Yaourt et sources chaudes: comment l'alimentation et l'environnement modifient ensemble l'écosystème intestinal et les selles chez les adultes en bonne santé

Le microbiote intestinal réagit à la fois à votre assiette et à votre environnement. Nous connaissons bien les effets des aliments fermentés, mais l'impact des habitudes « hors cuisine » – comme les bains réguliers dans des sources minérales – sur les microbes et le transit intestinal est mal compris. Des chercheurs japonais ont mené un essai contrôlé randomisé et comparé trois scénarios: aucun changement, yaourt le soir et yaourt associé à un bain dans une source chaude chlorée. En résumé: le yaourt a augmenté la diversité du microbiote et enrichi un certain nombre de taxons « bénéfiques », tandis que l'ajout d'une source chaude n'a pas modifié significativement le microbiote, mais a entraîné la plus forte amélioration numérique du transit intestinal (bien que sans signification statistique stricte).

Contexte de l'étude

Le microbiote intestinal est un écosystème dynamique, influencé simultanément par l'alimentation et l'environnement. De nombreuses données existent sur les aliments fermentés, notamment le yaourt: une consommation régulière peut accroître la diversité microbienne, renforcer la barrière hémato-encéphalique, moduler les réponses immunitaires et, plus généralement, améliorer le bien-être gastro-intestinal. Cependant, les facteurs « hors de la cuisine » ont été beaucoup moins étudiés. Au Japon, les sources chaudes minérales sont une pratique courante, et les sources chlorées (avec ≥ 1 g/kg d'ions chlorure) sont parmi les plus accessibles et sont reconnues pour leurs bienfaits sur la circulation sanguine et le tonus général. Cependant, il n'existe pratiquement aucune preuve des effets de ces bains sur le microbiote, et les observations isolées (par exemple, la croissance de Bifidobacterium bifidum après une semaine de bains onsen au bicarbonate) semblent encore préliminaires. Dans ce contexte, l'idée de combiner une intervention « diététique » (le yaourt) et une intervention « environnementale » (la source de chlorure) et d'observer comment elles affectent, individuellement et conjointement, le microbiote et les selles chez des personnes en bonne santé semble une étape logique.

Les auteurs de l'étude partent d'une hypothèse simple: le yaourt, produit fermenté contenant Lactobacillus/S. thermophilus, est un facteur compréhensible de modifications microbiennes, tandis qu'une source chaude peut affecter la physiologie intestinale par des « voies de contournement » (relaxation, hydratation, hémodynamique périphérique), que le séquençage 16S détecte moins bien. Ensemble, ces volets peuvent être complémentaires: l'un concerne la « composition microbienne », l'autre la « fonction intestinale ». Par conséquent, l'étude comprenait une évaluation du profil microbien et du bien-être de la défécation (questionnaire sur la fréquence, la consistance, la sensation de vidange incomplète, etc.).

Un autre motif est l'aspect pratique. Si des habitudes quotidiennes accessibles peuvent améliorer l'écologie intestinale, il s'agit d'un outil de santé publique potentiellement évolutif. Mais pour une évaluation juste, la randomisation, le contrôle et des protocoles comparables sont nécessaires. Ici, ils ont été fournis: des adultes en bonne santé, non « nourris » de probiotiques et sans onsen récent, ont été répartis en trois groupes (témoin; yaourt du soir 180 g; yaourt + bain dans une source de chlorure de sodium au moins une fois tous les deux jours, ≥ 15 minutes), observés pendant 4 semaines, avant/après le recueil des selles pour la 16S (V1-V2) et les AGCC (GC-MS) et le remplissage d'un questionnaire. Ce modèle « à deux têtes » nous permet de distinguer les effets microbiens de l'alimentation des modifications fonctionnelles associées au thermalisme.

Enfin, les auteurs sont honnêtes quant aux limites de leurs connaissances: bien que la « thermothérapie » ait été associée dans des études à des bienfaits musculo-squelettiques, dermatologiques et métaboliques, il n’existe aucune preuve systématique que les sources de chlorure modifient la composition du microbiote intestinal; de plus, des travaux préliminaires ont suggéré que l’onsen lui-même pourrait ne pas produire de changements taxonomiques significatifs. D’où la question clé de l’article: une comparaison randomisée révélerait-elle les effets opposés mais bénéfiques de « yaourt → diversité microbienne », « onsen → défécation subjective » et devrait-on s’attendre à une synergie de leur combinaison dans la vie réelle?

Conception et ce qu'ils ont fait exactement

Il s'agit d'un essai contrôlé randomisé (septembre-décembre 2023). Quarante-sept adultes âgés de 20 à 65 ans, n'ayant pas consommé régulièrement de yaourt ni fréquenté de onsen pendant les deux semaines précédant l'intervention, ont été recrutés. Après abandon, 35 participants ont été inclus dans l'analyse: groupe témoin (n = 10), groupe yaourt (n = 14) et groupe yaourt+onsen (n = 9). Pendant quatre semaines, les groupes d'intervention ont consommé 180 g de yaourt Meiji Bulgaria LB81 (L. bulgaricus 2038, S. thermophilus 1131) chaque soir, et le groupe yaourt+onsen s'est en outre baigné dans une source de chlorure de sodium au moins un jour sur deux (≥ 15 minutes; pH 3,6; ~1 446 mg/kg d'ions chlorure). Avant et après, les selles ont été recueillies, l'ARNr 16S (V1-V2) a été séquencé, les acides gras à chaîne courte (AGCC) ont été comptés (GC-MS) et des questionnaires de défécation ont été remplis (14 items; les scores les plus faibles indiquent une aggravation de l'état). Il a été demandé aux participants de ne pas modifier leur mode de vie et d'éviter les autres probiotiques/sources.

Ce qui a été trouvé dans le microbiote: le yaourt « élargit » la diversité

Français Après 4 semaines, seul le yaourt a montré une croissance significative dans les trois mesures de diversité alpha: Shannon (p = 0,0031; q = 0,0062), ASV observés (p = 0,0007; q = 0,0015) et PD de Faith (p = 0,0001; q = 0,0002). Il n'y a eu aucun changement dans le groupe témoin; dans le groupe « yaourt + onsen », il n'y avait qu'une tendance non significative. Selon la taxonomie, plusieurs genres se sont développés dans le « yaourt » (Sellimonas, Eggerthella, Flavonifractor, Ruminiclostridium 9 - passé FDR), et dans la comparaison intergroupe, le « yaourt » avait plus d'Akkermansia, Eggerthella, Ruminiclostridium 9 et Sellimonas et moins de Megasphaera que le témoin. Dans le groupe yaourt + onsen, Lachnoclostridium et Holdemania étaient plus faibles que dans le yaourt pur.

Métabolites dans les selles: aucun changement majeur

Les acides gras à chaîne courte (acétate, propionate, butyrate, etc.) n'ont pas changé significativement dans aucun des groupes. Seule une diminution nominale de l'acide formique a été observée par rapport au yaourt (p = 0,028), qui a disparu après correction pour plusieurs tests (q = 0,364). Aucune différence significative n'a été observée entre les groupes pour les AGCC. Conclusion des auteurs: sur une période de 4 semaines, le yaourt peut légèrement « corriger » les acides organiques individuels, mais le profil global des AGCC est stable.

Défécation: le plus grand « plus » de la combinaison avec les onsen

Le score total de défécation a augmenté dans les groupes « yaourt » et « yaourt + onsen », et dans le groupe témoin – sans amélioration. Selon l'évolution par rapport à la valeur initiale, la moyenne (± écart type) était la suivante: yaourt + onsen +2,89 ± 3,79; yaourt +1,00 ± 4,30; témoin -1,25 ± 3,67. Formellement, les différences intergroupes n'étaient pas significatives (petit échantillon), mais la tendance vers les bienfaits du bain est évidente. Les auteurs concluent prudemment: le yaourt favorise les selles et le onsen chloré peut ajouter un peu plus d'effet; cela devrait être testé sur des cohortes plus importantes.

Comment comprendre cela en termes simples

Le tableau est le suivant: le régime alimentaire (yaourt du soir) augmente assez rapidement la diversité de l'écosystème intestinal et modifie sa composition en faveur de plusieurs taxons associés à un métabolisme sain (dont Akkermansia). Le facteur environnemental (bains minéraux) ne modifie pas sensiblement le microbiote sur 4 semaines, mais il peut améliorer les sensations lors de la défécation, grâce à l'hydratation, au flux sanguin périphérique, à la relaxation ou à d'autres mécanismes non détectés par le séquençage 16S et le panel d'AGCC. Au total, il s'agit de deux facteurs d'influence indépendants sur le bien-être intestinal: l'un concernant les microbes, l'autre le bien-être intestinal.

Informations utiles pour les praticiens et les curieux

• De quel type de yaourt s'agit-il: 180 g de Meiji Bulgaria LB81 (à faible teneur en sucre), souches Lactobacillus bulgaricus 2038 + Streptococcus thermophilus 1131, à prendre tous les soirs après le dîner.
• Source: chlorure de sodium (type NaCl), pH 3,6, environ 1 446 mg/kg de Cl-, ≥ 15 min tous les 1 à 2 jours. Il s'agit d'une immersion en eau minérale, et non d'un sauna.
• Personnes incluses: adultes en bonne santé, sans antibiotiques, sans probiotiques habituels et sans onsen au départ. Analyse finale: 35 personnes (microbiote/métabolites) et 33 personnes par questionnaire de défécation.

Ce que cela signifie (et ce que cela ne signifie pas)

• Oui: une simple habitude de « yaourt le soir » peut augmenter la diversité microbienne chez les individus en bonne santé en 4 semaines et modifier une gamme de taxons associés à la résilience des écosystèmes.
• Possiblement: des bains réguliers dans des sources de chlorure améliorent les selles selon les auto-déclarations, en particulier lorsqu'ils sont associés à du yaourt - mais jusqu'à présent sans statistiques strictes.
• Non: il est trop tôt pour parler de « traitement de la constipation/SIBO/infection du tractus gastro-intestinal », etc. - les participants étaient en bonne santé, le délai était court, les indicateurs étaient le microbiote, les AGCC et un questionnaire, et non des diagnostics cliniques.

Restrictions

Petit échantillon et courte durée; intervention comportementale ouverte; auto-évaluation de la défécation; analyse du microbiote au niveau 16S (sans métagénomique des fonctions); acides gras à chaîne courte (AGCC): uniquement dans les fèces, pas dans la lumière/le sang; étude chez des personnes en bonne santé; la tolérance chez les personnes se plaignant de symptômes nécessite des tests distincts. Les auteurs admettent honnêtement tout cela et préconisent des ECR de plus grande envergure et de plus longue durée.

Que vérifier ensuite

• Plus long et plus: 8 à 12 semaines, n≥100, stratifié par fréquence de selles/régime alimentaire de base et par « amateurs d'onsen ».
• Fonctions et mécanismes: métagénomique shotgun, métabolomique sérique, hormones intestinales, état hydro-électrolytique, axes de stress.
• Clinique: pilotes chez les personnes atteintes de troubles fonctionnels (constipation légère/SII-C): « yaourt vs yaourt+onsen » versus recommandations standards.

L'essentiel en trois points

• Le yaourt a augmenté la diversité microbienne sur 4 semaines et a enrichi plusieurs genres « bénéfiques »; Akkermansia était plus élevé que dans le témoin.
• Les sources chaudes au chlorure n'ont pas modifié de manière significative le microbiote, mais ont produit la plus grande amélioration numérique des selles lorsqu'elles ont été combinées avec du yaourt (pas strictement significatif).
• L’alimentation et l’environnement agissent de manière complémentaire: le « bras microbien » (yaourt) + le « bras fonctionnel » (bain) – ensemble peuvent soutenir le bien-être intestinal.

Source de l'étude: Choi J., Takeda M., Managi S. Modulation alimentaire et environnementale de l'environnement intestinal: le yaourt favorise la diversité microbienne tandis que les sources chaudes chlorées améliorent l'état de défécation chez les adultes en bonne santé. Frontiers in Nutrition, 30 juin 2025; doi:10.3389/fnut.2025.1609102.