Une analyse révèle de nouvelles preuves d'une augmentation mondiale des infections à streptocoques du groupe A

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Streptocoque du groupe A (Strep A) est un type courant de bactérie qui provoque généralement des infections de la gorge et la scarlatine. Bien que la plupart des infections soient bénignes, dans de rares cas, le streptocoque A peut provoquer des infections invasives pouvant être mortelles.

Entre 2022 et 2023, les services de santé du monde entier ont enregistré une augmentation des infections invasives graves à Strep A après la levée des restrictions liées à la pandémie. Une nouvelle étude menée par des scientifiques de l'Imperial College de Londres et de l'Agence britannique de santé publique a confirmé qu'une variante bactérienne appelée M1UK a joué un rôle clé dans cette augmentation.

Les souches M1 sont connues pour provoquer des infections plus invasives que d'autres types de Strep A. Bien que cette variante ait été identifiée et séquencée pour la première fois au Royaume-Uni, M1UK a récemment été associée à une augmentation des infections graves en Europe, en Australie et en Amérique du Nord. Et le Japon après la levée des restrictions liées à la pandémie. On l'a également trouvé en Amérique du Sud, en Nouvelle-Zélande et à Taiwan.

Le faible taux d'infections à Strep A pendant la pandémie a probablement rendu la population, en particulier les enfants, particulièrement vulnérables à ces infections, contribuant ainsi à l'augmentation des cas dans de nombreux pays.

Dans une nouvelle étude sur la génétique du M1UK, publiée dans Nature Communications, les scientifiques fournissent de nouvelles données sur le moment où la variante est apparue pour la première fois et comment elle se compare à d'autres souches.

Répartition mondiale et introductions potentielles de M1UK et des populations intermédiaires. Un arbre phylogénétique de 2364 M1UK et souches intermédiaires collectés dans le monde entier de mars 2005 à juillet 2023. B Arbre de transmission simplifié généré avec PastML montrant l'emplacement de l'origine épidémique ancestrale des lignées M1UK et des populations intermédiaires. C Estimation de la taille effective de la population (Ne) de M1UK au Royaume-Uni au fil du temps. Communications naturelles (2024). DOI : 10.1038/s41467-024-47929-7

En utilisant le séquençage génétique d'échantillons de patients combiné à une modélisation informatique, ils ont découvert que M1UK était probablement apparu vers 2008 et avait commencé à augmenter progressivement à partir de 2010.

Par rapport aux souches M1 antérieures, qui sont restées relativement inchangées au cours des 40 dernières années, M1UK produit davantage de toxines responsables de la scarlatine.

Le professeur Shiranee Srikandan, du département des maladies infectieuses de l'Imperial College de Londres, qui a dirigé l'étude avec des collègues de l'UKHSA, a déclaré : "Les bactéries évoluent avec le temps et, comme le streptocoque A est exclusivement un agent pathogène humain, elles acquièrent des modifications génétiques au fur et à mesure de leur évolution. Se propage à travers la population. La plupart des variantes vont et viennent au fil du temps, mais M1UK semble désormais avoir pris racine au Royaume-Uni et dans d’autres pays. On ne sait pas si cela restera ainsi à long terme. »

Histoire génétique

En utilisant des recherches dans des bases de données génomiques mondiales, l'équipe a montré que lorsque M1UK a été découvert pour la première fois au Royaume-Uni en 2019, seules deux souches de M1UK pouvaient être identifiées à partir de séquences génomiques en dehors du Royaume-Uni. Mais des analyses ultérieures menées dans d'autres pays examinant l'évolution des tendances des infections à Strep A (y compris les infections invasives) montrent que M1UK est désormais présent dans plus de 10 pays à travers le monde et, dans certains cas, est devenu la souche dominante dans la période post-pandémique. p>

L'analyse met également en évidence un effet de goulot d'étranglement dans lequel les infections à Strep A ont diminué pendant la pandémie de COVID-19, coïncidant avec des mesures généralisées de distanciation sociale et de confinement. Mais après cette période, M1UK s'est propagé rapidement au Royaume-Uni, avec une augmentation marquée des cas de scarlatine et d'infections invasives à Strep A en 2022.

Selon les chercheurs, bien que la réduction de la transmission du Strep A pendant la pandémie ait pu conduire à un affaiblissement de l'immunité dans la population, leurs travaux mettent en évidence les caractéristiques génétiques du M1UK qui indiquent un avantage en termes de viabilité par rapport aux autres souches, lui permettant de se propager plus facilement et potentiellement causer des maladies plus graves. Maladies. Il est possible qu'une immunité accrue de la population contre la souche M1UK permette l'émergence d'autres types de souches.

Le professeur Srikandan, également directeur clinique du Centre de biologie de la résistance bactérienne, a ajouté : « Bien que nous sachions désormais que la variante M1UK était responsable de l'augmentation significative des cas l'hiver dernier, cela s'est produit à une période inhabituelle de l'année, coïncidant avec virus respiratoires et stress hivernal. Tout cela a contribué à la gravité. En fin de compte, les pics que nous observons à différents moments dans le monde sont probablement dus à une diminution de l'immunité contre certains pathogènes respiratoires, en particulier le streptocoque A. Les vaccins pourraient aider à prévenir cela, et nous avons vraiment besoin d'un vaccin contre le streptocoque A. Ces dernières découvertes ont été rendu possible grâce à une étroite collaboration entre les chercheurs en maladies infectieuses de l'Imperial College et le système de surveillance moléculaire de pointe de l'Agence britannique de santé publique. "