Systèmes de défense gastro-intestinaux: comment fonctionnent-ils?

Alexey Krivenko, réviseur médical, éditeur
Dernière mise à jour : 04.07.2025
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Le tube digestif est quotidiennement en contact avec une multitude de substances étrangères: aliments, microbes, toxines et médicaments. Physiologiquement, il s’agit d’une « agression » constante qui pourrait endommager le milieu intérieur de l’organisme sans les systèmes de défense complexes. Les études récentes soulignent que l’intégrité de la muqueuse gastro-intestinale est maintenue simultanément par plusieurs couches de défense, et que les altérations de ces couches sont à l’origine de nombreuses maladies, allant des ulcères peptiques aux maladies inflammatoires de l’intestin. [1]

Classiquement, plusieurs barrières clés sont distinguées. Il s'agit notamment des facteurs pré-épithéliaux (mucus, bicarbonate, phospholipides), de la couche épithéliale elle-même avec ses jonctions intercellulaires serrées, de la couche sous-muqueuse richement vascularisée, ainsi que du système immunitaire et du microbiote intestinal. Ce système multicouche permet la neutralisation simultanée de l'acidité et des enzymes, limitant ainsi la pénétration des toxines et régulant la réponse inflammatoire. [2]

Les aliments ingérés transportent non seulement des nutriments, mais aussi des allergènes potentiels, des composants bactériens et des produits de l'oxydation des graisses. Une théorie nutritionnelle adéquate et les recherches modernes sur la fonction barrière soulignent que la nutrition doit être considérée comme une combinaison de bénéfices et du risque constant de pénétration d'antigènes et de toxines, risque compensé par les systèmes protecteurs de la muqueuse. [3]

Lorsque l’une ou plusieurs couches de défense sont affaiblies, la perméabilité de la muqueuse augmente, l’inflammation s’intensifie et la composition du microbiote se modifie. Ceci est associé à un risque accru d’ulcères peptiques, de complications liées à l’utilisation d’anti-inflammatoires non stéroïdiens, de maladies inflammatoires de l’intestin et d’affections systémiques dans lesquelles la barrière intestinale agit comme un facteur déclenchant une inflammation chronique. [4]

L’objectif de cet article est de comprendre quels composants constituent les défenses du tractus gastro-intestinal, comment fonctionnent les barrières muqueuses et épithéliales, quel rôle jouent le système immunitaire et le microbiote, les dangers des médicaments et de certains facteurs liés au mode de vie, et comment maintenir une fonction de barrière normale grâce à la nutrition et aux habitudes quotidiennes. [5]

Tableau 1. Principaux niveaux de protection du tube digestif

Niveau de protection Composants principaux Rôle clé
Éclairé Mucus, bicarbonate, peptides antimicrobiens Neutralise l'acidité, protège contre les toxines et les microbes
Épithélium Cellules épithéliales, jonctions serrées Limiter la pénétration des substances dans l'environnement interne
Sous-muqueuse Flux sanguin, matrice intercellulaire Nutrition des tissus, élimination des ions hydrogène et des toxines
Immunitaire Tissu lymphoïde intestinal, immunoglobuline A Défense immunitaire sélective et tolérance
Microbiote Microorganismes commensaux Compétition avec les agents pathogènes, régulation de l'immunité

[6]

Barrière muqueuse: mucus, bicarbonate et facteurs de surface

La première ligne de défense est la couche de mucus qui recouvre la surface de l'estomac et des intestins. Ce mucus est une structure gélatineuse composée de mucines, de phospholipides et d'eau qui forme une barrière physique entre le contenu agressif de la lumière intestinale et l'épithélium. Les recherches montrent que, dans des conditions normales, le mucus gastrique forme une « couverture » relativement continue capable de piéger les ions hydrogène, la pepsine et d'autres facteurs potentiellement nocifs. [7]

Un élément clé de ce système est la sécrétion d'ions bicarbonate par les cellules épithéliales superficielles. Le bicarbonate est retenu dans la couche de mucus, créant un microenvironnement au pH quasi neutre à la surface cellulaire, même dans le milieu très acide de la lumière gastrique. Cette combinaison de mucus et de bicarbonate est décrite comme une barrière pré-épithéliale, qui réduit considérablement le risque de rétrodiffusion des ions hydrogène et de lésions épithéliales. [8]

La sécrétion de mucus et de bicarbonate est régulée par un ensemble complexe de signaux. Les prostaglandines, l'acétylcholine, l'irritation locale par l'acide et le contact mécanique avec le bol alimentaire jouent un rôle important. Les prostaglandines réduisent simultanément la sécrétion acide, augmentent la sécrétion de mucus et de bicarbonate et accroissent le flux sanguin muqueux, ce qui en fait des médiateurs clés de la cytoprotection. [9]

La barrière muqueuse est importante non seulement dans l'estomac, mais aussi dans les intestins. Le gros intestin possède une structure muqueuse multicouche: la couche interne est relativement dense et pratiquement dépourvue de bactéries, tandis que la couche externe est plus lâche et abrite le microbiote. La perturbation de cette structure muqueuse est associée à une perméabilité accrue, au développement d'une inflammation et à des modifications de la composition du microbiote dans diverses maladies intestinales. [10]

Enfin, la barrière de surface comprend des phospholipides et des molécules tensioactives, ainsi que des peptides antimicrobiens sécrétés par les cellules de la muqueuse. Ces éléments peuvent endommager les membranes des bactéries et des virus, réduisant ainsi leurs chances d’adhérer à l’épithélium. Ensemble, le mucus, le bicarbonate, les phospholipides et les facteurs antimicrobiens forment un film protecteur dynamique et constamment renouvelé. [11]

Tableau 2. Composition et fonctions de la barrière muqueuse

Composant Source principale Fonctions principales
Mucines Cellules caliciformes et superficielles Formation de gel, protection mécanique
Bicarbonate Cellules épithéliales de surface Neutralisation des ions hydrogène dans la couche de mucus
Phospholipides Épithélium et sécrétion de mucus Réduction de la tension superficielle, protection des membranes
peptides antimicrobiens Entérocytes, cellules de Paneth Dommages aux membranes microbiennes, contrôle du microbiote
Eau Débit sanguin et contenu luminal Assurer la viscosité et le transport dans la couche de mucus

[12]

La barrière épithéliale et le rôle du flux sanguin

Sous la couche de mucus se trouve la barrière épithéliale, une monocouche de cellules reliées par des jonctions serrées. Malgré son apparente finesse, elle constitue une défense très efficace. Les jonctions serrées limitent la pénétration intercellulaire des ions, de l'eau et des substances dissoutes, tandis que les membranes des entérocytes et des cellules de l'estomac contiennent des systèmes de transport spécialisés qui contrôlent quelles molécules peuvent pénétrer dans l'organisme. [13]

L’épithélium de l’estomac et des intestins se renouvelle constamment. Dans l’intestin grêle, un cycle complet de renouvellement des cellules villositaires dure environ quelques jours. Si certaines cellules sont endommagées par l’acide, les acides biliaires ou des facteurs mécaniques, les cellules voisines migrent rapidement et comblent la brèche; ce processus est appelé restitution épithéliale. Cette structure à régénération rapide réduit considérablement le risque de lésions profondes. [14]

Un facteur protecteur essentiel est une vascularisation muqueuse adéquate. Une bonne vascularisation assure l’apport d’oxygène et de nutriments, ainsi que l’élimination des ions hydrogène et des toxines ayant pénétré l’épithélium. Des études montrent qu’une réduction du débit sanguin, par exemple lors d’une hypotension systémique, d’un choc ou d’une ischémie locale, augmente considérablement la sensibilité de la muqueuse à l’acidité et aux médicaments. [15]

Les canaux et transporteurs ioniques présents sur les membranes apicale et basolatérale des cellules épithéliales participent également à la défense de l'organisme. Les échangeurs sodium-hydrogène, les canaux chlorure et les transporteurs de bicarbonate contribuent au maintien d'une acidité optimale de la muqueuse, régulent le volume du mucus et participent à l'élimination des ions agressifs. Des dysfonctionnements de ces canaux sont associés à plusieurs maladies de la muqueuse gastrique et intestinale. [16]

Un aspect important est la coordination entre la barrière épithéliale et le système neuroendocrinien intestinal. Les cellules endocrines de la muqueuse sécrètent des dizaines d'hormones et de substances apparentées qui régulent la motilité, la sécrétion, le flux sanguin et les processus de régénération. La théorie de la nutrition adéquate a mis l'accent sur le rôle de ce « flux régulateur » comme élément protecteur reliant l'apport alimentaire et l'adaptation des systèmes de défense. [17]

Tableau 3. La barrière épithéliale: ce qui la renforce et ce qui l’endommage

Facteur Effet sur l'épithélium Exemples
Flux sanguin normal Favorise la régénération et l'élimination des toxines Pression artérielle adéquate, absence d'ischémie sévère
Prostaglandines Augmentation du flux sanguin et de la sécrétion de mucus Synthèse basale des prostaglandines muqueuses
Acide agressif Provoque des dommages lorsque les barrières sont affaiblies. Sécrétion excessive d'acide, reflux
ischémie locale Défenses affaiblies, risque de nécrose Choc, maladies cardiovasculaires graves
contrainte mécanique Dommages superficiels, besoin de dédommagement Aliments durs, corps étrangers

[18]

Défense immunitaire et microbiote intestinal

La muqueuse gastro-intestinale est le plus grand organe immunitaire de l'organisme. Elle contient un tissu lymphoïde abondant, appelé « tissu lymphoïde associé à l'intestin », qui comprend les plaques de Peyer, les follicules lymphoïdes solitaires, les lymphocytes intraépithéliaux et les plasmocytes. Ces structures assurent à la fois une défense active contre les agents pathogènes et le développement d'une tolérance aux aliments et aux microbes commensaux. [19]

L’immunoglobuline A est la principale immunoglobuline sécrétée par la muqueuse. Sécrétée dans la lumière intestinale, elle se lie aux bactéries, aux virus et aux toxines, empêchant leur fixation à l’épithélium. L’immunoglobuline A agit en douceur, sans provoquer d’inflammation excessive, contribuant ainsi au maintien d’un équilibre délicat entre protection et tolérance aux antigènes alimentaires. Des anomalies de la synthèse de l’immunoglobuline A et de la structure du tissu lymphoïde sont associées à un risque accru d’infections et de maladies inflammatoires. [20]

Le microbiote intestinal constitue une autre barrière de défense importante. Les micro-organismes commensaux entrent en compétition avec les pathogènes pour les nutriments et les sites d'adhérence, produisent des substances à activité antimicrobienne, régulent la maturation du système immunitaire et influencent la synthèse du mucus. Des études récentes soulignent que les métabolites microbiens, tels que les acides gras à chaîne courte, renforcent cette barrière en augmentant l'expression des protéines des jonctions serrées et en stimulant la régénération épithéliale. [21]

Lorsque le microbiote est perturbé, par exemple après une utilisation prolongée d'antibiotiques ou un régime occidental riche en graisses et en sucres et pauvre en fibres alimentaires, la perméabilité intestinale et l'inflammation systémique augmentent. Cette condition est souvent décrite comme une « perméabilité intestinale accrue ». Des données scientifiques établissent un lien entre cette perméabilité et le risque de maladies inflammatoires de l'intestin, de troubles métaboliques, voire de dysfonctionnement du système nerveux central. [22]

Le système immunitaire et le microbiote fonctionnent comme un seul système. Les cellules immunitaires de la muqueuse réagissent à la composition du microbiote, et ce dernier, à son tour, est influencé par les réponses immunitaires et la composition du mucus. Les interventions visant à restaurer le microbiote — modifications alimentaires, probiotiques, prébiotiques et, dans certains cas, transplantation de microbiote fécal — sont considérées comme des approches prometteuses pour rétablir la fonction de barrière dans certaines maladies. [23]

Tableau 4. Éléments de la défense immunitaire et du microbiote

Composant système Rôle dans la défense
Tissu lymphoïde intestinal La reconnaissance de l'antigène déclenche la réponse immunitaire et la tolérance.
Immunoglobuline A Bloquer les microbes et les toxines à la surface des muqueuses
Lymphocytes intraépithéliaux Surveillance de l'état de l'épithélium et réponse rapide aux lésions
Microbiote commensal Compétition avec les agents pathogènes, synthèse de métabolites protecteurs
Acides gras à chaîne courte Renforcement des jonctions serrées et régénération épithéliale

[24]

Régulation des systèmes de défense: facteurs nerveux, hormonaux et locaux

Les systèmes de défense gastro-intestinaux ne sont pas statiques; ils s’adaptent constamment à la composition et au volume des aliments, à l’état de l’organisme et aux influences extérieures. Ce processus implique le système nerveux autonome, le système nerveux entérique, les hormones et les médiateurs locaux. L’activation parasympathique augmente généralement la sécrétion de mucus et de bicarbonate, stimule la motilité et le flux sanguin, préparant ainsi la muqueuse à l’ingestion d’aliments. [25]

Les hormones gastro-intestinales, telles que la gastrine, la sécrétine, la cholécystokinine et bien d'autres, coordonnent les processus digestifs et protecteurs. Elles régulent la sécrétion d'acide, d'enzymes et de bile, assurent une motilité coordonnée et influencent le flux sanguin. La théorie de la nutrition adéquate souligne que le système endocrinien intestinal constitue un puissant « flux régulateur » de signaux reliant les stimuli alimentaires et l'adaptation des mécanismes de barrière. [26]

Les prostaglandines occupent une place particulière. Ces médiateurs locaux sont synthétisés dans la muqueuse et exercent un puissant effet cytoprotecteur: ils réduisent la sécrétion acide, augmentent la sécrétion de mucus et de bicarbonate, améliorent le flux sanguin et stimulent la régénération épithéliale. La suppression de la synthèse des prostaglandines lors de l’utilisation d’anti-inflammatoires non stéroïdiens est considérée comme l’un des principaux mécanismes de lésions de l’estomac et du duodénum. [27]

Des facteurs locaux, notamment les produits du métabolisme microbien, les cytokines et les chimiokines, modulent l'équilibre entre les réponses anti-inflammatoires et pro-inflammatoires. Une stimulation modérée maintient une inflammation physiologique de bas niveau, nécessaire au renouvellement normal de la muqueuse. Un excès chronique de signaux pro-inflammatoires entraîne des lésions de la barrière muqueuse et un risque de développer des maladies inflammatoires chroniques. [28]

De plus, les hormones de stress systémiques, telles que les glucocorticoïdes et les catécholamines, influencent le système immunitaire. Un stress de courte durée peut modifier la distribution du flux sanguin et altérer temporairement la motilité intestinale, tandis qu'un stress prolongé et intense peut contribuer au développement d'ulcères induits par le stress, notamment lorsqu'il est associé à d'autres facteurs de risque. Ceci souligne une fois de plus que la défense gastro-intestinale dépend non seulement de facteurs locaux, mais aussi de facteurs systémiques. [29]

Tableau 5. Principaux facteurs de régulation des systèmes de protection

Facteur Source Son action principale porte sur la protection de la muqueuse.
Nerfs parasympathiques Nerf vague et neurones locaux Augmentation de la sécrétion de mucus et de bicarbonate, motilité
Hormones de l'estomac et des intestins Cellules endocrines de la muqueuse Régulation de la sécrétion, de la motilité et du flux sanguin
Prostaglandines Cellules de la muqueuse Cytoprotection, augmentation du flux sanguin et régénération
Cytokines et chimiokines Cellules immunitaires et épithéliales Ajuster la réponse inflammatoire
Hormones du stress Glandes surrénales et système nerveux Modifications du flux sanguin et de la sensibilité aux lésions

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Facteurs qui endommagent les défenses du tube digestif

Lorsque l’équilibre entre les facteurs agressifs et les défenses immunitaires est perturbé, la muqueuse est endommagée. Parmi les facteurs agressifs classiques, on retrouve l’acide et la pepsine dans l’estomac, les acides biliaires et les enzymes pancréatiques dans l’intestin, ainsi que l’alcool, le tabac et certains médicaments. Si les défenses immunitaires sont affaiblies, ces facteurs peuvent provoquer des érosions et des ulcères. [31]

Les anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS) sont l'une des causes les plus fréquentes de lésions médicamenteuses de la muqueuse gastrique et duodénale. Ils inhibent les enzymes cyclooxygénases et réduisent la synthèse des prostaglandines, ce qui entraîne une diminution de la sécrétion de mucus et de bicarbonate, une réduction du flux sanguin et un retard de régénération. Des études récentes soulignent que l'utilisation de ces médicaments augmente significativement le risque d'ulcères et d'hémorragies gastro-intestinales, notamment chez les personnes âgées et en cas d'association avec des anticoagulants. [32]

L’infection à Helicobacter pylori altère les mécanismes de protection de l’estomac et du duodénum. La bactérie modifie la structure du mucus, produit des toxines et provoque une inflammation chronique qui, associée à l’acidité et à d’autres facteurs, contribue à la formation d’ulcères. Les recommandations actuelles considèrent l’éradication de cette infection comme une étape essentielle dans la prévention des récidives d’ulcères gastroduodénaux. [33]

Dans les maladies inflammatoires de l'intestin telles que la rectocolite hémorragique et la maladie de Crohn, les jonctions serrées entre les cellules sont altérées, la composition du mucus et du microbiote se modifie, et la perméabilité aux antigènes et aux bactéries augmente. Plusieurs études soulignent que le maintien à long terme de la rémission est associé non seulement au contrôle de l'inflammation, mais aussi à la restauration des éléments structuraux de la barrière intestinale. [34]

Enfin, l’alimentation et le mode de vie peuvent à la fois renforcer et affaiblir le système immunitaire. Un régime riche en aliments ultra-transformés, en alcool et en graisses saturées, et pauvre en fibres alimentaires et en nutriments essentiels à la régénération, est associé à une perméabilité accrue de la barrière intestinale et à une inflammation systémique. Le tabagisme, le stress chronique et le manque de sommeil sont également considérés comme des facteurs contribuant aux lésions de la muqueuse. [35]

Tableau 6. Principaux facteurs de dommages aux systèmes de protection et leurs conséquences

Facteur mécanisme de dommage Conséquences possibles
Anti-inflammatoires non stéroïdiens Diminution des prostaglandines, diminution du mucus et du flux sanguin Ulcères de l'estomac et du duodénum, saignements
Helicobacter pylori Inflammation chronique, modifications du mucus Ulcères, gastrite atrophique, risque de cancer
Alcool Dommages directs à l'épithélium et au mucus Érosions, gastrite, perméabilité accrue
Aliments ultra-transformés Perturbation du microbiote et du mucus Perméabilité accrue, inflammation systémique
Stress chronique Modifications du flux sanguin et des niveaux hormonaux Ulcères induits par le stress, exacerbation des maladies

[36]

Nutrition et mode de vie pour soutenir le système immunitaire

Le maintien des défenses du système digestif est largement lié au mode de vie. La stratégie la plus importante consiste à réduire l’exposition aux facteurs agressifs: arrêter de fumer, modérer sa consommation d’alcool et prendre des anti-inflammatoires non stéroïdiens uniquement lorsque cela est indiqué et sous surveillance médicale, notamment chez les personnes présentant des facteurs de risque d’ulcère gastroduodénal. Si un traitement prolongé est nécessaire, l’utilisation de gastroprotecteurs est envisagée. [37]

D’un point de vue diététique, il est bénéfique de privilégier les aliments peu transformés. Les légumes, les fruits, les céréales complètes, les légumineuses et les aliments riches en fibres alimentaires favorisent un microbiote sain et la production d’acides gras à chaîne courte, qui renforcent l’épithélium et les jonctions serrées. L’intégration d’aliments fermentés, comme certains produits laitiers fermentés, à votre alimentation peut favoriser la diversité du microbiote et améliorer la fonction barrière. [38]

Les nutriments essentiels à la régénération de la muqueuse jouent un rôle particulier: protéines en quantité suffisante, vitamines A, B et D, zinc et de nombreux autres micronutriments. Les carences en protéines et en micronutriments ralentissent le renouvellement de l’épithélium et réduisent sa capacité de cicatrisation. En cas de restrictions alimentaires ou de maladies chroniques, il est conseillé de discuter de votre état nutritionnel avec votre médecin et un nutritionniste. [39]

Les fibres alimentaires et les prébiotiques créent des conditions favorables à la croissance des bactéries bénéfiques, et les probiotiques, dans certains cas, peuvent contribuer à la restauration du microbiote après une antibiothérapie ou dans le traitement de certains troubles fonctionnels. Des études récentes soulignent que le choix des probiotiques doit reposer sur des preuves de l’efficacité d’une souche spécifique pour une affection spécifique, plutôt que sur le principe général selon lequel « plus il y a de bactéries, mieux c’est » [40].

Enfin, il convient de tenir compte du rôle du mode de vie global. Une activité physique régulière et modérée améliore la circulation sanguine vers les organes, notamment l'intestin, et a un effet positif sur le microbiote. La gestion du stress, un sommeil suffisant et la limitation de la consommation d'aliments ultra-transformés et de sucre contribuent à réduire l'inflammation systémique, favorisant ainsi indirectement la fonction de barrière intestinale. Cette approche globale est plus efficace que de tenter de « renforcer l'estomac » avec un seul complément alimentaire ou un « produit miracle ». [41]

Tableau 7. Régime alimentaire et habitudes favorisant la protection gastro-intestinale

Direction Étapes pratiques
Réduction des facteurs agressifs Limitez votre consommation d'alcool, ne fumez pas et n'abusez pas des analgésiques.
Soutien du microbiote Plus de légumes, de fruits, de céréales complètes, de légumineuses
Soutien à la régénération Apport suffisant en protéines et en micronutriments; consultez un médecin si nécessaire.
Gérer le stress Techniques de relaxation, normalisation du sommeil
activité physique Pratiquer régulièrement une activité physique modérée, en accord avec votre médecin.

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Brève section de questions-réponses

Est-il possible de « renforcer la barrière muqueuse » uniquement par des compléments alimentaires, tels que des probiotiques ou des médicaments spécifiques?
La plupart des études suggèrent que, sans modification du régime alimentaire et du mode de vie, l’efficacité de ces compléments sera limitée. Les probiotiques et les nutraceutiques peuvent constituer un élément utile d’une stratégie pour certaines affections, mais la base de la protection demeure une alimentation équilibrée, l’évitement des mauvaises habitudes et la maîtrise des facteurs de risque tels que les anti-inflammatoires non stéroïdiens et la bactérie Helicobacter pylori. [43]

Qu’entend-on par « perméabilité intestinale accrue » et quelle est la validité scientifique de ce terme?
La littérature scientifique utilise les termes « perméabilité accrue » ou « altération de la fonction barrière » pour décrire des affections caractérisées par un affaiblissement des jonctions serrées entre les cellules, permettant ainsi aux molécules et aux microbes de traverser plus facilement la muqueuse intestinale. Ce phénomène est mesurable par des tests en laboratoire et est effectivement associé à de nombreuses maladies. Cependant, l’image courante de l’« intestin perméable » simplifie souvent à l’excès le problème et est associée à un très large éventail d’affections sans preuves suffisantes. [44]

Quand est-il essentiel de consulter un médecin en raison d'un possible trouble du système immunitaire gastro-intestinal?
Les raisons d'une consultation urgente comprennent les douleurs abdominales accompagnées de sang dans les selles ou de selles noires et goudronneuses, les vomissements de sang, les douleurs abdominales soudaines et intenses, une perte de poids importante, une diarrhée ou une constipation persistante, et l'apparition de symptômes nocturnes. Ces signes peuvent indiquer des lésions ou des complications graves de la muqueuse et nécessitent un examen approfondi. [45]

Est-il pertinent pour une personne en bonne santé de subir un test de perméabilité intestinale?
Actuellement, la plupart des tests de perméabilité restent des outils de recherche ou sont utilisés dans des situations cliniques spécifiques. Pour une personne en bonne santé ne présentant aucun symptôme alarmant, les recommandations générales en matière d’alimentation et d’hygiène de vie sont bien plus importantes que de tenter d’interpréter des indicateurs de perméabilité individuels en dehors d’un contexte clinique. [46]

Comment résumer brièvement le principe fondamental de la prise en charge du système immunitaire gastro-intestinal?
L’idée principale est de réduire les agressions persistantes et de favoriser la régénération de la muqueuse. Cela implique une alimentation équilibrée composée d’aliments complets, un contrôle médicamenteux rigoureux, l’arrêt du tabac, une consommation modérée d’alcool, une attention particulière portée au microbiote et une consultation médicale rapide en cas de symptômes inquiétants. Cette approche globale permet au système immunitaire de fonctionner de manière optimale, réduisant ainsi significativement le risque d’ulcères gastroduodénaux et d’affections inflammatoires chroniques. [47]