Renoncer au gluten peut nuire à votre intestin et endommager des bactéries importantes.

Les scientifiques ont découvert qu’une réduction à long terme de la consommation de gluten – souvent perçue comme une mesure de santé – peut au contraire perturber l’équilibre du microbiote intestinal, réduire les niveaux de microbes clés et provoquer une accumulation d’éthanol associée à une inflammation et à des risques métaboliques.

Une étude publiée dans la revue Nutrients a évalué si et comment un régime sans gluten à long terme affecte la composition et la fonction du microbiote intestinal chez les adultes en bonne santé.

Gluten et microflore intestinale

Le gluten est le principal composant alimentaire du blé. Il contient de gros peptides tels que les gliadines et les gluténines. En raison de leur taille, ils sont difficiles à décomposer par les enzymes digestives humaines. Ils traversent donc l'intestin sans être digérés et provoquent des modifications du microbiote. Le gluten est associé à plusieurs maladies, notamment la sensibilité au gluten non cœliaque, la maladie cœliaque et l'ataxie au gluten.

Les personnes adoptant un mode de vie sans gluten constatent souvent une amélioration de la digestion, du contrôle du poids et du bien-être général. Cependant, les preuves de ces effets chez les personnes en bonne santé sont encore limitées, et éviter le gluten sans régime médicalement indiqué peut comporter des risques nutritionnels et métaboliques.

Une étude a révélé qu'après un an de régime sans gluten ou à faible teneur en gluten (LGD), les patients atteints de la maladie cœliaque présentaient un risque accru de développer un syndrome métabolique, probablement en raison de l'indice glycémique élevé de nombreux aliments sans gluten. Ces risques nécessitent une surveillance à long terme, car les modifications du microbiote induites par l'alimentation peuvent contribuer aux troubles métaboliques.

À propos de l'étude

Il s'agissait d'un essai contrôlé randomisé évaluant les effets de l'adhésion à long terme au régime LGD sur la composition et l'activité métabolique du microbiote intestinal chez 40 adultes sains en France. Les participants consommaient généralement environ 160 g de pain et de pâtes par jour, ce qui correspond à 14 à 15 g de gluten.

Les volontaires sont passés d'un régime riche en gluten (RGF) conventionnel à un régime riche en gluten (RGF) en deux cycles de 8 semaines. Des échantillons de selles ont été prélevés au départ (M0), après 8 semaines (M2) et, chez 20 personnes, après 16 semaines de RGF (M4). Le microbiote a été analysé par séquençage du gène de l'ARNr 16S et PCR. Le métabolisme a été évalué par spectroscopie RMN 1H des produits de fermentation fécale.

Résultats de la recherche

Au total, 1 742 283 lectures d'ARNr 16S ont été traitées à partir d'échantillons fécaux après HGD et LGD. Une diminution significative de la diversité alpha du microbiote a été observée pendant la LGD, avec une diminution plus marquée après 16 semaines, suggérant un effet croissant au fil du temps. La diversité bêta a montré une nette modification des communautés microbiennes pendant la LGD par rapport à la valeur initiale.

Au niveau du phylum, les Verrucomicrobiota et les Actinomycetota ont significativement diminué, tandis que les Bacteroidota et les Bacillota ont augmenté. Cependant, le rapport Bacillota/Bacteroidota n'a pas changé, ce que les auteurs considèrent comme un détail important. Au niveau de la famille, les Veillonellaceae ont augmenté, tandis que les Akkermansiaceae ont diminué.

Les bifidobactéries ont été significativement réduites par qPCR (p = 0,0021), bien que cela n'ait pas toujours atteint la signification statistique lors du séquençage. Les niveaux d'Escherichia coli, de Faecalibacterium prausnitzii et du groupe Lactobacillus–Pediococcus sont restés inchangés.

Les classes Bacteroidia, Verrucomicrobiae et Clostridia ont évolué au niveau de l'espèce. Akkermansia muciniphila a diminué significativement à partir de M4. Lachnobacterium bovis, productrice de lactate, a également diminué. Parallèlement, certains producteurs de butyrate, comme Roseburia et Faecalibacterium, ont augmenté, ce qui, selon les auteurs, a contribué à maintenir des niveaux stables de butyrate.

Les espèces R. callidus et Ruminococcus champanellensis, fermenteuses de la cellulose, ont également décliné dans la M4. Les membres de la famille des Lachnospiracées, dont Eubacterium sp. et Blautia caecimuris, ont décliné, même si les Lachnospiracées comprennent de nombreux producteurs de butyrate.

Après la LGD, les entérobactéries ont été multipliées par 10, tandis que le nombre total d'anaérobies est resté inchangé. Les niveaux de microbes capables de dégrader le gluten ont été divisés par 10 au M2. Les entérobactéries, y compris les producteurs potentiels d'éthanol comme E. coli, peuvent contribuer à l'inflammation lorsqu'elles sont excessives.

Changements métaboliques

Aucune différence significative n'a été constatée entre les concentrations de produits de fermentation fécale de M2 et M4. Dans M2, une légère diminution de la proportion d'acétate et une augmentation de celle de propionate ont été observées. La proportion d'éthanol a plus que triplé dans M2 et M4. L'accumulation d'éthanol est un signal d'alarme métabolique important, car elle est associée à l'inflammation et au syndrome métabolique.

Une diminution significative de l'isobutyrate a également été observée dans M4. Malgré les modifications du microbiote, les taux d'acétate, de propionate et de butyrate sont restés globalement stables, ce que les auteurs attribuent à la capacité excessive de différentes bactéries à produire du butyrate.

La plupart des souches dégradant le gluten appartenaient à la classe des Clostridia. On a également identifié un isolat d'Actinomycetota, deux de Gammaproteobacteria et trois d'Erysipelotrichia. Cinq souches appartenaient à la famille des Lachnospiraceae au sein des Clostridia. Un isolat de la famille des Oscillospiraceae a été identifié comme étant Flavonifractor plautii, et trois individus présentaient des souches d'Erysipelotrichaceae.

Conclusions

Un régime de 16 semaines a modifié la composition et l'activité métabolique du microbiote intestinal chez des sujets français sains, induisant des signes de dysbiose. Ces changements pourraient être dus non seulement à l'exclusion du gluten, mais aussi au remplacement du blé par du riz et du maïs, ce qui a modifié la composition en fibres et en polyphénols de l'alimentation.

D'autres études à long terme pourraient clarifier les effets sur l'immunité, la physiologie et le métabolisme. Cependant, des données indiquent déjà que la LGD à long terme chez les personnes en bonne santé peut perturber l'équilibre microbien et augmenter les taux d'éthanol, ce qui pourrait engendrer des risques métaboliques.