Un nouveau biomarqueur prédit le succès de l'immunothérapie dans le cancer du rein

L'immunothérapie augmente la survie dans le cancer du rein, mais elle ne convient pas à tous les patients. Une équipe de recherche de Louvain a développé une nouvelle méthode pour prédire qui bénéficiera du traitement. Une équipe dirigée par Francesca Finotello du groupe de biomédecine computationnelle de l'université d'Innsbruck a également contribué à l'étude.

Leurs travaux, publiés dans la journal Nature Medicine, ouvrent de nouvelles voies pour un traitement plus efficace.

Chaque année en Autriche, environ 1 300 personnes reçoivent un diagnostic de cancer du rein. Grâce à l’immunothérapie, les taux de survie au cancer du rein métastatique ont considérablement augmenté : plus de la moitié des patients survivent plus de cinq ans après le diagnostic, contre 10 % dans le passé. Malheureusement, ce traitement innovant ne fonctionne pas pour tous les patients.

Pour comprendre les raisons de cette variation dans l'efficacité de l'immunothérapie et pour mieux prédire qui bénéficiera du traitement, l'équipe de recherche de Louvain a mené une vaste étude rétrospective. Ils ont analysé un grand nombre d'échantillons de patients atteints d'un cancer du rein traités par immunothérapie à l'UZ Leuven au cours des dix dernières années.

Signature moléculaire Dr Lisa Kinget, chercheuse et oncologue, et Stefan Naulaerts, postdoctorant, expliquent : « Nous avons examiné à la fois des biopsies tumorales et des échantillons de sang à l'aide de techniques de laboratoire de pointe. Grâce à l'apprentissage automatique, nous avons combiné l'expression des gènes dans la tumeur avec les caractéristiques héréditaires du système immunitaire des patients, en particulier les gènes HLA, qui présentent des centaines de variations selon les individus.

Cette approche nous a permis de découvrir une « signature moléculaire » qui montrait un lien clair avec la réponse clinique et la survie. Nous avons en outre confirmé ce lien dans des échantillons indépendants provenant de plus de 1 000 patients atteints d'un cancer du rein provenant d'autres études internationales. »

Des tests en laboratoire ont également montré qu'une réponse réussie à l'immunothérapie était associée à une bonne interaction entre deux types de cellules immunitaires, à savoir les lymphocytes T CD8+ et les macrophages.

Le Dr Francesca Finotello du Département de biologie moléculaire de l'Université d'Innsbruck et du Centre pour la science numérique (DiSC) ajoute : "Nous avons intégré et analysé les mégadonnées du projet The Cancer Genome Atlas (TCGA) pour relier cette nouvelle signature moléculaire au paysage mutationnel des tumeurs, démontrant qu'il fournit des informations supplémentaires concernant le fond génétique des cellules cancéreuses, capturant efficacement leur interaction avec le système immunitaire."

Le professeur Abhishek D. Garg de la KU Leuven déclare : « Auparavant, les chercheurs étudiaient principalement les cellules immunitaires au niveau de types de cellules individuels, ce qui conduisait à des biomarqueurs simplifiés. En conséquence, nous avons considéré les macrophages comme « mauvais » pour l’immunothérapie. Avec cette étude, nous montrons que les interactions entre différents types de cellules immunitaires dans un contexte spatial spécifique sont plus importantes dans la lutte contre le cancer du rein."

Le professeur Benoit Böselinck, oncologue médical à l'UZ Leuven, déclare : « À l'avenir, nous espérons utiliser notre méthode comme biomarqueur pour prédire quels patients bénéficieront de l'immunothérapie. La nouvelle idée selon laquelle l'interaction entre certaines cellules T et les macrophages est importante pour le succès de l'immunothérapie ouvre des voies intéressantes pour de futurs traitements.

Nous développons actuellement de nouveaux essais cliniques de thérapies combinées pour stimuler les deux types de cellules et améliorer leur collaboration, ce qui pourrait être plus efficace que les traitements actuels.