réalisé le quatrième jour de l'antibiothérapie, 10 jours après sa fin. Si la pyélonéphrite s'accompagne de complications, l'examen bactérien est effectué une semaine après le début du traitement antibiotique, ainsi qu'un mois après la fin du traitement thérapeutique.

Culture d'urine pour la glomérulonéphrite

La glomérulonéphrite est un groupe de maladies caractérisées par des lésions des glomérules (tubes rénaux) des deux reins. La pathologie s'accompagne d'un dysfonctionnement rénal, à savoir l'incapacité d'éliminer les produits métaboliques, les substances toxiques et l'excès de liquide du corps. Si la maladie n'est pas détectée et traitée à temps, elle se complique rapidement de néphrosclérose (sclérose des tubules rénaux), d'insuffisance rénale - jusqu'à la situation dans laquelle le patient nécessite une transplantation urgente de l'organe.

Le traitement de la glomérulonéphrite est prolongé et complexe. Le diagnostic repose sur l'étude du sang et de l'urine. L'analyse du liquide urinaire est caractérisée par une protéinurie, une cylindrurie. L'ensemencement bactérien de l'urine avec détermination de la sensibilité aux antibiotiques est un type de diagnostic auxiliaire permettant d'exclure la cause bactérienne du développement de la maladie. Une cause fondamentale courante du développement de la glomérulonéphrite chronique est le streptocoque bêta-hémolytique du groupe A (un agent causal courant de l'amygdalite chronique et des maux de gorge). Cette bactérie active le développement de l'inflammation au niveau des glomérules et déclenche la production d'auto-anticorps ciblant les propres cellules de l'organisme. Les récidives régulières de la maladie entraînent le remplacement du parenchyme rénal par du tissu conjonctif et le développement d'une néphrosclérose, avec une transformation ultérieure de la pathologie en insuffisance rénale chronique.

Préparation

La préparation au recueil des urines pour analyse bactériologique prend en compte les étapes suivantes :

• La veille du test, le patient doit s'abstenir de tout effort physique excessif et de toute consommation d'alcool ;
• un jour avant la collecte du biomatériau, il convient d'éviter la consommation d'aliments et de médicaments susceptibles de modifier la couleur du liquide urinaire (betteraves, multivitamines, jus de carotte, etc.) ;
• un jour avant la collecte du biomatériau, vous ne devez pas prendre de diurétiques, un mois avant la collecte - arrêter de prendre des chimiopréparations (en consultation avec un médecin) ;
• immédiatement avant de recueillir l'urine, les organes génitaux externes doivent être soigneusement lavés pour éviter l'introduction de bactéries dans le biomatériau ;
• Si possible, les femmes devraient éviter de faire un test de culture bactérienne pendant les saignements menstruels ;
• le matériel collecté doit être apporté au laboratoire dans un délai d’une heure.

Quelle est la bonne façon de faire un test d’hémoculture ?

Pour soumettre l'urine à une culture bactérienne avec un test de sensibilité aux antibiotiques, un échantillon d'urine du matin est collecté immédiatement après le réveil (et après les procédures d'hygiène). S'il n'est pas possible de collecter le matériel immédiatement, le liquide urinaire est collecté 2 à 3 heures après le dernier épisode de miction.

Immédiatement avant le prélèvement, les organes génitaux externes et les mains doivent être bien lavés – toujours avec de l’eau et du savon. Aucune solution antiseptique ou désinfectante ne doit être utilisée, car elles pourraient fausser les résultats du diagnostic.

Le pot ou le récipient doit être stérile, avec un couvercle bien vissé : il est préférable d'acheter un tel récipient directement au laboratoire ou en pharmacie. Ne laissez pas de liquides ou de sécrétions étrangers pénétrer dans le récipient, n'y plongez pas les doigts, des objets, etc. Le couvercle du pot doit être ouvert immédiatement avant le prélèvement d'urine et fermé immédiatement après le prélèvement pour éviter les bactéries de l'environnement extérieur.

Le liquide urinaire collecté pour la culture bactérienne et la sensibilité aux antibiotiques doit être apporté au laboratoire dès que possible : dans les 1 à 2 heures. Il est fortement déconseillé de laisser le biomatériau dans des pièces dont la température dépasse +20°C. La température optimale pour le stockage à court terme du matériau est de +8 à +15°C. Il est interdit de congeler les urines avant examen bactériologique.

Un stockage prolongé ou inapproprié de l'urine pour l'ensemencement bactérien peut entraîner des modifications des propriétés physiologiques du liquide, une croissance de la flore microbienne et des dommages aux sédiments. [2]

Pot de culture d'urine

Des pots spéciaux sont disponibles dans les pharmacies et les laboratoires pour le prélèvement ultérieur sous vide d'un échantillon d'urine stérile. Les conteneurs modernes présentent plusieurs avantages. Tout d'abord, c'est la commodité de la collecte de matériel pour la recherche : l'urine peut être collectée à la fois dans une pièce spéciale du laboratoire et à la maison. Le patient n'a pas besoin de chercher un récipient plus ou moins adapté, de le stériliser, de l'étiqueter, etc. De plus, le biomatériau dans un récipient stérile de qualité se conserve plus longtemps : l'étanchéité du récipient exclut totalement la perte de stérilité et la possibilité de fuite de liquide sur le chemin du laboratoire.

Que ne dois-je pas manger avant une culture d'urine ?

A la veille du prélèvement d'urine pour culture bactérienne, il n'est pas souhaitable de consommer des aliments susceptibles de modifier la couleur du biomatériau. Par exemple, il est conseillé de refuser temporairement de manger :

• betteraves et plats à base de ce légume racine ;
• carottes;
• myrtilles, mûres;
• cerises;
• rhubarbe, oseille;
• haricots;
• bière, vin et boissons contenant des ingrédients colorants.

Certains aliments préparés vendus en magasin contiennent également du colorant alimentaire. Leur présence doit obligatoirement être indiquée parmi les ingrédients présents sur l'emballage. De tels colorants peuvent non seulement colorer l'urine, mais également alourdir les reins, irriter les parois des conduits urinaires et de la vessie.

Technique culture bactérienne de l'urine

L'ensemencement bactériologique (bactérien) de l'urine implique la détection et l'identification des micro-organismes présents dans le liquide biologique, ainsi que la détermination de leur concentration. A cet effet, l'urine est appliquée sur un milieu favorable à la croissance et au développement des bactéries (appelé « milieu nutritif ») : on utilise le plus souvent de la gélose ou du bouillon sucré. [3]

En l’absence de croissance ultérieure de micro-organismes, un examen bactérien négatif est dit négatif. Si la croissance est présente et que la concentration de flore pathogène est suffisante pour le développement du processus infectieux, le résultat de l'étude est considéré comme positif.

La teneur en concentration est le nombre de micro-organismes par unité de volume de matériel biologique. Elle est exprimée en UFC – unités formant colonie. Une telle unité est une cellule ou un groupe de cellules capable de produire une colonie bactérienne visible.

Si le résultat de la culture bactérienne est positif, l’étape suivante consiste à déterminer la sensibilité du micro-organisme identifié aux antibiotiques (antibioticogramme). L'étude vous permet de déterminer quels antibiotiques n'auront aucun effet sur les bactéries, lesquels auront un effet faible et lesquels auront une efficacité maximale. [4]

Culture d’urine intermédiaire

Pourquoi est-il recommandé de collecter la partie médiane de l'urine pour une culture bactériologique (bactérienne) ? Nous parlons de l'urine du matin, prélevée au milieu de la miction, on l'appelle la « partie médiane ». C'est-à-dire que la miction commence dans les toilettes, après une ou deux secondes, placez un récipient pour recueillir l'urine, collectez au moins 20 ml (mieux - 50 ml). Le liquide urinaire restant est à nouveau dirigé vers la cuvette des toilettes. Une telle approche permet de considérer les paramètres étudiés de manière plus objective.

Culture d'urine quotidienne

Un test d'urine quotidien, qui évalue l'urine excrétée par le patient sur une période de 24 heures, permet de vérifier l'état fonctionnel des reins et d'évaluer l'excrétion de certaines substances avec le liquide urinaire sur une période de 24 heures. L'urine est collectée dans un grand récipient stérile muni de divisions de mesure (pour déterminer le volume total du matériel collecté).

La première portion « matinale » est rejetée dans les toilettes et l'urine suivante est collectée pendant la nuit dans un grand récipient, qui est conservé au réfrigérateur.

Une fois le prélèvement terminé, le volume obtenu est estimé et l'échantillon d'urine est transporté au laboratoire.

En règle générale, une analyse quotidienne est prescrite pour déterminer le volume total d'urine, de créatinine, d'urée, de protéines, de glucose et d'oxalates. La nécessité de réaliser une culture bactérienne est discutée individuellement avec le médecin.

Culture d'urine chez la femme

Pour la culture bactérienne et les tests de sensibilité aux antibiotiques, les femmes doivent recueillir l’urine du matin dès la première miction après le réveil. Si une femme va aux toilettes plusieurs fois pendant la nuit, le liquide urinaire qui peut être collecté 1 à 2 heures avant l'accouchement au laboratoire doit être collecté pour analyse.

Il est très important de bien laver les organes génitaux et de s’assurer qu’aucune sécrétion vaginale ne pénètre dans les urines. Il est recommandé d'insérer temporairement un tampon intravaginal après la procédure hygiénique pour empêcher les sécrétions vaginales de pénétrer dans l'échantillon d'urine. Il est souhaitable de collecter une portion moyenne de liquide sans interrompre le processus urinaire.

Il n’est pas recommandé de collecter du matériel pour la culture bactérienne pendant les pertes menstruelles actives. Cela se fait généralement avant ou quelques jours après les règles.

Culture d'urine pour hommes

Pour effectuer une culture d’urine bactérienne, les hommes prélèvent un échantillon d’urine en milieu de matinée dès la première miction après le réveil. Important : livrer le matériel au laboratoire dans les plus brefs délais. Il est optimal de le faire dans l'heure.

Avant de collecter du liquide urinaire, vous devez prendre une douche et vous laver soigneusement les organes génitaux. La tête du pénis et le prépuce doivent être lavés avec du savon et de l’eau tiède, puis séchés avec une serviette. Pendant la miction et la collecte de biomatériau, la tête du pénis doit être ouverte. Ces règles simples permettront d'éviter les erreurs dans les résultats de l'examen bactériologique.

Si un homme présente une bactériurie sans certains symptômes, un examen complémentaire lui est alors prescrit pour exclure les pathologies de la prostate.

Une culture d'urine sur un bébé

La culture bactérienne est souvent prescrite aux enfants d’âges différents. Et, si les enfants plus âgés peuvent très bien expliquer toutes les étapes de la collecte d'urine et les réaliser, alors le prélèvement de biomatériau chez de jeunes enfants pose parfois des difficultés.

Afin de collecter la bonne quantité d'urine des bébés, les pharmacies vendent des analyses d'urine spéciales pour enfants - des récipients de 100 ml avec un accessoire spécial à base adhésive hypoallergénique. Il existe différents types de poches pour urinoirs, tout d'abord en fonction du sexe de l'enfant. Le kit est accompagné d'instructions sur la façon d'utiliser le récipient, qui contiennent les recommandations suivantes :

• le bébé doit être soigneusement lavé, sécher la peau avec une serviette douce;
• Après avoir sorti l'urinoir de son emballage, retirez le film protecteur de la partie adhésive ;
• L'enfant est placé sur le dos, jambes écartées, et le récipient est tourné vers l'arrière avec l'encoche antéro-postérieure vers l'arrière pour éviter que des selles accidentelles ne pénètrent dans le récipient principal ;
• si la procédure est effectuée sur un garçon, ses organes génitaux sont abaissés dans l'ouverture spéciale du conteneur ;
• la surface adhésive est légèrement pressée ;
• Si l'intervention est réalisée sur une fille, l'urinoir est collé entre l'anus et les grandes lèvres puis sur la peau périnéale ;
• après fixation, l'enfant est mis en culotte ou couche, pris debout dans les bras, en attendant l'acte urinaire ;
• après la collecte des urines, le collecteur d'urine est décollé, vidé du réservoir dans un récipient de transport stérile et envoyé au laboratoire.

Performance normale

L'ensemencement bactériologique de l'urine implique les étapes suivantes :

• le matériel biologique est semé sur un milieu nutritif ;
• sont élevés en couveuse ;
• les micro-organismes cultivés sont placés dans une boîte de Pétri et cultivés à nouveau ;
• les colonies bactériennes sont séparées les unes des autres et replacées dans les conditions de l'incubateur ;
• le matériau obtenu est soumis à un examen, les micro-organismes sont identifiés et testés pour leur sensibilité aux antibiotiques (quels médicaments antibactériens tueront ces micro-organismes).

Une culture bactérienne urinaire normale détermine l’absence de croissance microbienne dans le biomatériau. Le formulaire de résultats est étiqueté « aucune croissance ». [5]

Élever et abaisser les valeurs

L'interprétation suivante des résultats obtenus dans une culture d'urine bactérienne est couramment utilisée :

• Normal : pas de croissance de flore bactérienne.
• La contamination par des micro-organismes associés a permis l'isolement de faibles titres d'une ou plusieurs espèces bactériennes.
• Le titre des micro-organismes est supérieur à 10*4 CFU/mL, la monoculture est majoritairement déterminée.
• Le processus inflammatoire chronique est caractérisé par une croissance bactérienne mixte.

L'ensemencement bactérien des urines est évalué à la fois qualitativement (par le fait de la présence de l'agent pathogène dans le biomatériau) et quantitativement (par la concentration des micro-organismes détectés).

L'indicateur quantitatif se déchiffre comme suit. Il existe quatre degrés de croissance, ou de contamination, en laboratoire :

• au premier degré, parler de la croissance de colonies uniques (jusqu'à une douzaine) ;
• au deuxième degré, on parle de faible croissance bactérienne, de 10 à 25 colonies ;
• au troisième degré, on trouve de multiples colonies, mais elles sont dénombrables (au moins 50) ;
• au quatrième degré, il y a une croissance continue de colonies, qu'on ne peut compter.

Les totaux de comptages coloniaux en UFC/mL sont interprétés comme suit :

• Si l'indicateur ne dépasse pas 10³ de micro-organismes pour 1 ml d'urine, cela indique l'absence de processus inflammatoire et est souvent une conséquence d'une contamination du biomatériau.
• Si l'indicateur est ¹⁰⁴ bactéries dans 1 ml de biomatériau, alors ils disent que le résultat est douteux. Il est recommandé de répéter la culture bactérienne.
• Si l'indicateur est ¹⁰⁵ bactéries pour 1 ml de biomatériau et plus, cela indique la présence d'une maladie inflammatoire.

L'ensemencement bactérien de l'urine 10 aux 3ème, 4ème, 5ème, 6ème, 7ème degrés peut déjà indiquer l'étiologie (cause) du processus inflammatoire. Dans le même temps, le premier et le deuxième degré de présence de micro-organismes opportunistes n'indiquent souvent qu'une contamination du biomatériau ou une mauvaise collecte d'urine.

Lorsqu'une flore exclusivement pathogène est détectée, toutes les colonies détectées sont comptées, quel que soit leur degré. [6]

Escherichia coli

Escherichia coli en culture d'urine se retrouve le plus souvent dans la cystite : la bactérie est représentative de la microflore intestinale normale, mais des types virulents de ce micro-organisme peuvent pénétrer dans la vessie par l'urètre et provoquer le développement d'un processus inflammatoire.

En cas de cystite, le médecin prescrit en standard une analyse d'urine générale. Une culture bactérienne avec détermination de la sensibilité aux antibiotiques est également réalisée pour déterminer avec précision la présence et le type de bactérie et pour évaluer le médicament antibactérien le plus efficace. Si un grand nombre d'E. coli est détecté, les patients se voient nécessairement prescrire un examen plus détaillé, comprenant une échographie du système urogénital et une cystoscopie.

Enterococcus faecalis

La gélose Enterococcus (Serva ou Difco) ou Oxoid est utilisée pour l'isolement des entérocoques. De nombreux milieux contiennent du chlorure de triphényltétrazolium, qui est décomposé par les entérocoques et les colore en pourpre rosé. Le milieu oxoïde contient des sels biliaires, auxquels les entérocoques sont résistants, ainsi que de l'esculine et du citrate ferrique.

Enterococcus faecalis, ou faecalis, est un type d'entérocoques qui fait partie de la flore intestinale normale. Cependant, les formes pathogènes de bactéries peuvent provoquer le développement de processus inflammatoires infectieux dans les voies urinaires et les organes pelviens. On parle de véritable bactériurie (processus infectieux) si au cours de la culture bactérienne on retrouve au moins ¹⁰⁵ corps microbiens pour 1 ml de liquide urinaire. Si la concentration de micro-organismes est inférieure, on suppose que des bactéries ont pénétré dans l'urine lors d'une collecte inappropriée de matériel à analyser (à condition qu'il n'y ait aucun symptôme de maladie infectieuse).

Statistiquement, Enterococcus faecalis fécal est retrouvé dans 1 à 18 % des cas d'examen bactérien positif. Les autres types de flore entérococcique sont détectés beaucoup moins fréquemment.

Citrobacter coseri

Citrobacter est une bactérie anaérobie facultative à Gram négatif, sporulée, qui fait normalement partie de la flore intestinale opportuniste chez l'homme.

Citrobacter appartient à la famille des Enterobacteriaceae et au type des Proteobacteriaceae. Outre Citrobacter coseri, il existe également Citrobacter freundi, Amalonaticus, Bitternis, Europeus et bien d'autres bactéries. Ce micro-organisme devient le plus souvent l'agent causal d'infections angiogéniques à l'hôpital et de lésions infectieuses du système urinaire, peut provoquer des épidémies de toxicoinfections, de gastro-entérite, de méningite, d'infections purulentes.

La citrobactériose n'est diagnostiquée qu'après une culture bactérienne ou d'autres tests de laboratoire spécialisés.

Klebsiella pneumoniae en culture d'urine

Klebsiella pneumoniae appartient aux bactéries pathogènes opportunistes anaérobies facultatives à Gram négatif, normalement présentes dans l'intestin, la cavité buccale, sur la peau humaine. Ce micro-organisme ne forme pas de spores, est immobile, capable de former des capsules.

Le nombre de Klebsiella pneumoniae peut augmenter rapidement au cours du développement de l'infection, ainsi qu'après une longue cure d'antibiothérapie, lorsqu'il y a suppression non seulement de la flore pathogène, mais également de la flore intestinale normale (Klebsiella, staphylocoques, entérocoques, etc. ). Pour le système urinaire, Klebsiella est toujours une bactérie pathogène et résulte souvent d'une infection hospitalière.

Culture d'urine pour les champignons

Le milieu de Sabouraud au chloramphénicol (400 mg/l) est utilisé pour semer des champignons de type levure. L'incubation des semis a lieu pendant 1 à 2 jours dans certaines conditions de température.

Une culture d'urine d'une personne en bonne santé ne doit pas révéler de champignons. Mais parfois, ils sont encore détectés : ainsi, le candida, la moisissure et le champignon des raies apparaissent souvent dans l'analyse. Ceci est possible en cas d'immunodéficience primaire ou secondaire, d'antibiothérapie inappropriée et de processus infectieux dans le système urogénital.

L'infection fongique la plus courante et la plus fréquemment identifiée est Candida. Chez les femmes, ces champignons résident souvent à l’intérieur du vagin et peuvent traverser l’urètre jusqu’à la vessie. Dans de nombreux cas de muguet, la candidurie est due à une mauvaise collecte d’urine pour examen.

Si la présence de champignons dans le liquide urinaire ne s'accompagne d'aucun symptôme, le médecin peut alors ne pas prescrire de traitement. Cependant, un tel traitement est nécessaire si le patient souffre de diabète sucré, d'immunodéficience, de tuberculose génito-urinaire, si le patient présente un débit urinaire altéré ou un cathéter urinaire.

Culture d'urine pour les bactériophages

Les bactériophages sont des virus qui « mangent » des bactéries. Ce sont des agents naturels non cellulaires capables de pénétrer dans la cellule bactérienne et de l’attaquer de l’intérieur.

Selon le type d'interaction avec les bactéries, on distingue les bactériophages virulents et modérés. Le bactériophage pénètre dans la cellule grâce à des enzymes. Le bactériophage quitte la cellule suite à sa lyse.

La détermination de la sensibilité des micro-organismes aux bactériophages est nécessaire si l'on suppose leur utilisation dans le cadre d'une thérapie complexe.

Culture d'urine pour Mycobacterium tuberculosis

La tuberculose est une pathologie courante qui touche aussi bien les humains que les animaux. Les agents responsables de la maladie sont des bactéries aérobies du genre Mycobacterium, vivant dans l'eau et le sol. La tuberculose est le plus souvent causée par Mycobacterium tuberculosis, moins souvent par Mycobacterium bovis. Les deux micro-organismes sont très résistants à l'environnement extérieur et peuvent provoquer le développement de la maladie même plusieurs années après l'infection. Il est important que les mycobactéries tuberculeuses soient capables de former des formes L spécifiques, qui confèrent une immunité antituberculeuse.

De nombreuses techniques de diagnostic en laboratoire de la maladie sont connues. Il s'agit de l'examen microscopique des frottis par crachats, de l'analyse immunoenzymatique et de la méthode de culture classique. Lors du semis d'urine sur un milieu nutritif, les colonies cultivées sont utilisées pour déterminer la sensibilité aux antibiotiques.

Normalement, il ne devrait y avoir aucune mycobactérie dans l’urine. Leur présence est considérée comme un résultat positif du diagnostic de tuberculose.

Culture d'urine pour l'uréeplasma

L'uréeplasmose est une infection causée par un agent pathogène tel que l'uréeplasma. Ces micro-organismes parasitent le système urogénital, les voies respiratoires d'une personne. Les propriétés microbiologiques et la structure de l'uréeplasma ont beaucoup en commun avec les mycoplasmes. Ce sont des bactéries conditionnellement pathogènes, normalement présentes et chez les personnes en bonne santé. De fortes concentrations d'uréeplasma peuvent provoquer le développement de diverses pathologies, de la cystite à la pneumonie.

Le diagnostic de culture sous forme de culture bactérienne d'urine permet en outre de déterminer la sensibilité du microbe aux antibiotiques. En plus de la culture bactérienne, des méthodes microscopiques et sérologiques, un examen biologique moléculaire de l'urine, des sécrétions de la prostate, du sperme, etc. peuvent être utilisés.

Culture d'urine pour Staphylococcus aureus.

Staphylococcus aureus est un groupe de bactéries répandues dans la nature, combinant des formes saprophytes et pathogènes de micro-organismes avec divers degrés de pathogénicité et de virulence.

Pour l'isolement des staphylocoques, on utilise de la gélose jaune-sel, de la gélose lait-sel ou un milieu commercial spécial (gélose staphylococcique).

L'ensemencement bactérien des urines est prescrit lorsque des lésions infectieuses sont suspectées : l'étude détermine avec une grande précision l'agent causal et sa quantité. Parmi les staphylocoques présents dans l'urine, staphylococcus epidermidis et aures sont le plus souvent détectés - Staphylococcus aureus. Ce dernier appartient à la flore coccique à Gram positif, il a une large distribution et est souvent détecté même chez les personnes en bonne santé (environ une personne sur quatre). Staphylococcus aureus est capable de provoquer le développement de maladies infectieuses telles que la septicémie, la péritonite, les pathologies dermatologiques purulentes, les infections génito-urinaires, la pneumonie.

La présence de Staphylococcus epidermidis dans une culture d'urine peut nécessiter une détermination de la sensibilité aux antibiotiques tels que la vancomycine, les macrolides, les bêta-lactamines, les aminosides et les fluoroquinolones. Cependant, le traitement n'est pas toujours prescrit :

• Si la concentration de staphylocoques dans les urines est inférieure à 1 000 UFC par ml, cela indique l'absence de foyer infectieux-inflammatoire dans l'organisme ;
• Si l'indicateur est de 1 000 à 100 000 CFU par ml, une nouvelle culture bactérienne est prescrite ;
• Si l'indicateur est supérieur à 100 000 UFC par ml, un traitement est alors obligatoirement prescrit.

Culture d'urine pour le streptocoque.

Les streptocoques sont ensemencés sur milieu gélose Columbia additionné de sang défibriné, d'acide nalidixique et de colistine. Outre les streptocoques, des staphylocoques à coagulase positive sont isolés sur ce milieu.

Seuls les streptocoques viridans sont reconnus comme étant favorables au système urogénital. Leur présence dans les urines peut donc être considérée comme normale. La majorité des lésions infectieuses se développent lorsqu'elles sont affectées par le streptocoque du groupe A. Chez l'homme, l'agent pathogène peut provoquer une glomérulonéphrite, une vascularite, une inflammation rouillée, un impétigo, etc. Le streptocoque du groupe B affecte le plus souvent le tractus génito-urinaire : chez l'homme, la bactérie se trouve dans l'urètre et chez la femme, à l'intérieur du vagin.

Les streptocoques provoquent principalement des infections simples, moins souvent compliquées (lorsqu'ils sont affectés par les streptocoques du groupe B).

Culture d'urine pour flore opportuniste

La plupart des bactéries, micro-organismes, champignons et protozoaires appartiennent à la catégorie des pathogènes conditionnels. Autrement dit, ils font partie de la biocénose normale - la microflore du vagin et des intestins. Toutefois, ils ne sont non pathogènes que si leur nombre ne dépasse pas certaines limites. Si ces micro-organismes opportunistes deviennent trop nombreux, un processus infectieux se développe.

La flore opportuniste comprend les entérobactéries, les micro-organismes Gram négatifs non fermentants, les staphylocoques, les entérocoques et les champignons. Une quantité adéquate de cette flore ne nécessite pas de traitement, il n'est pas nécessaire de s'en débarrasser complètement.

Culture d'urine pour bactériurie asymptomatique

La bactériurie asymptomatique est une affection dans laquelle la présence anormale de bactéries dans l'urine est détectée, mais il n'y a aucun symptôme externe.

La bactériurie asymptomatique est dans de nombreux cas inappropriée à traiter car elle entraîne rarement des complications. De plus, une telle thérapie peut s’avérer difficile. L’antibiothérapie prescrite peut perturber davantage l’équilibre bactérien dans l’organisme, ce qui peut entraîner une prolifération microbienne, qui sera de plus en plus difficile à traiter.

Le traitement ne peut être prescrit que dans de tels cas de bactériurie asymptomatique :

• quand tu es enceinte;
• après une greffe de rein ;
• pour les conditions d’immunodéficience ;
• pour le reflux urinaire ;
• avant la résection transurétrale de la prostate.

La décision de traiter est prise par le médecin traitant.

Combien de jours faut-il faire une culture d’urine ?

La culture bactérienne de l'urine est un test très informatif. Cependant, cela présente un certain inconvénient : l'attente du résultat est longue. L'ensemencement bactérien s'effectue par étapes, chaque étape dure plusieurs heures. En général, l’étude peut durer de 5 à 7 jours, parfois jusqu’à dix jours.

Traitement

Les mesures thérapeutiques après une culture d'urine bactérienne ne sont pas toujours appropriées. Par exemple, en cas de bactériurie asymptomatique, un traitement antibiotique n’est pas nécessaire.

Normalement, le liquide urinaire est stérile et exempt de micro-organismes. Cependant, dans certaines conditions, des bactéries peuvent s'y multiplier - par exemple, cela arrive souvent chez les diabétiques et les femmes sexuellement actives.

Chez les hommes, une bactériurie asymptomatique n'est pas souvent observée. Cependant, même ici, le traitement n'est pas prescrit tant que le patient n'a pas été entièrement examiné et diagnostiqué - par exemple, la cause chez les hommes est souvent une prostatite bactérienne.

Pourquoi la présence de bactéries dans une culture d’urine sans symptômes cliniques n’est-elle pas une raison pour prescrire des antibiotiques ?

La bactériurie asymptomatique n'entraîne généralement pas de complications et n'affecte pas le développement de pathologies rénales et génito-urinaires.

Les antibiotiques éliminent presque immédiatement la bactériurie, mais après quelques mois le problème réapparaît : ainsi, une antibiothérapie sans éliminer la cause des bactéries présentes dans l'urine devient non seulement inutile, mais aussi nocive, car elle menace le développement de résistances de micro-organismes.

La culture de bactéries en l’absence de symptômes nécessite un traitement :

• quand il s'agit d'une femme enceinte ;
• si le patient a reçu une greffe de rein ;
• Si le patient doit subir une chirurgie génito-urinaire (par exemple, adénomectomie transurétrale).

Dans de telles situations, des traitements antibiotiques de courte durée sont indiqués - par exemple, des antibiotiques fosfomycine (Monural), pénicilline ou céphalosporine (Suprax, Amoxiclav) peuvent être prescrits.

Dans tous les cas, lorsqu'un patient subit une culture bactérienne d'urine avec détermination de la sensibilité aux antibiotiques, on suppose que le médicament auquel les micro-organismes détectés sont les plus sensibles est utilisé.