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Étude: les gènes influencent l'efficacité anticancéreuse des fruits et des fibres
Dernière revue: 02.07.2025
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Une étude récente publiée dans la revue eBioMedicine a identifié des variations génétiques susceptibles de modifier l'association entre la consommation de fibres, de fruits et de légumes et le risque de cancer colorectal (CCR). Les chercheurs ont identifié deux loci significatifs qui modifient l'association entre la consommation de fibres et de fruits et le risque de CCR.
Le cancer colorectal (CCR) est l'un des cancers les plus fréquents au monde, avec près de deux millions de nouveaux cas et plus de 900 000 décès en 2020. Une consommation élevée de fruits, de légumes, de céréales complètes et de fibres alimentaires réduirait le risque de CCR. Bien qu'il existe des preuves solides d'un lien entre le risque de CCR et la consommation de céréales complètes et de fibres alimentaires, les preuves d'un lien entre le risque de CCR et la consommation de fruits et légumes restent limitées.
Des études d'association pangénomique (GWAS) antérieures ont identifié au moins 200 loci associés au risque de CCR, expliquant jusqu'à 35 % de l'héritabilité. Bien que les interactions gène-environnement (G × E) puissent expliquer une héritabilité supplémentaire, les études antérieures portant sur de petits échantillons et utilisant des méthodes traditionnelles n'ont révélé qu'un nombre limité d'interactions significatives. De nouvelles approches statistiques, telles que les tests conjoints et les méthodes en deux étapes privilégiant les polymorphismes nucléotidiques simples (SNP), pourraient améliorer la précision de ces analyses.
Jusqu'à 45 études issues de trois consortiums génétiques du CRC, incluant des personnes d'origine européenne, ont été incluses dans l'analyse. Les études comprenaient des groupes cas-témoins pour les études de cohorte et des groupes témoins sans cancer pour les études cas-témoins. Au total, 69 599, 69 734 et 44 890 participants ont été analysés pour leur consommation de fruits, de légumes et de fibres, respectivement. L'apport alimentaire a été évalué à l'aide de questionnaires sur la fréquence alimentaire et d'historiques alimentaires, généralement exprimés en portions par jour pour les fruits et légumes et en grammes par jour pour les fibres totales.
Les données ont été harmonisées et exprimées en valeurs quartiles par sexe et par étude. De plus, le contrôle qualité du génotypage a consisté à vérifier les données manquantes, l'équilibre de Hardy-Weinberg et l'inadéquation entre les sexes, puis à imputer et filtrer la fréquence et la précision des allèles mineurs, ce qui a permis d'analyser 7 250 911 SNP.
Comparativement aux témoins, les participants atteints de CCR étaient plus âgés, présentaient un indice de masse corporelle et un apport énergétique plus élevés, ainsi qu'une prévalence plus élevée de facteurs de risque tels que des antécédents familiaux de CCR et de diabète de type 2. Ils consommaient également moins de fibres, de fruits et de légumes que les témoins. Des méta-analyses ont révélé une association inverse entre la consommation de fibres (risque relatif par quartile d'augmentation (OR) = 0,79), de fruits (OR = 0,79) et de légumes (OR = 0,82) et le risque de CCR.
Le test 3-DF a identifié le locus rs4730274 en amont du gène SLC26A3, associé à la consommation de fibres et au risque de cancer colorectal. La stratification par génotype a montré une association inverse plus forte entre fibres et cancer colorectal pour chaque copie de l'allèle T. L'annotation fonctionnelle a suggéré une activité amplificatrice dans les tissus du côlon, avec un eQTL pour le gène DLD.
Le locus rs1620977, proche du gène NEGR1, a montré une association significative avec la consommation de fruits et une interaction modérée avec le risque de cancer colorectal. De fortes associations inverses ont été observées avec l'augmentation de la consommation de fruits pour chaque copie de l'allèle G.
Il s'agit de la plus vaste étude G×E à ce jour. Les chercheurs ont identifié deux interactions entre les fibres, la consommation de fruits et le risque de cancer colorectal. Plus précisément, le gène rs4730274, situé près du gène SLC26A3, suggère une association significative entre la consommation de fibres, la fonction intestinale, l'inflammation et le cancer colorectal. Ces résultats appellent à des études complémentaires afin d'examiner les implications cliniques et de confirmer ces résultats dans différentes populations.