Inclusion d'ARN hôte liée à l'infection chronique par l'hépatite E

Si le virus intègre des segments du génome de l’hôte dans sa constitution génétique, l’infection peut devenir chronique.

• Pourquoi l'hépatite E devient-elle chronique chez certains patients, et pourquoi les médicaments ne fonctionnent-ils pas ?

Pour le savoir, une équipe internationale de chercheurs dirigée par des scientifiques de Bochum a observé pendant un an un patient atteint d'une infection chronique par l'hépatite E. Le re-séquençage de l’ARN viral a montré que le virus avait incorporé diverses parties de l’ARNm de l’hôte dans son génome. Cela a abouti à un avantage de réplication qui pourrait contribuer à la chronicité de l'infection.

• L'activation de l'ARN de l'hôte peut prédire la transition d'une infection aiguë à une infection chronique

Dr. Daniel Todt, chef du groupe de recherche en virologie computationnelle, département de virologie médicale et moléculaire, Université de la Ruhr à Bochum, Allemagne

Des chercheurs ont rapporté cela dans la journal Nature Communications.

• Séquençage de la population virale

Environ 20 millions de personnes dans le monde sont infectées par l'hépatite E chaque année. L'infection passe généralement sans conséquences, mais elle peut mettre la vie en danger pour les femmes enceintes ou les personnes dont le système immunitaire est affaibli. Dans certains cas, cela devient chronique. Il n’existe pas de médicaments spécifiques efficaces. Le médicament antiviral à large spectre ribavirine est également utilisé contre l'hépatite E, mais il ne fonctionne pas toujours.

• Comment le virus échappe-t-il au système immunitaire ? Pourquoi l'infection devient-elle chronique et ne disparaît-elle pas ?

Des chercheurs ont analysé pour la première fois l'intégralité des populations virales d'un patient infecté de manière chronique depuis plus d'un an. Ils ont étudié en détail plus de 180 séquences individuelles provenant d'échantillons de sang.

• Réplication en culture cellulaire à l'aide de l'ARN de l'hôte

"Le virus de l'hépatite E possède dans son information génétique une région dite hypervariable, dans laquelle il peut incorporer différentes séquences d'ARN provenant des cellules hôtes", explique Daniel Todt. Son équipe a pu montrer que la composition de cette région a changé de manière significative au cours de la période d'observation. De plus, de nombreuses compositions différentes ont émergé simultanément. Dans des expériences de culture cellulaire, il a été démontré que l’incorporation d’ARN hôte offrait un avantage de réplication : les virus modifiés étaient capables de se répliquer mieux que d’autres. "Nous pensons que cela est en partie responsable de la chronicité de l'infection et de l'échec du traitement", explique Daniel Todt.

• Etude de l'ARN de l'hôte incorporé au virus

Les chercheurs ont analysé la composition de l'ARN hôte incorporé dans le virus pour déterminer s'il existait des caractéristiques communes caractérisant les segments génétiques. "Cependant, nous n'avons trouvé aucune similitude significative", explique Todt. Les séquences génétiques incluses sont pour la plupart celles qui sont très courantes dans les cellules hôtes, indiquant une sélection aléatoire.

• "Il est possible que lors d'une infection par l'hépatite E, il y ait une course entre le virus et le système immunitaire de l'organisme", suggère Daniel Todt.

Si le virus parvient à inclure l'ARN de l'hôte avant que le système immunitaire ne combatte l'infection avec succès, cela peut conduire à une chronicité. "L'ARN hôte dans le génome viral peut, dans tous les cas, servir de biomarqueur dans la phase aiguë de l'infection, indiquant la probabilité précoce d'une chronicité."

• Planifier d'autres études

Les chercheurs prévoient d'étendre leurs études à de plus grandes cohortes de patients.