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Le microbiote nasal – un biomarqueur diagnostique potentiel du sepsis
Dernière revue: 14.06.2024
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Le microbiote nasal des patients en unité de soins intensifs (USI) distingue efficacement le sepsis des cas non septiques et surpasse l'analyse du microbiote intestinal pour prédire le sepsis, selon une nouvelle étude publiée dans Microbiology Spectrum .
« Ces résultats ont des implications pour le développement de stratégies de diagnostic et les progrès dans le traitement des maladies graves », a déclaré l'auteur correspondant de l'étude, le professeur Jiaolong He, MD, PhD, du centre médical du microbiome, département de médecine de laboratoire, Rujiang. Hôpital, Université médicale du Sud, Guangzhou, Guangdong, Chine.
"Dans le passé, nous avons accordé davantage d'attention au microbiote intestinal des patients atteints de sepsis, mais il convient également de prêter attention au microbiote respiratoire."
La septicémie est une maladie grave avec un taux de mortalité élevé allant de 29,9 % à 57,5 %. Malgré l'établissement de la troisième définition consensuelle internationale du sepsis et du choc septique (Sepsis-3) en 2016, de nombreux aspects du sepsis nécessitent encore des études plus approfondies pour améliorer son diagnostic.
L'évolution des critères de diagnostic de Sepsis-1 à Sepsis-3 montre la nécessité de poursuivre les recherches. De plus, les critères de diagnostic du sepsis ne se concentrent plus uniquement sur la réponse inflammatoire mais incluent également la défaillance d'un organe causée par une infection.
Bien que des progrès significatifs aient été réalisés dans le diagnostic du sepsis, aucun indicateur biologique présentant une sensibilité et une spécificité élevées n'a été identifié. De plus, les faibles taux de positivité des cultures et la présence de quelques organismes cultivables limitent le diagnostic de sepsis clinique. Par conséquent, l’objectif des chercheurs était d’identifier un nouveau biomarqueur efficace et fiable pour le sepsis.
Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont recruté 157 sujets (dont 89 atteints de sepsis) des deux sexes à l'hôpital affilié de la Southern Medical University. Ils ont collecté des écouvillons nasaux et des échantillons fécaux auprès de patients septiques et non septiques en soins intensifs et dans l'unité de soins respiratoires et intensifs.
Les chercheurs ont extrait et séquencé l'ADN à l'aide de la technologie Illumina. L'analyse bioinformatique, le traitement statistique et les méthodes d'apprentissage automatique ont été utilisés pour distinguer les patients septiques des patients non septiques.
Il et ses collègues ont découvert que le microbiote nasal des patients septiques présentait une richesse communautaire globale significativement inférieure (P = 0,002) et une composition différente (P = 0,001) par rapport aux patients non septiques. Corynebacteria, Staphylococcus, Acinetobacter et Pseudomonas ont été identifiés comme genres enrichis dans le microbiote nasal des patients septiques.
"À l'avenir, nous suggérons la possibilité de réaliser d'autres études, peut-être en utilisant des modèles animaux ou des cohortes de patients plus importantes, pour approfondir notre compréhension du rôle du microbiote dans la septicémie au-delà de l'effet des antibiotiques", a-t-il déclaré.