Analyse des selles pendant la grossesse: indications et préparation

Le principe général est le suivant: l’analyse des selles pendant la grossesse est réalisée de manière sélective – en réponse à des symptômes, une suspicion d’infection ou un risque épidémiologique – et non comme un test de dépistage systématique pour toutes les patientes. Les symptômes de la patiente, l’âge gestationnel et les facteurs de risque sont analysés, et ce n’est qu’ensuite que les méthodes de laboratoire appropriées sont sélectionnées. [1]

Les principales indications cliniques sont une diarrhée sévère ou persistante, de la fièvre accompagnée de symptômes intestinaux, du sang dans les selles, une perte de poids importante ou des signes de déshydratation sévère, ainsi que des symptômes apparaissant après un voyage en zone endémique. Dans ces situations, l’identification rapide de la cause influence le choix du traitement et la sécurité du fœtus. [2]

Un point important: de nombreuses infections intestinales sont généralement traitées de manière symptomatique et ne nécessitent pas d’examens de laboratoire approfondis chez les patients en bonne santé. Pendant la grossesse, la frontière entre « observation » et « investigation » se déplace vers des diagnostics plus actifs lorsqu’il existe un risque de complications pour la mère et le fœtus. Cela explique pourquoi des méthodes diagnostiques sensibles sont plus souvent utilisées pendant la grossesse lorsque cela est indiqué. [3]

Autre règle générale: le laboratoire et le médecin traitant doivent s’entendre sur les tests à adapter en fonction de la pratique clinique. Par exemple, en cas de suspicion de giardiase, il est pertinent de réaliser un test antigénique pour Giardia, tandis qu’en cas de diarrhée sévère, un panel PCR multiplex, qui recherche simultanément plusieurs agents viraux et bactériens, est recommandé. Le choix du test est déterminé par l’objectif clinique. [4]

Tableau 1. Brèves indications pour l'analyse des selles pendant la grossesse

Indication	Pourquoi est-ce important?	Plan d'action approximatif
La diarrhée est prolongée ou sévère	Risque de déshydratation et effets sur le fœtus	Soumettez un échantillon de selles pour un test PCR et une culture si nécessaire.
Du sang dans les selles	Peut nécessiter un traitement urgent.	Analyse des selles, culture, évaluation hémodynamique
Fièvre accompagnée de symptômes intestinaux	Une infection systémique est possible	Diagnostic de laboratoire urgent et hospitalisation dans les cas graves
Un récent voyage dans une zone endémique	Risque d'infections parasitaires	Tests et études antigéniques pour les oxyures

(Source: Recommandations pour le diagnostic des infections intestinales et revues cliniques). [5]

Quels sont les tests de laboratoire disponibles et que révèlent-ils?

Les laboratoires modernes proposent plusieurs catégories de tests: la culture classique pour les agents pathogènes bactériens, les méthodes de détection des toxines, les tests antigéniques pour les protozoaires, la microscopie pour les œufs et les larves d’helminthes, et les panels de PCR moléculaire qui peuvent détecter simultanément des dizaines d’agents pathogènes. Chaque méthode présente ses propres avantages et limites. [6]

Les tests antigéniques pour Giardia et Cryptosporidium sont plus sensibles et plus pratiques que la microscopie, qui souffre d'un isolement parasitaire intermittent et nécessite de multiples prélèvements. Les méthodes antigéniques ou moléculaires sont souvent recommandées pour la détection des protozoaires. [7]

Les panels multiplex moléculaires présentent une sensibilité élevée et un traitement rapide, ce qui est utile en cas de diarrhée aiguë sévère ou pour les tests de masse. Leurs inconvénients incluent un coût élevé et le fait que la PCR ne fournit pas toujours d'informations sur la sensibilité aux antibiotiques; par conséquent, lors de l'isolement des bactéries, une culture est souvent réalisée en parallèle. [8]

La microscopie classique pour l’examen des œufs et des kystes reste importante dans les contextes où les ressources sont limitées et pour l’identification de certains helminthes. Cependant, sa sensibilité est faible avec un seul échantillon; par conséquent, en cas de suspicion d’infestation parasitaire, il est souvent recommandé de prélever plusieurs échantillons ou de recourir à des diagnostics antigéniques ou moléculaires. [9]

Tableau 2. Examens de selles de base: indications et résultats attendus

Test	Quand est-il prescrit?	Points forts	Restrictions
Culture de bactéries intestinales	Diarrhée sévère, fièvre, selles sanglantes	Possibilité de tests d'isolement et de sensibilité	Cela prend du temps, parfois une faible sensibilité
Antigène pour Giardia/Cryptosporidium	Protozoaires suspectés	Haute sensibilité aux parasites cibles	Ne couvre pas tous les agents pathogènes
PCR multiplex	Diarrhée sévère ou nécessitant une hospitalisation	Haute vitesse et sensibilité	Coût, ne fournit pas d'antibiogramme
Microscopie des œufs et des parasites	Régions endémiques, helminthiase suspectée	Peu coûteux, détecte les œufs	Faible sensibilité avec un seul échantillon

(Sources: revues cliniques et directives de laboratoire.) [10]

Comment collecter correctement les matériaux et comment éviter de faire des erreurs

La précision de l'analyse dépend largement de la qualité du prélèvement. Pour les selles liquides, il est préférable d'acheminer l'échantillon au laboratoire le plus rapidement possible, car de nombreux protozoaires sous forme végétative deviennent immobiles et les tests perdent leur intérêt. Il est recommandé d'analyser les échantillons liquides dans la demi-heure suivant la miction et les échantillons mous dans l'heure qui suit. [11]

Lors du prélèvement d’échantillons pour culture et PCR, il est crucial d’éviter toute contamination par l’urine et de maintenir le récipient propre. Pour certains tests, le laboratoire fournit des récipients spéciaux avec conservateurs ou des kits de prélèvement rapide. Le patient reçoit des instructions écrites concernant le prélèvement et le conditionnement, ainsi qu’un kit et un récipient de retour si nécessaire. [12]

Si une microscopie des protozoaires est prévue, trois prélèvements distincts, effectués à intervalles réguliers, peuvent être nécessaires en raison de la récupération intermittente des kystes. Les tests antigéniques et les panels moléculaires nécessitent généralement un seul échantillon, mais les procédures de laboratoire varient; il est donc toujours conseillé de vérifier auprès de votre laboratoire local les exigences en matière de volume et de délai de livraison. [13]

La conservation d'un échantillon à domicile est généralement trop longue. En cas de retard de livraison, le laboratoire peut recommander de réfrigérer l'échantillon, mais idéalement, il faudrait le livrer le plus rapidement possible. Un stockage et un transport inadéquats réduisent la sensibilité du test et peuvent entraîner des résultats faussement négatifs. [14]

Tableau 3. Règles pratiques pour la collecte des matières fécales

Étape	Recommandation	Note
Délai de livraison	Dès que possible, liquide - <30 minutes	En cas de retard, conserver au réfrigérateur conformément aux instructions.
Nombre d'échantillons	Pour la microscopie – jusqu’à 3 échantillons	Antigénique et PCR – généralement 1 échantillon
Évitez l'urine	L'urine et l'eau réduisent le contenu informationnel	Urinez avant le prélèvement ou utilisez un récipient propre.
Kit de laboratoire	Utilisez le récipient fourni par le laboratoire.	Certains tests nécessitent un agent de conservation.

(Source: directives de prélèvement d'échantillons du CDC et du NHS.) [15]

Les principaux agents pathogènes chez la femme enceinte et les principes de traitement

Giardia lamblia. Cause fréquente de diarrhée prolongée ou stéatorrhéique. Le diagnostic repose de préférence sur la recherche d'antigènes ou les méthodes moléculaires. Le traitement consiste généralement en l'administration de métronidazole ou d'autres nitroimidazoles; pendant la grossesse, la décision de prescrire ce médicament est laissée à l'appréciation du médecin, en tenant compte de l'âge gestationnel et des données de sécurité disponibles. Le métronidazole est considéré comme approprié dans la plupart des recommandations lorsqu'il est indiqué, mais certains auteurs préconisent la prudence au cours du premier trimestre. [16]

Infections bactériennes — Salmonella, Shigella, Campylobacter. Ces infections peuvent provoquer de la fièvre et des diarrhées sanglantes. Dans les cas graves, une hospitalisation et un traitement parentéral sont possibles. Le diagnostic repose sur la mise en culture; si le résultat est positif, un antibiogramme est réalisé. Si le test moléculaire est positif, il est également recommandé d’envoyer l’échantillon à un laboratoire pour culture. [17]

Clostridioides difficile. Cette infection comporte un risque de complications graves. En cas de suspicion, un test rapide de recherche de toxine ou une PCR spécifique de la toxine est nécessaire, et un protocole de traitement doit être instauré. Le choix du médicament chez la femme enceinte est discuté au cas par cas en fonction de la gravité de l'infection et des recommandations. En période périnatale, les infections à Clostridioides difficile sont associées à un risque accru de complications et nécessitent une prise en charge précoce et intensive. [18]

Helminthes et vermifugation prophylactique. Dans les régions où les schistosomes et les ascaris sont endémiques, la vermifugation prophylactique des femmes enceintes après le premier trimestre est indiquée et recommandée par l’OMS dans le cadre d’un programme global de réduction de l’anémie et de la mortalité infantile. Les anthelminthiques ne sont généralement pas prescrits au cours du premier trimestre; la décision d’utiliser un médicament et le choix du médicament spécifique dépendent des recommandations locales. [19]

Tableau 4. Pathogène - test typique - recommandations de traitement pendant la grossesse

Pathogène	Test préféré	L'objectif thérapeutique principal
Giardia	Antigène ou PCR	Métronidazole si indiqué, évaluation du cycle de grossesse
Salmonella / Shigella / Campylobacter	PCR et culture	Antibiotiques pour les cas graves en fonction des résultats d'un antibiogramme
Clostridioides difficile	Toxine ou PCR	Traitement selon les recommandations, discussion avec un spécialiste des maladies infectieuses
Helminthes	Microscopie, PCR	Vermifugation dans les zones endémiques après le premier trimestre selon le protocole de l'OMS

(Sources: revues cliniques, CDC, NICE, OMS). [20]

Situations particulières: voyages, régions endémiques et épidémies massives

Un voyage récent dans des régions tropicales ou endémiques augmente le risque d’infections parasitaires ou bactériennes atypiques en cas d’apparition de symptômes intestinaux. Dans ce cas, des analyses complémentaires visant à rechercher les pathogènes locaux sont indiquées, notamment les amibes, les giardias, les cryptosporidies et les parasites rares. Le laboratoire doit être informé du risque géographique afin de garantir la réalisation des analyses appropriées. [21]

Lors d’épidémies massives ou de foyers d’infection, il est judicieux d’utiliser rapidement un panel PCR multiplex pour identifier l’agent pathogène et mettre en œuvre sans délai des mesures visant à contrôler sa propagation. Ces panels fournissent des résultats rapides et contribuent à réduire l’utilisation inutile d’antibiotiques lors d’épidémies virales. [22]

Si une femme enceinte présente de la fièvre et qu'une infection alimentaire hautement pathogène est suspectée, le risque de listériose à Listeria monocytogenes doit être envisagé, car cette infection est particulièrement dangereuse pendant la grossesse et nécessite une prise en charge immédiate. En cas de suspicion de listériose, la prise en charge comprend un examen clinique, une hémoculture et une discussion des options d'hospitalisation et de traitement. [23]

Dans les régions où la prévalence des helminthiases est élevée, les protocoles de l’OMS et les programmes nationaux prévoient des mesures préventives pour les femmes enceintes après le premier trimestre afin de réduire le risque d’anémie et de complications. Il s’agit d’une approche systémique de santé publique qui ne remplace pas le diagnostic individuel fondé sur les symptômes. [24]

Tableau 5. Que faire en voyage et lors d'une épidémie massive

Situation	Tests supplémentaires	Action urgente
Un voyage sous les tropiques	panels PCR, tests antigéniques pour les parasites	Vérifiez l'itinéraire, contactez un spécialiste des maladies infectieuses
épidémie massive	PCR multiplex	Mesures de surveillance et de contrôle, limitation des traitements antibiotiques non ciblés
listériose suspectée	Hémoculture, évaluation clinique	Discussion sur l'hospitalisation et le traitement

(Sources: OMS, CDC, publications cliniques). [25]

Comment interpréter les résultats et quels algorithmes cliniques utiliser

L’agent pathogène détecté doit être comparé aux données cliniques. Un test PCR positif en l’absence de symptômes peut refléter un portage asymptomatique ou la présence d’ADN résiduel d’une infection antérieure; cependant, chez la femme enceinte, la présence de l’agent pathogène, même avec des symptômes modérés, peut nécessiter un traitement pour la protection du fœtus. Par conséquent, l’interprétation doit être clinique et biologique. [26]

Si le test révèle une infection bactérienne, le médecin évalue la gravité de l’affection et décide d’un traitement oral ou parentéral, en s’appuyant si possible sur les résultats de la culture et de l’antibiogramme. Si l’infection à Clostridioides difficile est confirmée, le traitement est instauré conformément aux recommandations nationales et en tenant compte de la grossesse. [27]

Si des parasites sont détectés, un traitement éprouvé est prescrit, en tenant compte de l'âge gestationnel. Les anthelminthiques ne sont généralement pas prescrits au cours du premier trimestre; dans les régions endémiques, un déparasitage après le premier trimestre peut être envisagé, mais la décision finale revient au médecin. En cas de giardiase, un traitement par métronidazole est discuté en fonction de l'âge gestationnel. [28]

En cas de résultat faussement négatif et de persistance des symptômes, il est recommandé de procéder à un nouvel échantillonnage ou d'utiliser une autre méthode de test, par exemple en passant de la microscopie à un test antigénique ou à une PCR. L'observation clinique et la répétition des tests sont souvent plus importantes qu'un simple chiffre sur le formulaire. [29]

Tableau 6. Algorithme d'actions basé sur les résultats

Résultat	Que compter	Prochaines étapes
PCR positive sans symptômes	Transport possible	Évaluer la clinique; en l’absence de risque, observer
PCR positive avec symptômes	Une infection active est probable	Traitement selon le protocole, culture pour antibiogramme
Résultat négatif avec symptômes	Un faux négatif est possible	Prélèvements répétés, changement de méthode (antigène ou PCR)
Parasites confirmés	Infestation parasitaire confirmée	Traiter en fonction de l'âge gestationnel et des recommandations

(Sources: Directives cliniques sur les infections et les méthodes de laboratoire.) [30]

Prévention et conseils pratiques pour les femmes enceintes

La prévention des infections intestinales pendant la grossesse repose sur des mesures simples: une hygiène des mains rigoureuse, la cuisson complète des produits animaux, l’évitement des légumes non lavés et des produits laitiers non pasteurisés, et la prudence lors de la consommation de poisson et de fruits de mer crus. Ces mesures réduisent considérablement le risque de listériose et d’autres infections graves. [31]

Dans les régions où l’helminthiase est endémique, le déparasitage préventif après le premier trimestre est envisagé dans le cadre des programmes nationaux et conformément aux recommandations de l’OMS. Cette intervention communautaire vise à réduire l’anémie et à améliorer les résultats, mais doit être mise en œuvre selon les protocoles locaux. [32]

En cas de diarrhée accompagnée de fièvre, de douleurs vaginales ou abdominales, consultez immédiatement un médecin. Un dépistage précoce et un diagnostic précis permettent de prévenir la déshydratation et de réduire les risques de complications pour la mère et le fœtus. Une déshydratation sévère peut nécessiter une réhydratation intraveineuse et une hospitalisation. [33]

La communication avec le laboratoire et le médecin traitant est importante: lors de la prescription d’un test, le statut et le stade de la grossesse doivent être indiqués afin que le laboratoire puisse recommander le kit de test approprié et assurer une réponse rapide en cas de suspicion d’infection grave. Cela accélère le diagnostic et améliore la coordination clinique. [34]

Tableau 7. Mesures préventives pour les femmes enceintes

Mesure	Pourquoi est-ce important?	Conseils pratiques
Hygiène des mains rigoureuse	Prévient la transmission féco-orale	Lavez-vous les mains après être allé aux toilettes et avant de manger
Traitement thermique complet des aliments	Réduit le risque de listériose et de salmonellose	Chauffer la viande et les produits laitiers à la température recommandée
Évitez le lait non pasteurisé	Réduire le risque de listériose	Ne consommez pas de fromages crus ni de légumes non lavés.
Dans les régions où les helminthes sont endémiques	Vermifugation préventive après le premier trimestre	Suivez les programmes nationaux et les recommandations de votre médecin.

(Sources: FDA, CDC, OMS). [35]

Une courte liste de contrôle pour le médecin et le patient

1. Si une femme enceinte se plaint de diarrhée accompagnée de fièvre, de sang dans les selles ou d'une déshydratation sévère, prescrire des analyses de laboratoire urgentes, incluant un panel PCR et une culture selon les indications. [36]
2. En cas de suspicion de Giardia, effectuez un test antigénique ou PCR plutôt que de vous fier uniquement à la microscopie. [37]
3. Si l’infection à Clostridioides difficile est confirmée, suivre les protocoles, en faisant appel à un spécialiste des maladies infectieuses et en tenant compte des risques pendant la période périnatale. [38]
4. Dans les zones endémiques, envisager un déparasitage après le premier trimestre conformément au programme national et aux recommandations de l'OMS. [39]
5. Toujours comparer les résultats de laboratoire avec les observations cliniques; en cas de doute, répéter le prélèvement d’échantillon ou modifier la méthode de recherche. [40]