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Étude : Les gènes influencent l'efficacité anticancéreuse des fruits et des fibres
Dernière revue: 14.06.2024
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Une étude récente publiée dans la revue eBioMedicine a identifié des variations génétiques susceptibles de modifier l'association entre la consommation de fibres, de fruits et de légumes et le risque de cancer colorectal ( CRC). Les scientifiques ont réussi à identifier deux locus importants qui modèrent l'association entre la consommation de fibres et de fruits et le risque de CCR.
Le CCR est l'un des cancers les plus répandus dans le monde, avec près de deux millions de nouveaux cas et plus de 900 000 décès en 2020. Il a été démontré qu'une consommation élevée de fruits, de légumes, de céréales complètes et de fibres alimentaires réduit le risque de CRC. Bien qu'il existe des preuves solides d'une association entre le risque de CCR et la consommation de grains entiers et de fibres alimentaires, les preuves d'une association entre le risque de CCR et la consommation de fruits et légumes restent limitées.
Des études d'association pangénomiques antérieures (GWAS) ont permis d'identifier au moins 200 locus associés au risque de CCR, expliquant jusqu'à 35 % de l'héritabilité. Bien que les interactions gène-environnement (G × E) puissent expliquer une héritabilité supplémentaire, des études antérieures portant sur de petits échantillons et des méthodes traditionnelles n'ont trouvé qu'un nombre limité d'interactions significatives. De nouvelles approches statistiques, telles que des tests conjoints et des méthodes en deux étapes qui donnent la priorité aux polymorphismes mononucléotidiques (SNP), peuvent potentiellement améliorer la précision de ces analyses.
Jusqu'à 45 études provenant de trois consortiums génétiques du CRC comprenant des individus d'origine européenne ont été incluses dans l'analyse. Les études comprenaient des cas témoins pour les études de cohorte et des témoins sans cancer pour les études cas-témoins. Au total, 69 599, 69 734 et 44 890 participants ont été analysés respectivement pour leur consommation de fruits, de légumes et de fibres. L'apport alimentaire a été évalué à l'aide de questionnaires sur la fréquence alimentaire et d'historiques alimentaires, généralement exprimés en portions par jour pour les fruits et légumes et en grammes par jour pour les fibres totales.
Les données ont été harmonisées et exprimées sous forme de quartiles par sexe et par étude. De plus, le contrôle de qualité du génotypage comprenait la vérification des données manquantes, de l'équilibre de Hardy-Weinberg et de l'incohérence sexuelle, suivi de l'imputation et du filtrage de la fréquence et de la précision des allèles mineurs, aboutissant à l'analyse de 7 250 911 SNP.
Par rapport aux témoins, les participants atteints de CCR étaient plus âgés, avaient un indice de masse corporelle et un apport énergétique plus élevés, ainsi qu'une prévalence plus élevée de facteurs de risque tels que des antécédents familiaux de CCR et de diabète de type 2. Ils consommaient également moins de fibres, de fruits et de légumes que le groupe témoin. Des méta-analyses ont trouvé une association inverse entre la consommation de fibres (risque relatif d'augmentation par quartile (OR) = 0,79), de fruits (OR = 0,79) et de légumes (OR = 0,82) et le risque de CCR.
Le test 3-DF a identifié le locus rs4730274 en amont du gène SLC26A3, ce qui montre une association avec l'apport en fibres et une interaction avec le risque de CCR. La stratification par génotype a montré une association inverse plus forte entre la fibre et le CRC pour chaque copie de l'allèle T. L'annotation fonctionnelle suggère une activité activatrice dans le tissu du côlon, avec un eQTL pour le gène DLD.
Le locus rs1620977 proche du gène NEGR1 a montré une association significative avec la consommation de fruits et une interaction modérée avec le risque de CCR. De fortes associations inverses ont été observées avec une consommation croissante de fruits pour chaque copie de l'allèle G.
Il s'agit de la plus grande étude G × E à ce jour, dans laquelle les chercheurs ont identifié deux interactions entre la consommation de fibres et de fruits et le risque de CCR. En particulier, rs4730274 à proximité du gène SLC26A3 suggère une association significative entre l'apport en fibres, la fonction intestinale, l'inflammation et le CCR. Les résultats nécessitent des recherches plus approfondies pour examiner les implications cliniques et confirmer ces résultats dans différentes populations.