Une perspective sur la menace croissante du virus de la variole du singe

Dans un article publié dans Nature Microbiology, Bernard Moss du Laboratoire des maladies virales de l'Institut national des allergies et des maladies infectieuses résume et discute les connaissances scientifiques disponibles sur la variole zoonotique à virus MPX (anciennement connue sous le nom de « variole du singe »). Compte tenu de l’augmentation soudaine et alarmante de la prévalence à l’échelle mondiale (de 38 cas signalés entre 1970-1979 à plus de 91 000 cas entre 2022-2023) et de la première documentation documentée d’une transmission sexuelle (principalement parmi les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes [HSH]), le La maladie est désormais incluse dans le Rapport de situation externe n°30 de l'Organisation mondiale de la santé (OMS), soulignant la nécessité de mieux comprendre le virus pour lutter contre les nouveaux cas.

Cette étude examine la biologie et la génétique du MPXV, son épidémiologie, ses réservoirs animaux potentiels, sa génétique fonctionnelle et la faisabilité de l'utilisation de modèles animaux dans la recherche pour limiter la propagation de la maladie. L'article souligne le manque de connaissances scientifiques actuelles dans ce domaine et la nécessité de recherches supplémentaires pour élucider les mécanismes d'interaction des maladies chez l'homme, en mettant l'accent sur l'interprétation des mécanismes d'action des trois types connus de MPXV (1, 2a et 2b). ).

Qu'est-ce que le MPXV et pourquoi les médecins s'inquiètent-ils de cette maladie ?

Le virus Monkeypox (MPXV) est un agent pathogène zoonotique de la famille des poxvirus, appartenant au genre Orthopoxvirus (sous-famille des Chordopoxvirinae). Il est étroitement lié au virus variolique (VARV, l'agent causal de la variole), au virus de la vaccine (CPXV) et au virus ectomelia (ECTV, l'agent causal de la variole murine, maladie des rongeurs). Le MPXV a été isolé et décrit pour la première fois chez des poissons cynomolgus captifs en 1958, et des infections chez l'homme ont été identifiées en Afrique centrale et occidentale au début des années 1970.

Bien que ce virus ne soit pas aussi dangereux sur le plan clinique que la variole, désormais éradiquée, la variole est connue pour ses symptômes de rougeurs cutanées, de forte fièvre, d'éruptions vésiculopustuleuses et de lymphadénopathie. Les taux de mortalité liés à cette maladie varient de <3,6 % (Afrique de l'Ouest) à environ 10,6 % (Afrique centrale). Il est alarmant de constater que le nombre de cas signalés de variole a augmenté de façon spectaculaire, passant de 38 cas entre 1970 et 1979 à plus de 91 000 cas entre 2022 et 2023. Auparavant limitée à l'Afrique centrale et occidentale, la maladie a désormais été identifiée au Royaume-Uni, en Israël, aux États-Unis d'Amérique, à Singapour et (en novembre 2023) dans 111 pays dans le monde.

L'augmentation de la prévalence mondiale, la détection de la transmission interhumaine et l'augmentation de la mortalité mondiale (167 décès confirmés entre 2022 et 2023) ont incité l'Organisation mondiale de la santé (OMS) à déclarer le MPXV comme une « urgence de santé publique internationale » et à l'inclure. Dans un rapport externe sur la situation n°30. Malheureusement, malgré une longue histoire de la maladie, les recherches sur le MPXV restent insuffisantes. Cette revue vise à synthétiser, compiler et discuter la littérature scientifique disponible sur l'épidémiologie des trois clades connus du MPXV afin de fournir aux cliniciens et aux décideurs politiques les informations nécessaires pour contenir la maladie et potentiellement parvenir à une éradication similaire à celle de la variole.

Biologie, génétique et génétique fonctionnelle MPXV

Comme tous les autres virus de la vaccine, le MPXV est un gros virus à ADN double brin qui utilise le cytoplasme de ses cellules hôtes (généralement des mammifères) pour sa survie et sa réplication. Compte tenu du manque d’études spécifiques au MPXV, une grande partie de notre compréhension de la biologie du MPXV repose sur des observations de la biologie, de l’épidémiologie et de la génétique fonctionnelle du virus vaccinal (VACV). En bref, le virus se lie d’abord à la cellule hôte, fusionne avec les membranes cellulaires, puis libère son noyau dans le cytoplasme de la cellule. Cette libération déclenche la transcription des ARNm viraux qui codent pour 1. Les enzymes pour la réplication du génome viral, 2. Les ARNm de l'étape intermédiaire de transcription et 3. Les protéines de surface pour l'évasion et la défense immunitaires de l'hôte.

"Le taux d'évolution virale est déterminé principalement par les taux de mutation. L'ADN polymérase du correcteur d'épreuves de vaccins a un faible taux d'erreur, et les analyses du VARV chez l'homme et du MPXV chez le chimpanzé montrent 1 × 10−5 et 2 × 10−6 substitutions de nucléotides. Par site et par an respectivement, ce taux est significativement inférieur aux substitutions de nucléotides de 0,8 à 2,38 × 10−3 et 2 × 10−3 par site et par an estimées pour le SRAS-CoV-223 et le virus de la grippe24, respectivement, des études in vitro suggèrent une transition transitoire les duplications de gènes (connues sous le nom de modèle accordéon) peuvent précéder d'autres événements mutationnels chez les orthopoxvirus, permettant une adaptation accélérée aux défenses antivirales de l'hôte. "

Des études génétiques récentes ont montré que la souche unique de MPXV, précédemment supposée, se compose en réalité de trois clades : le clade 1, que l'on trouve principalement dans les pays d'Afrique centrale, et les clades 2a et 2b, que l'on trouve principalement en Afrique de l'Ouest. La différence génomique entre les clades varie de 4 à 5 % (clade 1 vs clades 2a/2b) et d'environ 2 % entre les clades 2a et 2b.

"La plupart des différences entre les clades sont des polymorphismes nucléotidiques non synonymes et pourraient potentiellement affecter la réplication ou l'interaction avec l'hôte. Cependant, presque tous les gènes des clades I, IIa et IIb semblent intacts, comme l'indique la longueur conservée des gènes d'interaction avec l'hôte. "

Des études de génétique fonctionnelle ont montré que les délétions réduisent considérablement la réplication virale dans les modèles de primates non humains (NHP), mais ce domaine scientifique en est encore à ses balbutiements et des recherches supplémentaires sont nécessaires avant de pouvoir mettre en œuvre des interventions génétiques pour lutter contre le MPXV. p>

Épidémiologie et réservoirs animaux

Jusqu'aux récentes épidémies mondiales de 2018-19 et 2022-23, les cas de MPOX étaient largement limités à l'Afrique centrale et occidentale. Cependant, en raison du conflit civil dans la région, du manque d'installations de tests médicaux dans les zones rurales isolées et de l'identification erronée du MPoxa comme étant la variole avant son éradication, les estimations de la prévalence du MPoxa seraient sous-estimées.

« Les déclarations de cas, requises en RDC mais non confirmées, ont montré une tendance à la hausse des cas : de 38 en 1970-1979 à 18 788 en 2010-2019 et 6 216 en 2020. Du 1er janvier au 12 novembre 2023 12 569 des cas ont été signalés dans d'autres pays d'Afrique centrale, notamment la République centrafricaine, le Cameroun, le Congo, le Gabon et le Soudan du Sud, où la déclaration n'est pas obligatoire. On pense que l'infection zoonotique primaire est due à la chasse, à la transformation ou à la consommation d'animaux sauvages dans les zones tropicales. Forêts."

Les réservoirs animaux sont considérés comme la voie de transmission la plus courante du MPOX, suivis par les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH). Bien que la source du premier MPXV identifié soit des singes asiatiques captifs, les études sur leurs homologues sauvages n'ont pas permis d'identifier les populations infectées en Asie. En revanche, d’importantes populations de rongeurs (généralement arboricoles), de singes et de chauves-souris infectés par la maladie ont été trouvées dans les basses terres d’Afrique centrale et occidentale. La prévalence la plus élevée a été trouvée chez les rongeurs des genres Funisciuris et Heliosciuris, qui sont considérés comme les principaux réservoirs zoonotiques de cette maladie.

Malgré plusieurs décennies depuis la découverte du MPox, notre connaissance de la maladie et de ses mécanismes viraux reste extrêmement insuffisante. De futures recherches sur la biologie du MPXV, en particulier sur ses moyens d'échapper au système immunitaire de l'hôte et sur ses interactions, contribueraient à contenir sa transmission, notamment en Afrique.

"Une distribution plus équitable des vaccins et des traitements, une meilleure compréhension de l'épidémiologie du MPXV, l'identification des réservoirs animaux du MPXV qui peuvent transmettre le MPXV aux humains, et une meilleure compréhension de la transmission interhumaine sont nécessaires si nous sont de mieux gérer, voire prévenir de futures épidémies de mpoxa."